MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 4336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020062	A	6	6	1420086	1420091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_020062	TAAA	2	8	1420093	1420100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_020062	CAA	2	6	1421477	1421482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_020062	GGA	2	6	1421497	1421502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_020062	GA	3	6	1421501	1421506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_020062	TCCAT	2	10	1422212	1422221	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3007	NC_020062	CT	3	6	1424714	1424719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_020062	CCT	2	6	1424799	1424804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_020062	AAATC	2	10	1428134	1428143	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3010	NC_020062	T	6	6	1428165	1428170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_020062	CCG	2	6	1428184	1428189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_020062	GTGC	2	8	1428190	1428197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_020062	TGA	2	6	1428212	1428217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_020062	CCGG	2	8	1428221	1428228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_020062	CGC	2	6	1429114	1429119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_020062	GCG	2	6	1429262	1429267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_020062	GTC	2	6	1429277	1429282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_020062	CGC	2	6	1429341	1429346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_020062	CAG	2	6	1430169	1430174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_020062	TCGC	2	8	1430243	1430250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_020062	CGGG	2	8	1432038	1432045	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_020062	GCG	2	6	1432098	1432103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_020062	TGCAA	2	10	1432825	1432834	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3024	NC_020062	G	6	6	1432855	1432860	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_020062	AGC	2	6	1432914	1432919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_020062	GGCG	2	8	1432923	1432930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_020062	GTC	2	6	1434472	1434477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_020062	GCAAA	2	10	1438910	1438919	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3029	NC_020062	ATC	3	9	1441556	1441564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_020062	GGC	2	6	1441593	1441598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_020062	GGC	2	6	1442827	1442832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_020062	CAG	2	6	1442853	1442858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_020062	CAA	2	6	1442865	1442870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_020062	A	6	6	1442903	1442908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_020062	TAA	2	6	1442987	1442992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_020062	GAA	2	6	1443020	1443025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_020062	GGA	2	6	1443292	1443297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_020062	AGATG	2	10	1444496	1444505	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3040	NC_020062	GA	3	6	1444640	1444645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_020062	CGG	2	6	1444699	1444704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_020062	GTC	2	6	1444726	1444731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_020062	CAAAT	2	10	1444733	1444742	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3044	NC_020062	AAT	2	6	1448182	1448187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3046	NC_020062	GATCG	2	10	1448233	1448242	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3047	NC_020062	CAT	2	6	1449376	1449381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3049	NC_020062	GGA	2	6	1449486	1449491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_020062	T	7	7	1449838	1449844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_020062	GGA	2	6	1450907	1450912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_020062	CCG	2	6	1450921	1450926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_020062	GAT	2	6	1452230	1452235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_020062	TAC	2	6	1452241	1452246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_020062	AGTT	2	8	1452251	1452258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3057	NC_020062	CGGCCG	2	12	1452773	1452784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_020062	TGG	2	6	1452800	1452805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3060	NC_020062	CGGC	2	8	1454386	1454393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_020062	TGC	2	6	1454412	1454417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_020062	CCG	2	6	1454446	1454451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_020062	TTG	2	6	1455533	1455538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3066	NC_020062	CA	3	6	1455639	1455644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3074	NC_020062	GATC	2	8	1457228	1457235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3078	NC_020062	GC	3	6	1461164	1461169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_020062	CCTT	2	8	1461275	1461282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3099	NC_020062	AAC	2	6	1469714	1469719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_020062	ATC	2	6	1471166	1471171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_020062	TGA	2	6	1471332	1471337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_020062	GC	3	6	1473555	1473560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_020062	GC	3	6	1473577	1473582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_020062	GCG	2	6	1474038	1474043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3108	NC_020062	ATTC	2	8	1476309	1476316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3111	NC_020062	TC	3	6	1477437	1477442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_020062	TGGAT	2	10	1477446	1477455	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_020062	AGCC	2	8	1477470	1477477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_020062	GCC	2	6	1477535	1477540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_020062	CCAG	2	8	1477686	1477693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3127	NC_020062	CTC	2	6	1486944	1486949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3129	NC_020062	AATT	2	8	1487011	1487018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_020062	GATT	2	8	1487024	