MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_019678	GTA	2	6	8638115	8638120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43503	NC_019678	T	6	6	8638130	8638135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43504	NC_019678	ATT	2	6	8638178	8638183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43505	NC_019678	AT	4	8	8638204	8638211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43506	NC_019678	TAGC	2	8	8638221	8638228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43507	NC_019678	GAA	2	6	8638273	8638278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43508	NC_019678	CTTTT	2	10	8638326	8638335	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43509	NC_019678	TAGA	2	8	8638414	8638421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43510	NC_019678	GA	3	6	8638453	8638458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43511	NC_019678	GTT	2	6	8638480	8638485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43512	NC_019678	T	7	7	8638484	8638490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43513	NC_019678	TCT	2	6	8638499	8638504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43514	NC_019678	GAC	2	6	8638519	8638524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43515	NC_019678	T	6	6	8638526	8638531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43516	NC_019678	T	6	6	8638548	8638553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43517	NC_019678	T	6	6	8638580	8638585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43518	NC_019678	T	6	6	8638627	8638632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43519	NC_019678	CTTG	2	8	8638644	8638651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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43523	NC_019678	TCT	2	6	8638782	8638787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43533	NC_019678	AAT	2	6	8639348	8639353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43536	NC_019678	TAA	2	6	8639456	8639461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43537	NC_019678	ATA	2	6	8639465	8639470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43540	NC_019678	TAA	2	6	8639500	8639505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43542	NC_019678	TGT	2	6	8639540	8639545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43543	NC_019678	ATTT	2	8	8639574	8639581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43544	NC_019678	A	7	7	8639633	8639639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43545	NC_019678	ACTT	2	8	8639657	8639664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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43550	NC_019678	TAAAA	2	10	8639890	8639899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43551	NC_019678	AAT	2	6	8639910	8639915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43552	NC_019678	ATT	2	6	8639930	8639935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43557	NC_019678	TAT	2	6	8640080	8640085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43558	NC_019678	TAA	2	6	8640371	8640376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43561	NC_019678	ATT	2	6	8640485	8640490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43564	NC_019678	T	6	6	8640710	8640715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43565	NC_019678	TTAGCT	2	12	8640733	8640744	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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43577	NC_019678	T	8	8	8645513	8645520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43579	NC_019678	A	7	7	8645554	8645560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43580	NC_019678	AATT	2	8	8645579	8645586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43587	NC_019678	AGA	2	6	8646481	8646486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43588	NC_019678	TAGTA	2	10	8646506	8646515	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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43592	NC_019678	TTTA	2	8	8649344	8649351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43594	NC_019678	T	6	6	8649388	8649393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43596	NC_019678	AATC	2	8	8649530	8649537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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43599	NC_019678	ATT	2	6	8649618	8649623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43601	NC_019678	GAT	2	6	8649684	8649689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43603	NC_019678	AATT	2	8	8650170	8650177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43604	NC_019678	TAAATT	2	12	8650188	8650199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43605	NC_019678	TGC	2	6	8650222	8650227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43608	NC_019678	TAC	2	6	8650320	8650325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43611	NC_019678	AG	3	6	8650461	8650466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43612	NC_019678	A	6	6	8650468	8650473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43613	NC_019678	TTA	2	6	8650523	8650528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43614	NC_019678	AGC	2	6	8650542	8650547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43615	NC_019678	A	6	6	8650980	8650985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43617	NC_019678	AGCAA	2	10	8651065	8651074	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43618	NC_019678	GCAAT	2	10	8651098	8651107	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43619	NC_019678	TCT	2	6	8651109	8651114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43622	NC_019678	TAT	2	6	8651233	8651238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43623	NC_019678	AT	3	6	8651336	8651341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43624	NC_019678	TAAG	2	8	8651479	8651486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43625	NC_019678	T	6	6	8651503	8651508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43626	NC_019678	TAAA	2	8	8651532	8651539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43627	NC_019678	TTC	2	6	8651544	8651549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.