MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_019678	CTAC	2	8	8135234	8135241	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41002	NC_019678	GCT	2	6	8135309	8135314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41003	NC_019678	GCAA	2	8	8135361	8135368	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41004	NC_019678	CTA	2	6	8135401	8135406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41005	NC_019678	TTTTC	2	10	8135422	8135431	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41006	NC_019678	CTA	2	6	8135438	8135443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41007	NC_019678	TA	3	6	8135480	8135485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41008	NC_019678	CAG	2	6	8135488	8135493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41009	NC_019678	GCTT	2	8	8135536	8135543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41010	NC_019678	TCG	2	6	8135562	8135567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41011	NC_019678	T	6	6	8135661	8135666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41012	NC_019678	AAT	2	6	8135821	8135826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41013	NC_019678	T	7	7	8135854	8135860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41014	NC_019678	ATT	2	6	8135873	8135878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41015	NC_019678	TGG	2	6	8135879	8135884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41016	NC_019678	AAT	2	6	8135959	8135964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41017	NC_019678	ATT	2	6	8135998	8136003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41018	NC_019678	ACC	2	6	8136062	8136067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41019	NC_019678	TAAT	2	8	8136102	8136109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41020	NC_019678	TAAT	2	8	8136115	8136122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41021	NC_019678	TAAT	2	8	8136134	8136141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41022	NC_019678	ATT	2	6	8136171	8136176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41023	NC_019678	TCA	2	6	8136211	8136216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41024	NC_019678	AGG	2	6	8136266	8136271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41025	NC_019678	TCA	2	6	8136323	8136328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41026	NC_019678	GT	3	6	8136409	8136414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41027	NC_019678	GCTG	2	8	8136545	8136552	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41028	NC_019678	GTA	2	6	8136571	8136576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41029	NC_019678	GT	3	6	8136578	8136583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41030	NC_019678	ATG	2	6	8136603	8136608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41031	NC_019678	TCC	2	6	8136629	8136634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41032	NC_019678	CACGA	2	10	8136729	8136738	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41033	NC_019678	GAC	2	6	8136742	8136747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41034	NC_019678	CAC	2	6	8136755	8136760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41035	NC_019678	TTC	2	6	8136830	8136835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41036	NC_019678	TGCG	2	8	8136908	8136915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41037	NC_019678	ACT	2	6	8137005	8137010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41038	NC_019678	TAG	2	6	8137068	8137073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41039	NC_019678	TTC	2	6	8137093	8137098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41040	NC_019678	CAG	2	6	8137205	8137210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41041	NC_019678	ACC	2	6	8137220	8137225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41042	NC_019678	ATT	2	6	8137245	8137250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41043	NC_019678	TCC	2	6	8137267	8137272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41044	NC_019678	GCT	2	6	8137284	8137289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41045	NC_019678	TCC	2	6	8137370	8137375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41046	NC_019678	CTG	2	6	8137427	8137432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41047	NC_019678	ATC	2	6	8137477	8137482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41048	NC_019678	TCG	2	6	8137502	8137507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41049	NC_019678	TGT	2	6	8137615	8137620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41050	NC_019678	CGC	2	6	8137707	8137712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41051	NC_019678	ATA	2	6	8137770	8137775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41052	NC_019678	TTACT	2	10	8137845	8137854	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41053	NC_019678	CAAA	2	8	8137885	8137892	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41054	NC_019678	TA	3	6	8137893	8137898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41055	NC_019678	TGAAG	2	10	8137920	8137929	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41056	NC_019678	TC	5	10	8137942	8137951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41057	NC_019678	GA	3	6	8137972	8137977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41058	NC_019678	AT	3	6	8137978	8137983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41059	NC_019678	T	6	6	8137996	8138001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41060	NC_019678	T	6	6	8138007	8138012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41061	NC_019678	A	6	6	8138014	8138019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41062	NC_019678	T	6	6	8138021	8138026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41063	NC_019678	ATT	2	6	8138166	8138171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41064	