MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 2950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020061	CG	4	8	277789	277796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_020061	GCC	2	6	277825	277830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_020061	CAT	2	6	277917	277922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_020061	CGG	2	6	277969	277974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_020061	CGG	2	6	277984	277989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_020061	TGA	2	6	278030	278035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020061	GC	3	6	278044	278049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_020061	CAA	2	6	278101	278106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_020061	ATC	2	6	278114	278119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_020061	CGA	2	6	278149	278154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_020061	GCC	2	6	278162	278167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_020061	GCC	2	6	278185	278190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_020061	GCC	2	6	278198	278203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_020061	CGA	2	6	278230	278235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_020061	GGC	2	6	278283	278288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_020061	CGC	2	6	278416	278421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_020061	CCG	2	6	278468	278473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_020061	CTC	2	6	278477	278482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_020061	TAG	2	6	278495	278500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020061	TGC	2	6	278544	278549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_020061	GCAA	2	8	278560	278567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_020061	GT	3	6	278604	278609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020061	TGA	2	6	278665	278670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020061	TCCG	2	8	278745	278752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_020061	CCTG	2	8	278968	278975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_020061	GGC	2	6	279002	279007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_020061	TCG	2	6	279092	279097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_020061	GCG	2	6	279116	279121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_020061	ATC	2	6	279274	279279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_020061	TTC	2	6	279473	279478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_020061	AGC	2	6	281594	281599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_020061	GCG	2	6	281613	281618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_020061	CTCC	2	8	281624	281631	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1534	NC_020061	ATC	2	6	281644	281649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_020061	CGC	2	6	281661	281666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_020061	AGA	2	6	281683	281688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020061	GAT	2	6	282758	282763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020061	TCC	2	6	282770	282775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_020061	GGA	2	6	282914	282919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020061	CTC	2	6	282945	282950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_020061	ATG	2	6	283195	283200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020061	GTC	2	6	283510	283515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_020061	AG	3	6	283548	283553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020061	GAT	2	6	283686	283691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020061	CGGC	2	8	284713	284720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_020061	GCC	2	6	284789	284794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_020061	CGC	2	6	284889	284894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_020061	ATG	2	6	284923	284928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020061	AG	3	6	285200	285205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020061	CGG	2	6	285255	285260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_020061	GCG	2	6	285261	285266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_020061	GAAG	2	8	285305	285312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020061	GACG	2	8	286223	286230	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_020061	GCCTG	2	10	287820	287829	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1555	NC_020061	AGGCT	2	10	287845	287854	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1556	NC_020061	CGC	2	6	287857	287862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_020061	GCC	2	6	287902	287907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_020061	CCG	3	9	289501	289509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_020061	GCTCG	2	10	294256	294265	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1560	NC_020061	TGG	2	6	294267	294272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020061	TTG	2	6	294275	294280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020061	ATC	2	6	294337	294342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_020061	GTT	2	6	294352	294357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020061	AAC	2	6	294360	294365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_020061	ACG	2	6	294369	294374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_020061	GCC	2	6	294482	294487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_020061	CGA	3	9	294489	294497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_020061	TTG	2	6	294541	294546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020061	GCCC	2	8	294555	294562	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1570	NC_020061	CGT	2	6	294566	294571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_020061	GA	3	6	294602	294607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020061	CTT	2	6	295709	295714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_020061	CAA	2	6	295751	295756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_020061	A	6	6	295776	295781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020061	TCC	2	6	295782	295787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_020061	CGC	2	6	295836	295841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_020061	CGAC	2	8	296625	296632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_020061	CAA	2	6	296649	296654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_020061	TTG	2	6	296683	296688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020061	GGAG	2	8	296746	296753	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020061	CTC	2	6	296758	296763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_020061	CA	3	6	296790	296795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_020061	GCA	2	6	297865	297870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_020061	GAA	2	6	297891	297896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020061	TGT	2	6	297956	297961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020061	CT	3	6	298019	298024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_020061	TCTT	2	8	298025	298032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_020061	CATA	2	8	298043	298050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_020061	CACC	2	8	298981	298988	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1590	NC_020061	TGC	2	6	299064	299069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_020061	A	6	6	299166	299171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020061	GTTC	2	8	300164	300171	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_020061	GCC	2	6	300188	300193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_020061	CGA	2	6	300217	300222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_020061	TAGG	2	8	300252	300259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_020061	TGG	2	6	300365	300370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_020061	AAT	2	6	300392	300397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_020061	G	6	6	301716	301721	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_020061	TTG	2	6	301856	