MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 2950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020061	TCGC	2	8	463749	463756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2502	NC_020061	CTG	2	6	463757	463762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_020061	GCG	2	6	463868	463873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_020061	TCA	2	6	463894	463899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_020061	CCG	2	6	463927	463932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_020061	CAA	2	6	463960	463965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_020061	TA	3	6	463968	463973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020061	GAA	2	6	463987	463992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_020061	AGGA	2	8	465086	465093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_020061	AAT	2	6	465112	465117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_020061	AGC	2	6	466947	466952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_020061	CCTGG	2	10	467036	467045	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2513	NC_020061	GTC	2	6	467084	467089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_020061	CGA	2	6	467100	467105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_020061	GCC	2	6	467141	467146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2516	NC_020061	ATG	2	6	467205	467210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_020061	CCCG	2	8	467275	467282	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2518	NC_020061	CAG	2	6	468943	468948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_020061	TGG	2	6	468973	468978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_020061	CGG	2	6	469092	469097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_020061	CAT	2	6	469104	469109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_020061	CGA	2	6	469250	469255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_020061	GGTCG	2	10	469313	469322	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2524	NC_020061	TCCC	2	8	469334	469341	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2525	NC_020061	AGT	2	6	469367	469372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020061	GAG	2	6	469393	469398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_020061	ATG	2	6	469403	469408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_020061	TGG	2	6	469467	469472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_020061	CTT	2	6	469478	469483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_020061	ACCA	2	8	469519	469526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2531	NC_020061	TC	3	6	469634	469639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2532	NC_020061	TCG	2	6	470151	470156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_020061	ATT	2	6	470484	470489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_020061	GAT	2	6	470490	470495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_020061	GGCG	2	8	470528	470535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2536	NC_020061	ATC	2	6	470599	470604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_020061	CGGC	3	12	470639	470650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2538	NC_020061	GCAT	2	8	471890	471897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2539	NC_020061	GAG	2	6	471912	471917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_020061	GCA	2	6	472029	472034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_020061	TGCC	2	8	472086	472093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2542	NC_020061	GACG	2	8	472099	472106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2543	NC_020061	GAA	2	6	472201	472206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_020061	GGA	2	6	472234	472239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_020061	GCG	2	6	472306	472311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_020061	TCG	2	6	472359	472364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_020061	ATT	2	6	472365	472370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_020061	AAG	2	6	472376	472381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_020061	TCG	2	6	472389	472394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_020061	CGG	2	6	472534	472539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_020061	CGG	2	6	472617	472622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_020061	GGC	2	6	472660	472665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_020061	AAC	2	6	472678	472683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_020061	CCT	2	6	472692	472697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2555	NC_020061	CAA	2	6	476075	476080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_020061	CGGCGT	2	12	476138	476149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_020061	CGGC	2	8	476228	476235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2558	NC_020061	CTT	2	6	476249	476254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_020061	GGA	2	6	476261	476266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_020061	CGC	2	6	476273	476278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2561	NC_020061	CGAC	2	8	476431	476438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2562	NC_020061	CAG	2	6	476493	476498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_020061	TCT	2	6	476533	476538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_020061	CCA	2	6	476561	476566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_020061	CGT	2	6	476568	476573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_020061	CGG	2	6	476576	476581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_020061	ATC	2	6	476700	476705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_020061	CGG	2	6	476828	476833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_020061	TCA	2	6	476860	476865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2571	NC_020061	CCG	2	6	476890	476895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2572	NC_020061	GCC	2	6	476901	476906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2573	NC_020061	AC	3	6	477865	477870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2576	NC_020061	CT	3	6	478014	478019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2577	NC_020061	GAA	2	6	478049	478054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_020061	ATTC	2	8	478071	478078	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2579	NC_020061	TTG	2	6	478102	478107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_020061	GGA	2	6	478125	478130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_020061	TCGT	2	8	478162	478169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2582	NC_020061	GTGGA	2	10	478190	478199	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_020061	GCA	2	6	478519	478524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_020061	CA	3	6	478587	478592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2585	NC_020061	CGG	2	6	479494	479499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2587	NC_020061	CCT	2	6	479509	479514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2588	NC_020061	GAG	2	6	479972	479977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_020061	GCCG	2	