MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_019678	AGC	2	6	5002857	5002862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25502	NC_019678	CAAAAT	2	12	5002904	5002915	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25503	NC_019678	TTAA	2	8	5002950	5002957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25504	NC_019678	AAATT	3	15	5003013	5003027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25505	NC_019678	CTT	2	6	5003046	5003051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25506	NC_019678	TGG	2	6	5003053	5003058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25507	NC_019678	ATA	2	6	5003064	5003069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25508	NC_019678	TAT	2	6	5003079	5003084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25509	NC_019678	CAA	2	6	5003086	5003091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25510	NC_019678	TTA	2	6	5003113	5003118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25511	NC_019678	CG	3	6	5003137	5003142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25512	NC_019678	ATTTT	2	10	5003178	5003187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25513	NC_019678	T	6	6	5003184	5003189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25514	NC_019678	TTA	2	6	5003199	5003204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25515	NC_019678	TGA	2	6	5003205	5003210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25516	NC_019678	TAT	2	6	5003219	5003224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25517	NC_019678	ATT	2	6	5003245	5003250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25518	NC_019678	ATATTA	2	12	5003265	5003276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25519	NC_019678	TAT	2	6	5003309	5003314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25520	NC_019678	TTTC	2	8	5004481	5004488	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25521	NC_019678	GTT	2	6	5006097	5006102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25522	NC_019678	GTT	2	6	5006104	5006109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25523	NC_019678	TGG	2	6	5006128	5006133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25524	NC_019678	CTAT	2	8	5006162	5006169	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25525	NC_019678	CTA	2	6	5006201	5006206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25526	NC_019678	ATC	2	6	5007084	5007089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25527	NC_019678	CGATTA	2	12	5007091	5007102	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25528	NC_019678	ATTCTA	2	12	5007187	5007198	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25529	NC_019678	CT	3	6	5008701	5008706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25530	NC_019678	GTTTA	2	10	5008741	5008750	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25531	NC_019678	TTAAA	3	15	5008751	5008765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25532	NC_019678	T	6	6	5008770	5008775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25533	NC_019678	TGCTT	2	10	5008787	5008796	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25534	NC_019678	ATT	2	6	5009755	5009760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25535	NC_019678	TCT	2	6	5009775	5009780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25536	NC_019678	ATT	2	6	5009845	5009850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25537	NC_019678	A	8	8	5009852	5009859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25538	NC_019678	T	6	6	5009880	5009885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25539	NC_019678	ACAAT	2	10	5009916	5009925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25540	NC_019678	TA	3	6	5009960	5009965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25541	NC_019678	GAA	2	6	5009975	5009980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25542	NC_019678	AATT	2	8	5010035	5010042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25543	NC_019678	A	8	8	5010090	5010097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25544	NC_019678	GAA	2	6	5010098	5010103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25545	NC_019678	CTT	2	6	5010115	5010120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25546	NC_019678	TAG	2	6	5010448	5010453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25547	NC_019678	TAG	2	6	5010455	5010460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25548	NC_019678	TAG	2	6	5010462	5010467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25549	NC_019678	TAG	2	6	5010476	5010481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25550	NC_019678	GGC	2	6	5010490	5010495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25551	NC_019678	TA	3	6	5010546	5010551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25552	NC_019678	AGG	2	6	5010554	5010559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25553	NC_019678	A	7	7	5010612	5010618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25554	NC_019678	ATA	2	6	5010651	5010656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25555	NC_019678	A	7	7	5011212	5011218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25556	NC_019678	ACT	2	6	5011266	5011271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25557	NC_019678	A	6	6	5011311	5011316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25558	NC_019678	TAA	2	6	5011351	5011356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25559	NC_019678	GAA	3	9	5011842	5011850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25560	NC_019678	A	6	6	5011877	5011882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25561	NC_019678	T	6	6	5011947	5011952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25562	NC_019678	T	6	6	5012372	5012377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25563	NC_019678	ATT	2	6	5012421	