NC_019678	AGA	2	6	8138177	8138182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41065	NC_019678	TCT	2	6	8138193	8138198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41066	NC_019678	CAA	2	6	8138217	8138222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41067	NC_019678	TTG	2	6	8138233	8138238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41068	NC_019678	TTGAA	2	10	8139143	8139152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41069	NC_019678	TA	3	6	8139180	8139185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41070	NC_019678	AATT	2	8	8139242	8139249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41071	NC_019678	AAT	2	6	8139303	8139308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41072	NC_019678	TA	3	6	8139836	8139841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41073	NC_019678	GGGAA	2	10	8139872	8139881	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
41074	NC_019678	TTA	2	6	8139888	8139893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41075	NC_019678	TTG	2	6	8142286	8142291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41077	NC_019678	C	7	7	8142420	8142426	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41078	NC_019678	AAAG	2	8	8142653	8142660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41079	NC_019678	GTT	2	6	8142740	8142745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41080	NC_019678	ATTT	2	8	8142760	8142767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41081	NC_019678	T	6	6	8142765	8142770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41082	NC_019678	CTT	2	6	8142775	8142780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41083	NC_019678	GCTTT	2	10	8142881	8142890	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41084	NC_019678	TTAAA	2	10	8143006	8143015	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41085	NC_019678	ATC	2	6	8144229	8144234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41087	NC_019678	TTA	2	6	8144324	8144329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41088	NC_019678	CCA	2	6	8144337	8144342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41089	NC_019678	GAT	2	6	8145371	8145376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41090	NC_019678	AAT	2	6	8147325	8147330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41091	NC_019678	T	6	6	8147330	8147335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41092	NC_019678	TA	5	10	8147394	8147403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41093	NC_019678	TCA	2	6	8147450	8147455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41094	NC_019678	GCTT	2	8	8147491	8147498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41095	NC_019678	TA	3	6	8147506	8147511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41096	NC_019678	AATTA	2	10	8147561	8147570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41097	NC_019678	CAG	2	6	8147587	8147592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41099	NC_019678	T	7	7	8147633	8147639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41100	NC_019678	AAT	2	6	8147665	8147670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41101	NC_019678	TA	6	12	8147691	8147702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41102	NC_019678	TCAT	2	8	8147711	8147718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41103	NC_019678	GAG	2	6	8147818	8147823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41104	NC_019678	TTG	2	6	8147996	8148001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41105	NC_019678	CTT	2	6	8148299	8148304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41106	NC_019678	TATT	2	8	8149311	8149318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41107	NC_019678	AAT	2	6	8149408	8149413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41108	NC_019678	CAA	2	6	8149415	8149420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41109	NC_019678	ACA	2	6	8149460	8149465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41110	NC_019678	GTT	2	6	8149468	8149473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41111	NC_019678	T	7	7	8149472	8149478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41112	NC_019678	AATT	2	8	8149486	8149493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41113	NC_019678	A	6	6	8149557	8149562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41114	NC_019678	AAAT	2	8	8149587	8149594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41115	NC_019678	ATT	2	6	8149709	8149714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41116	NC_019678	GAT	2	6	8149757	8149762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41117	NC_019678	A	7	7	8149768	8149774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41118	NC_019678	TTGT	2	8	8149777	8149784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41119	NC_019678	AT	3	6	8149791	8149796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41120	NC_019678	CAAT	2	8	8149874	8149881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41121	NC_019678	AT	4	8	8149880	8149887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41122	NC_019678	TTG	2	6	8150583	8150588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41123	NC_019678	T	6	6	8150655	8150660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41124	NC_019678	TA	3	6	8150693	8150698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41125	NC_019678	TTTGA	2	10	8150737	8150746	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41126	NC_019678	TA	4	8	8150762	8150769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41127	NC_019678	CAA	2	6	8150897	8150902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41128	NC_019678	T	6	6	8150941	8150946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41129	NC_019678	GAA	2	6	8150947	8150952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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