301861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020061	CGT	2	6	303620	303625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_020061	GGCGG	2	10	303658	303667	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1602	NC_020061	GACG	2	8	303720	303727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_020061	GCA	2	6	303731	303736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_020061	CAG	2	6	303749	303754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_020061	ATT	2	6	303770	303775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020061	CCA	2	6	303805	303810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_020061	GC	3	6	303878	303883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_020061	ATA	2	6	303975	303980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020061	CT	3	6	303989	303994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_020061	CGG	2	6	304098	304103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_020061	T	6	6	304128	304133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020061	AGCG	2	8	304148	304155	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_020061	GC	3	6	304183	304188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_020061	TTC	2	6	304212	304217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_020061	GCC	2	6	304224	304229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_020061	TGC	2	6	304300	304305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_020061	TTC	2	6	304377	304382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_020061	GGCT	2	8	304396	304403	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_020061	GCC	2	6	304465	304470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_020061	CGAT	2	8	304500	304507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_020061	ACG	2	6	304520	304525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_020061	CTG	3	9	304553	304561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_020061	GTG	2	6	304673	304678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_020061	GC	3	6	304723	304728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_020061	CGC	3	9	304770	304778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_020061	GCA	2	6	304909	304914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_020061	TCT	2	6	304939	304944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_020061	GCC	2	6	307078	307083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_020061	TGCT	2	8	307685	307692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_020061	GTTT	2	8	309009	309016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_020061	GGA	2	6	309033	309038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020061	GATC	2	8	309042	309049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_020061	CCA	2	6	309086	309091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_020061	GCTG	2	8	309105	309112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_020061	ATA	2	6	309170	309175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1644	NC_020061	TGA	2	6	309731	309736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1895	NC_020061	TCACA	2	10	341711	341720	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1896	NC_020061	GTT	2	6	341786	341791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1897	NC_020061	ATGG	2	8	341819	341826	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1898	NC_020061	CGGA	2	8	341841	341848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1899	NC_020061	A	6	6	343749	343754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1900	NC_020061	ACG	2	6	343841	343846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1902	NC_020061	TTC	2	6	345252	345257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1903	NC_020061	AGGT	2	8	345266	345273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1904	NC_020061	GCT	2	6	345834	345839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1905	NC_020061	CAA	2	6	345845	345850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1906	NC_020061	GAC	2	6	345861	345866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1908	NC_020061	GGAG	2	8	347083	347090	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1909	NC_020061	GCC	2	6	349105	349110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1910	NC_020061	TCA	2	6	349190	349195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1912	NC_020061	GAAA	2	8	351218	351225	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_020061	TTC	2	6	352411	352416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_020061	ATC	2	6	352581	352586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1917	NC_020061	GC	3	6	352672	352677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1926	NC_020061	GGC	2	6	355720	355725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1928	NC_020061	ACC	2	6	357173	357178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1929	NC_020061	AGG	2	6	358852	358857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1932	NC_020061	AGC	2	6	360376	360381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1934	NC_020061	GCG	2	6	360536	360541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1935	NC_020061	G	6	6	360546	360551	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_020061	ATG	3	9	360606	360614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1938	NC_020061	GCG	2	6	360733	360738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1941	NC_020061	ACACC	2	10	360999	361008	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1942	NC_020061	GGC	2	6	361030	361035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1943	NC_020061	GCC	2	6	361104	361109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1944	NC_020061	TCG	2	6	361118	361123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1950	NC_020061	CTT	2	6	361582	361587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1951	NC_020061	CTG	2	6	361617	361622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1952	NC_020061	CAT	2	6	361645	361650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1955	NC_020061	TTC	2	6	361706	361711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1957	NC_020061	T	6	6	362242	362247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_020061	CAT	2	6	362286	362291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1959	NC_020061	GCT	2	6	362353	362358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1961	NC_020061	CG	3	6	362502	362507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1962	NC_020061	AAACG	2	10	362510	362519	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1963	NC_020061	GAG	2	6	362524	362529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1964	NC_020061	TC	3	6	362653	362658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1965	NC_020061	GC	3	6	362687	362692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1966	NC_020061	CCTT	2	8	362697	362704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1967	NC_020061	ATC	2	6	362744	362749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1975	NC_020061	TGCC	2	8	363040	363047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1976	NC_020061	GTT	2	6	363062	363067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1977	NC_020061	GC	3	6	363086	363091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1978	NC_020061	ACAG	2	8	363172	363179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1979	NC_020061	CCT	2	6	363193	363198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1980	NC_020061	GCG	2	6	363199	363204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1982	NC_020061	TGG	2	6	363252	363257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1987	NC_020061	GTG	2	6	363918	363923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1992	NC_020061	GCA	2	6	366082	366087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1993	NC_020061	TTG	2	6	366135	366140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1998	NC_020061	TC	3	6	366321	366326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1999	NC_020061	GGC	2	6	366327	366332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2000	NC_020061	CAG	2	6	366372	366377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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