1487031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_020062	GTT	2	6	1487085	1487090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_020062	ATA	2	6	1487996	1488001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_020062	ATG	2	6	1488053	1488058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_020062	TGATC	2	10	1489718	1489727	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3135	NC_020062	TCA	2	6	1489753	1489758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_020062	TTTC	2	8	1489871	1489878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3137	NC_020062	AAT	2	6	1492354	1492359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_020062	AAT	2	6	1492396	1492401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_020062	GAA	2	6	1492410	1492415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_020062	CGG	2	6	1492433	1492438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_020062	TC	3	6	1493570	1493575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3142	NC_020062	CCG	2	6	1494891	1494896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3143	NC_020062	TCCT	2	8	1496109	1496116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3144	NC_020062	GT	3	6	1496170	1496175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_020062	CTT	2	6	1496177	1496182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3146	NC_020062	CTC	3	9	1505631	1505639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3149	NC_020062	CTT	2	6	1505712	1505717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3150	NC_020062	CAT	2	6	1505732	1505737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3151	NC_020062	CAT	2	6	1505772	1505777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3152	NC_020062	ATC	2	6	1505865	1505870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3153	NC_020062	TCA	2	6	1505875	1505880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3154	NC_020062	CAT	2	6	1505929	1505934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3157	NC_020062	CTCC	2	8	1506025	1506032	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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3162	NC_020062	GTG	2	6	1506333	1506338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_020062	CTC	2	6	1506386	1506391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3164	NC_020062	GCG	2	6	1506396	1506401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3165	NC_020062	CCG	2	6	1506406	1506411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3169	NC_020062	CTGC	2	8	1506538	1506545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3173	NC_020062	CG	3	6	1508994	1508999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3184	NC_020062	GGA	2	6	1512187	1512192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3215	NC_020062	GAA	2	6	1526827	1526832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3230	NC_020062	T	6	6	1536644	1536649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3243	NC_020062	GGA	2	6	1542843	1542848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_020062	GAACG	2	10	1542861	1542870	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3245	NC_020062	GA	4	8	1542884	1542891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_020062	ATG	2	6	1545014	1545019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_020062	TCC	2	6	1545091	1545096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3248	NC_020062	CCG	2	6	1545110	1545115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3249	NC_020062	GAAAAT	2	12	1550425	1550436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_020062	AC	3	6	1550500	1550505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3251	NC_020062	GGA	2	6	1550513	1550518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_020062	ACGA	2	8	1550520	1550527	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3253	NC_020062	CGC	2	6	1555155	1555160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3254	NC_020062	TTC	2	6	1555165	1555170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_020062	CTC	2	6	1555178	1555183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3256	NC_020062	TTC	2	6	1557668	1557673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_020062	A	7	7	1565100	1565106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_020062	AT	3	6	1565124	1565129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_020062	TCG	2	6	1566561	1566566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_020062	CAT	2	6	1566614	1566619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_020062	GCC	2	6	1566724	1566729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3262	NC_020062	CGA	2	6	1566735	1566740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3263	NC_020062	GC	3	6	1566833	1566838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3264	NC_020062	GGT	2	6	1568091	1568096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3266	NC_020062	CGG	2	6	1568127	1568132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3267	NC_020062	GCC	4	12	1569577	1569588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3271	NC_020062	CTG	2	6	1571439	1571444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3293	NC_020062	GATT	2	8	1589472	1589479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3388	NC_020062	CCCAT	2	10	1634366	1634375	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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3393	NC_020062	CAC	2	6	1638362	1638367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3394	NC_020062	TTC	2	6	1638388	1638393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3395	NC_020062	TCT	2	6	1638413	1638418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3396	NC_020062	CGT	2	6	1640440	1640445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3397	NC_020062	GGA	2	6	1640447	1640452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3400	NC_020062	GAA	2	6	1642472	1642477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3401	NC_020062	GCCGG	2	10	1642519	1642528	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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3490	NC_020062	ACA	2	6	1684946	1684951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3494	NC_020062	AG	3	6	1686819	1686824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_020062	CCCCG	2	10	1686848	1686857	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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3498	NC_020062	CTCG	2	8	1687873	1687880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3499	NC_020062	CTT	2	6	1687889	1687894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3500	NC_020062	TCG	2	6	1689147	1689152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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