5012426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25564	NC_019678	TAT	2	6	5012433	5012438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25565	NC_019678	TTG	2	6	5012453	5012458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25566	NC_019678	TACA	2	8	5012468	5012475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25567	NC_019678	A	6	6	5012487	5012492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25568	NC_019678	T	6	6	5012507	5012512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25569	NC_019678	AT	3	6	5012516	5012521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25570	NC_019678	TGT	2	6	5012530	5012535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25571	NC_019678	TA	3	6	5012542	5012547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25572	NC_019678	TAGA	2	8	5012554	5012561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25573	NC_019678	TG	3	6	5012730	5012735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25574	NC_019678	AT	3	6	5012737	5012742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25575	NC_019678	GAAA	2	8	5015331	5015338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25576	NC_019678	A	9	9	5015367	5015375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25577	NC_019678	TA	4	8	5015376	5015383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25578	NC_019678	TGCC	2	8	5015467	5015474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25579	NC_019678	CTG	2	6	5015523	5015528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25580	NC_019678	ATG	2	6	5015531	5015536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25581	NC_019678	CTT	2	6	5015618	5015623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25582	NC_019678	A	6	6	5015672	5015677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25583	NC_019678	ATC	2	6	5015691	5015696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25584	NC_019678	TGC	2	6	5015718	5015723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25585	NC_019678	TAT	2	6	5015742	5015747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25586	NC_019678	ACTT	2	8	5015764	5015771	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25587	NC_019678	GTAA	2	8	5015772	5015779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25588	NC_019678	TA	3	6	5015786	5015791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25589	NC_019678	TAT	2	6	5015860	5015865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25591	NC_019678	TAG	2	6	5015879	5015884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25592	NC_019678	TAGA	2	8	5015905	5015912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25593	NC_019678	TAAA	2	8	5015914	5015921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25594	NC_019678	ATT	2	6	5015982	5015987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25595	NC_019678	GCT	2	6	5015988	5015993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25596	NC_019678	ATTAA	2	10	5016025	5016034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25598	NC_019678	TCC	2	6	5016089	5016094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25599	NC_019678	GTT	2	6	5016140	5016145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25600	NC_019678	T	7	7	5020167	5020173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25601	NC_019678	AT	3	6	5020196	5020201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25602	NC_019678	GTTT	2	8	5020259	5020266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25603	NC_019678	ACT	2	6	5020338	5020343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25604	NC_019678	TCA	2	6	5020385	5020390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25606	NC_019678	AATT	2	8	5020461	5020468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25608	NC_019678	GAA	2	6	5021089	5021094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25609	NC_019678	T	7	7	5021102	5021108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25610	NC_019678	A	6	6	5021446	5021451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25611	NC_019678	AAT	2	6	5024274	5024279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25612	NC_019678	TGC	2	6	5024280	5024285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25613	NC_019678	GCA	2	6	5024316	5024321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25614	NC_019678	TA	3	6	5024324	5024329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25615	NC_019678	ACAA	2	8	5024333	5024340	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25616	NC_019678	AACCT	2	10	5024360	5024369	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25617	NC_019678	TACGAT	2	12	5024373	5024384	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25618	NC_019678	GA	3	6	5024404	5024409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25619	NC_019678	ATT	2	6	5024413	5024418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25620	NC_019678	TAAA	2	8	5024454	5024461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25621	NC_019678	T	6	6	5024762	5024767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25622	NC_019678	TCCCC	2	10	5024788	5024797	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
25623	NC_019678	TTTG	2	8	5024855	5024862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25624	NC_019678	T	6	6	5024874	5024879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25625	NC_019678	AAAG	2	8	5024914	5024921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25626	NC_019678	TTAAA	2	10	5027014	5027023	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25627	NC_019678	TGTTT	2	10	5027025	5027034	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25628	NC_019678	T	6	6	5027119	5027124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25629	NC_019678	TGT	2	6	5027145	5027150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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