MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 5693

< Previous123456789101112Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020125	AC	3	6	2080037	2080042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_020125	ATA	2	6	2080061	2080066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_020125	A	6	6	2080074	2080079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_020125	ATA	2	6	2082900	2082905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_020125	A	6	6	2082905	2082910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_020125	TA	3	6	2082937	2082942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_020125	TTG	2	6	2082961	2082966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_020125	CGC	2	6	2082992	2082997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_020125	CAT	2	6	2083013	2083018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_020125	ATT	2	6	2083029	2083034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_020125	TGT	2	6	2083042	2083047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_020125	AAT	2	6	2083087	2083092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_020125	T	8	8	2083117	2083124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_020125	GCT	2	6	2083388	2083393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_020125	GTA	2	6	2083408	2083413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_020125	T	9	9	2083458	2083466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_020125	AAT	2	6	2083471	2083476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_020125	TC	3	6	2083505	2083510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_020125	TAT	2	6	2083566	2083571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_020125	A	7	7	2083613	2083619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_020125	AAAT	2	8	2083625	2083632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_020125	ATA	2	6	2083636	2083641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_020125	T	6	6	2083656	2083661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_020125	TTAAAA	2	12	2083717	2083728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_020125	TAA	2	6	2083800	2083805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_020125	ACT	2	6	2083826	2083831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_020125	T	6	6	2083831	2083836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_020125	AG	3	6	2083842	2083847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_020125	CTTT	2	8	2083862	2083869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_020125	T	6	6	2083867	2083872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_020125	A	7	7	2083890	2083896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_020125	A	6	6	2086532	2086537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_020125	AATTTT	2	12	2086569	2086580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_020125	ATT	2	6	2086612	2086617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_020125	TACT	2	8	2087034	2087041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5536	NC_020125	ATT	3	9	2087069	2087077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_020125	A	7	7	2087087	2087093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_020125	A	6	6	2088492	2088497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_020125	CGC	2	6	2090534	2090539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_020125	ATT	2	6	2090588	2090593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_020125	GCT	2	6	2095481	2095486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_020125	CTC	2	6	2095509	2095514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_020125	CTGTGG	2	12	2095543	2095554	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5544	NC_020125	GAG	2	6	2095691	2095696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_020125	T	6	6	2095702	2095707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_020125	TCC	2	6	2095751	2095756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_020125	TAG	2	6	2095814	2095819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_020125	T	7	7	2095952	2095958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020125	TA	3	6	2095965	2095970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020125	TAA	2	6	2095977	2095982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020125	ACTA	2	8	2095998	2096005	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_020125	AT	3	6	2096894	2096899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_020125	CAAT	2	8	2096944	2096951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_020125	ACC	2	6	2096959	2096964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_020125	A	6	6	2096980	2096985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_020125	TAA	2	6	2097004	2097009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_020125	AAAT	2	8	2097013	2097020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_020125	AT	3	6	2097019	2097024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_020125	AAT	3	9	2097031	2097039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_020125	A	6	6	2097080	2097085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_020125	ATA	2	6	2097088	2097093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_020125	TAA	2	6	2097106	2097111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_020125	ATA	2	6	2097135	2097140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_020125	T	6	6	2108983	2108988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_020125	ACA	2	6	2109750	2109755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_020125	A	6	6	2109759	2109764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_020125	AT	3	6	2109812	2109817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_020125	ATACAA	2	12	2109848	2109859	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5569	NC_020125	TTA	2	6	2109860	2109865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_020125	TCT	2	6	2112640	2112645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_020125	GA	3	6	2113575	2113580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_020125	TAT	2	6	2115583	2115588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_020125	TAC	2	6	2118098	2118103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_020125	ATTT	2	8	2118121	2118128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_020125	A	6	6	2118143	2118148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_020125	AAG	2	6	2118162	2118167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_020125	T	6	6	2118172	2118177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_020125	GTTT	2	8	2118746	2118753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_020125	T	7	7	2118797	2118803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_020125	T	8	8	2118809	2118816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_020125	T	6	6	2118830	2118835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_020125	A	6	6	2119456	2119461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_020125	TGCA	2	8	2119470	2119477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_020125	TTGT	2	8	2119478	2119485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_020125	AAT	2	6	2119492	2119497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_020125	T	8	8	2120945	2120952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_020125	TCA	2	6	2120955	2120960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_020125	TAAAA	2	10	2120966	2120975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_020125	AGTT	2	8	2120987	2120994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_020125	T	6	6	2121016	2121021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_020125	A	6	6	2121044	2121049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_020125	GAA	2	6	2121153	2121158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_020125	T	6	6	2121179	2121184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_020125	GATA	2	8	2121186	2121193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_020125	A	6	6	2122205	2122210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_020125	TAT	2	6	2124937	2124942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_020125	CTT	2	6	2124982	2124987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_020125	A	7	7	2124994	2125000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_020125	TAA	4	12	2128429	