8	480005	480012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2590	NC_020061	TGA	2	6	480013	480018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_020061	TGA	2	6	480952	480957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_020061	GAG	2	6	480981	480986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_020061	GC	3	6	480993	480998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2598	NC_020061	CG	3	6	481264	481269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_020061	TGC	2	6	481314	481319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2601	NC_020061	GCA	2	6	481462	481467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_020061	CGT	2	6	481506	481511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_020061	T	7	7	481511	481517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_020061	CGC	2	6	481572	481577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2605	NC_020061	CCTT	2	8	481601	481608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2606	NC_020061	ACC	2	6	482841	482846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_020061	CG	3	6	482883	482888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2608	NC_020061	TGCC	2	8	482913	482920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2609	NC_020061	GCA	2	6	482990	482995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2611	NC_020061	GATCG	2	10	483126	483135	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2612	NC_020061	TC	3	6	483147	483152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_020061	CCA	2	6	483251	483256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_020061	GCG	2	6	483296	483301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_020061	TGC	2	6	483311	483316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_020061	TGA	2	6	483383	483388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_020061	TCG	2	6	483464	483469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_020061	CAAGG	2	10	483477	483486	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2619	NC_020061	GGC	2	6	483493	483498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_020061	CCG	2	6	483502	483507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2622	NC_020061	GC	3	6	483556	483561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_020061	CGA	2	6	483660	483665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2630	NC_020061	CAG	2	6	484113	484118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2634	NC_020061	GC	3	6	484867	484872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2635	NC_020061	GGC	2	6	484899	484904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2900	NC_020061	TCC	2	6	519815	519820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2901	NC_020061	TC	3	6	519840	519845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2902	NC_020061	CGGG	2	8	519880	519887	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2903	NC_020061	CAA	2	6	519969	519974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2904	NC_020061	CGA	2	6	520007	520012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2905	NC_020061	CGGG	2	8	520044	520051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2906	NC_020061	AGA	2	6	520242	520247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2907	NC_020061	GCCTCA	2	12	520249	520260	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2908	NC_020061	TGA	2	6	520350	520355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2909	NC_020061	ACAA	2	8	520392	520399	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2910	NC_020061	AAG	2	6	520603	520608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2911	NC_020061	GAT	2	6	521277	521282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2912	NC_020061	GCT	2	6	521294	521299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2913	NC_020061	AGC	2	6	521664	521669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2914	NC_020061	GCC	2	6	521701	521706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2915	NC_020061	CGG	2	6	522030	522035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2916	NC_020061	TCGG	2	8	522350	522357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2917	NC_020061	GAT	2	6	522536	522541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2918	NC_020061	T	7	7	522568	522574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2919	NC_020061	GCG	2	6	522907	522912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2920	NC_020061	CTG	2	6	523578	523583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2921	NC_020061	TCT	2	6	523612	523617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2922	NC_020061	ACG	2	6	523736	523741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2923	NC_020061	CGG	2	6	523765	523770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2924	NC_020061	ACT	2	6	526355	526360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2925	NC_020061	GAT	2	6	526397	526402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2926	NC_020061	GA	3	6	526527	526532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2927	NC_020061	CCG	2	6	526536	526541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2928	NC_020061	GAG	2	6	531573	531578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2929	NC_020061	GCAT	2	8	532243	532250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2930	NC_020061	ATC	2	6	532252	532257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2931	NC_020061	TCG	2	6	532259	532264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2932	NC_020061	TCC	2	6	532365	532370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2933	NC_020061	GA	3	6	532697	532702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2934	NC_020061	CTT	2	6	532807	532812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2935	NC_020061	ACC	2	6	534005	534010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2936	NC_020061	GTC	2	6	535239	535244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2937	NC_020061	TGT	2	6	535348	535353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2938	NC_020061	TCT	2	6	535475	535480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2939	NC_020061	CG	4	8	545550	545557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2940	NC_020061	CTGAT	2	10	545576	545585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2941	NC_020061	AACG	2	8	545635	545642	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2942	NC_020061	GGC	2	6	545691	545696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2943	NC_020061	TTA	2	6	545736	545741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2944	NC_020061	ATA	2	6	545777	545782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2945	NC_020061	AACG	2	8	547061	547068	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2946	NC_020061	AGC	2	6	547086	547091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2947	NC_020061	GCT	2	6	547097	547102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2948	NC_020061	GGCG	2	8	548210	548217	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2949	NC_020061	GA	3	6	548242	548247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2950	NC_020061	A	6	6	548247	548252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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