MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019678	ATCA	2	8	295516	295523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_019678	ATT	2	6	295549	295554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_019678	ATT	2	6	295586	295591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_019678	TA	3	6	295603	295608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_019678	AATTTT	2	12	295655	295666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_019678	AATT	2	8	295709	295716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_019678	ATT	2	6	295722	295727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_019678	AATC	2	8	295751	295758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_019678	TAA	2	6	295766	295771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_019678	TAT	2	6	295787	295792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_019678	TTCA	2	8	295824	295831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_019678	ACA	2	6	295838	295843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_019678	A	6	6	295846	295851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_019678	ATAA	2	8	295878	295885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_019678	AAT	2	6	295892	295897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_019678	AT	3	6	295933	295938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_019678	AT	4	8	296045	296052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_019678	TAA	2	6	296062	296067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_019678	GTT	2	6	296074	296079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_019678	T	6	6	296091	296096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_019678	T	6	6	296114	296119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_019678	TCG	2	6	296155	296160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_019678	GTTT	2	8	296177	296184	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_019678	GCA	2	6	296200	296205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_019678	TGAT	2	8	296219	296226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_019678	TAA	2	6	296231	296236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_019678	GTA	2	6	296283	296288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_019678	TGTT	2	8	296310	296317	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_019678	AAT	2	6	296352	296357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_019678	TA	3	6	296363	296368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_019678	A	6	6	296385	296390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_019678	AGCG	2	8	296411	296418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_019678	ATA	2	6	296425	296430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_019678	AGATA	2	10	296451	296460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_019678	TTTA	2	8	296534	296541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_019678	TAT	2	6	296555	296560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_019678	AT	3	6	296588	296593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_019678	T	6	6	296599	296604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_019678	GA	3	6	296664	296669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_019678	TA	5	10	296670	296679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_019678	ATC	2	6	296717	296722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_019678	AT	3	6	296734	296739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_019678	TA	3	6	296747	296752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_019678	TTG	2	6	296811	296816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_019678	ATCT	2	8	296827	296834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_019678	AAG	2	6	296872	296877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_019678	AT	3	6	296886	296891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_019678	TAAA	2	8	296892	296899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_019678	A	6	6	296897	296902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_019678	ATTA	2	8	297665	297672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_019678	GAAA	2	8	297720	297727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_019678	TCA	2	6	297774	297779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_019678	TGT	2	6	297802	297807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_019678	AT	3	6	297814	297819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_019678	AAT	2	6	298188	298193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_019678	GCT	2	6	298213	298218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_019678	ATA	2	6	298231	298236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_019678	ATT	2	6	298256	298261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_019678	T	6	6	298295	298300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_019678	A	6	6	298338	298343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_019678	T	6	6	298421	298426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_019678	TA	3	6	299045	299050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_019678	T	9	9	299059	299067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_019678	TTAA	2	8	299070	299077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_019678	CCCTT	2	10	299132	299141	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1566	NC_019678	AC	3	6	299164	299169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_019678	GTC	2	6	299210	299215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_019678	GAC	2	6	299220	299225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_019678	CAT	2	6	299250	299255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_019678	ACT	2	6	299325	299330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_019678	AAT	2	6	299421	299426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_019678	TAAA	2	8	300516	300523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_019678	ATA	2	6	300642	300647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_019678	TTTA	2	8	300703	300710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_019678	TCC	2	6	300909	300914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_019678	AAG	2	6	300919	300924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_019678	TTAT	2	8	302035	302042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_019678	TTA	2	6	302065	302070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_019678	GAA	2	6	302097	302102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_019678	A	6	6	302140	302145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_019678	ATT	2	6	302154	302159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_019678	TAA	2	6	302172	302177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_019678	AGAC	2	8	302183	302190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_019678	ATC	2	6	302269	302274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_019678	ATA	2	6	302292	302297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_019678	T	7	7	302299	302305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_019678	AGG	2	6	302400	302405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_019678	GTT	2	6	302446	302451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_019678	AATT	2	8	302454	302461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_019678	CTTG	2	8	302478	302485	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_019678	T	7	7	302522	302528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_019678	TAG	2	6	302572	302577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_019678	GAA	2	6	302625	302630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_019678	TA	3	6	302663	302668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_019678	TAG	2	6	302693	302698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_019678	AGT	2	6	302717	302722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_019678	TTA	2	6	302723	302728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_019678	TAA	2	6	302731	302736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_019678	GCT	2	6	302737	302742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_019678	CTT	2	6	302798	302803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_019678	CTT	2	6	302805	302810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_019678	AT	3	6	305059	305064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_019678	T	6	6	305069	305074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_019678	ACTTT	2	10	305075	305084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1605	NC_019678	GACC	2	8	305093	305100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_019678	ATAA	2	8	305102	305109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_019678	CAA	2	6	305207	305212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_019678	ATT	2	6	305250	305255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_019678	AT	3	6	305275	305280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_019678	TA	4	8	307565	307572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_019678	GAT	2	6	307575	307580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_019678	ACA	2	6	307595	307600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_019678	AAAT	2	8	307605	307612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_019678	ATG	2	6	307623	307628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_019678	TAAT	2	8	307629	307636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_019678	GTT	2	6	308532	308537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_019678	TCA	2	6	309675	309680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_019678	TTCA	2	8	310388	310395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_019678	CAG	2	6	310413	310418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_019678	ATT	2	6	310494	310499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_019678	AC	3	6	310506	310511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_019678	AAT	2	6	310593	310598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_019678	ATA	2	6	310634	310639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_019678	T	6	6	310660	310665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_019678	TAAT	2	8	310682	310689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_019678	A	6	6	312895	312900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_019678	ATG	3	9	312917	312925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_019678	GAA	2	6	315011	315016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_019678	AAT	2	6	316148	316153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_019678	ACCA	2	8	316196	316203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_019678	TA	4	8	318624	318631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_019678	T	6	6	319820	319825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_019678	ATT	2	6	319840	319845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_019678	TCC	2	6	322768	322773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_019678	CAAT	2	8	324907	324914	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1636	NC_019678	TAATC	2	10	324919	324928	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1637	NC_019678	CA	4	8	324942	324949	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1639	NC_019678	GAAA	2	8	325029	325036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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