2128440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_020125	T	6	6	2128472	2128477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_020125	T	6	6	2128497	2128502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_020125	AT	3	6	2129698	2129703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_020125	T	6	6	2129773	2129778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_020125	A	7	7	2131647	2131653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_020125	CAC	2	6	2131666	2131671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_020125	A	6	6	2131673	2131678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_020125	AC	3	6	2131681	2131686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_020125	CAG	2	6	2131713	2131718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_020125	A	6	6	2131765	2131770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_020125	T	6	6	2131796	2131801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_020125	TAAA	2	8	2131844	2131851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_020125	A	6	6	2131853	2131858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_020125	TTAA	2	8	2131886	2131893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_020125	TTA	2	6	2131905	2131910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_020125	AAT	2	6	2131926	2131931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_020125	ATA	2	6	2133080	2133085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_020125	TTG	2	6	2133178	2133183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_020125	ATA	2	6	2133190	2133195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_020125	AAG	2	6	2133203	2133208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_020125	TAT	2	6	2133226	2133231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_020125	GACC	2	8	2133246	2133253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_020125	A	7	7	2134180	2134186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_020125	ATT	2	6	2134202	2134207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_020125	T	6	6	2137432	2137437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_020125	GTT	2	6	2137442	2137447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_020125	ACA	2	6	2139659	2139664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_020125	A	8	8	2139957	2139964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_020125	GAC	2	6	2139980	2139985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_020125	ATT	2	6	2141344	2141349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_020125	A	6	6	2147043	2147048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_020125	A	6	6	2147127	2147132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_020125	TATAT	2	10	2148795	2148804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_020125	TAA	2	6	2148806	2148811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_020125	TCT	3	9	2148828	2148836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5635	NC_020125	TCT	3	9	2148850	2148858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5636	NC_020125	CTT	2	6	2148859	2148864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5637	NC_020125	TCTTTT	2	12	2148889	2148900	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5638	NC_020125	T	6	6	2148924	2148929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5639	NC_020125	TAA	2	6	2148934	2148939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5640	NC_020125	T	6	6	2149249	2149254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5641	NC_020125	ACC	2	6	2150336	2150341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5642	NC_020125	T	6	6	2150356	2150361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5643	NC_020125	TAA	2	6	2151909	2151914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5644	NC_020125	ATT	3	9	2151925	2151933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5645	NC_020125	TAA	2	6	2151934	2151939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5646	NC_020125	TTAA	2	8	2151968	2151975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5647	NC_020125	A	7	7	2153356	2153362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5648	NC_020125	T	7	7	2153383	2153389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5649	NC_020125	A	6	6	2153402	2153407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5650	NC_020125	TA	4	8	2156045	2156052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5651	NC_020125	TGG	2	6	2156070	2156075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5652	NC_020125	CT	3	6	2156139	2156144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5653	NC_020125	AATA	2	8	2157259	2157266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_020125	AT	3	6	2157327	2157332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5655	NC_020125	A	6	6	2157353	2157358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5656	NC_020125	TAA	2	6	2158806	2158811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5657	NC_020125	A	6	6	2162250	2162255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5658	NC_020125	AAT	2	6	2162275	2162280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5659	NC_020125	AATA	2	8	2162311	2162318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5660	NC_020125	CAA	2	6	2162567	2162572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5661	NC_020125	TGT	3	9	2162638	2162646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5662	NC_020125	ATA	2	6	2162651	2162656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5663	NC_020125	TTGG	2	8	2162664	2162671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5664	NC_020125	TCA	2	6	2162711	2162716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5665	NC_020125	CAA	2	6	2162831	2162836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5666	NC_020125	CCA	2	6	2162905	2162910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5667	NC_020125	TCG	2	6	2162926	2162931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5668	NC_020125	TTC	2	6	2163040	2163045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5669	NC_020125	CTT	2	6	2163048	2163053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5670	NC_020125	TTG	2	6	2163054	2163059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5671	NC_020125	GTT	2	6	2163535	2163540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5672	NC_020125	TGT	3	9	2163580	2163588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5673	NC_020125	AAC	2	6	2163629	2163634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5674	NC_020125	TGT	2	6	2163697	2163702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5675	NC_020125	GTTTA	2	10	2163756	2163765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5676	NC_020125	ACT	2	6	2163790	2163795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5677	NC_020125	TGT	3	9	2163932	2163940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5678	NC_020125	TGT	2	6	2164011	2164016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5679	NC_020125	TGT	3	9	2164165	2164173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5680	NC_020125	TGT	2	6	2164244	2164249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5681	NC_020125	CAA	2	6	2164332	2164337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5682	NC_020125	TTA	2	6	2164350	2164355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5683	NC_020125	CAT	2	6	2164377	2164382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5684	NC_020125	A	7	7	2164414	2164420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5685	NC_020125	TATT	2	8	2164460	2164467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5686	NC_020125	GA	3	6	2164546	2164551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5687	NC_020125	CCTT	2	8	2164602	2164609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5688	NC_020125	AAGG	2	8	2164616	2164623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5689	NC_020125	TTTA	2	8	2164630	2164637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5690	NC_020125	TA	3	6	2165377	2165382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5691	NC_020125	TAG	2	6	2166190	2166195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5692	NC_020125	ATT	2	6	2166245	2166250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5693	NC_020125	TAG	2	6	2166307	2166312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous123456789101112Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.