MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_019678	GCT	2	6	3382745	3382750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17003	NC_019678	ATA	2	6	3382751	3382756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_019678	TAT	2	6	3382792	3382797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_019678	GAA	2	6	3382809	3382814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_019678	TTAT	2	8	3382858	3382865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_019678	ATT	2	6	3383348	3383353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_019678	AGT	2	6	3383360	3383365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_019678	AT	3	6	3383416	3383421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_019678	TAA	2	6	3383434	3383439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_019678	CTT	2	6	3383495	3383500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17012	NC_019678	AAGC	2	8	3383509	3383516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17013	NC_019678	TTA	2	6	3383523	3383528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17014	NC_019678	TGC	2	6	3383581	3383586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17015	NC_019678	GGA	2	6	3383588	3383593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_019678	ATT	2	6	3384461	3384466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_019678	GTT	2	6	3384579	3384584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_019678	TTG	2	6	3384594	3384599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_019678	ATT	2	6	3385326	3385331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_019678	TAAA	2	8	3385359	3385366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17021	NC_019678	TAA	2	6	3385367	3385372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_019678	T	7	7	3386066	3386072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_019678	ACT	2	6	3386088	3386093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17024	NC_019678	ATT	2	6	3386116	3386121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_019678	AT	3	6	3386150	3386155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17026	NC_019678	T	6	6	3386170	3386175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17027	NC_019678	CTAT	2	8	3386216	3386223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17028	NC_019678	TATC	2	8	3386270	3386277	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17029	NC_019678	AGTT	2	8	3386323	3386330	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_019678	AATA	2	8	3386341	3386348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_019678	AAT	2	6	3386412	3386417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17035	NC_019678	ATT	2	6	3389060	3389065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_019678	T	8	8	3389122	3389129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17037	NC_019678	ATCT	2	8	3389131	3389138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17038	NC_019678	TGA	2	6	3389179	3389184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17039	NC_019678	TAAT	2	8	3389200	3389207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17040	NC_019678	AAC	2	6	3389220	3389225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17041	NC_019678	GCT	2	6	3389238	3389243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17042	NC_019678	T	6	6	3389245	3389250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17043	NC_019678	TA	3	6	3389262	3389267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_019678	TGC	2	6	3389287	3389292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17045	NC_019678	TTTA	2	8	3389297	3389304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17048	NC_019678	AAC	2	6	3389448	3389453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17049	NC_019678	CT	3	6	3390157	3390162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17050	NC_019678	A	6	6	3390200	3390205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_019678	ATA	2	6	3390209	3390214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_019678	AATTT	2	10	3390218	3390227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_019678	A	6	6	3390271	3390276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_019678	AAG	2	6	3390320	3390325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_019678	GAT	2	6	3390347	3390352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17057	NC_019678	A	6	6	3390358	3390363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17058	NC_019678	AGA	2	6	3390378	3390383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_019678	AAAAAT	2	12	3390403	3390414	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_019678	GATT	2	8	3390434	3390441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17061	NC_019678	T	6	6	3390444	3390449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17062	NC_019678	AAAT	2	8	3390460	3390467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_019678	CAT	2	6	3391560	3391565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17064	NC_019678	TAA	2	6	3391569	3391574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17065	NC_019678	CAA	2	6	3391642	3391647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17066	NC_019678	A	6	6	3391803	3391808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17067	NC_019678	AAAT	2	8	3391814	3391821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17068	NC_019678	CTA	2	6	3391835	3391840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17069	NC_019678	T	6	6	3391858	3391863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_019678	ATTT	2	8	3391881	3391888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_019678	TA	3	6	3391896	3391901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17072	NC_019678	TAA	2	6	3391911	3391916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_019678	TCT	2	6	3391966	3391971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17074	NC_019678	GA	4	8	3391974	3391981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17075	NC_019678	TAAT	2	8	3392024	3392031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17079	NC_019678	TCTA	2	8	3392111	3392118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17080	NC_019678	A	6	6	3392133	3392138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_019678	GCA	2	6	3392160	3392165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17085	NC_019678	T	6	6	3393875	3393880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17095	NC_019678	TTA	2	6	3394265	3394270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17101	NC_019678	TTA	2	6	3395452	3395457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_019678	TAA	2	6	3395479	3395484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17104	NC_019678	ATA	2	6	3396265	3396270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17105	NC_019678	AT	4	8	3396272	3396279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17106	NC_019678	CAA	2	6	3396312	3396317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17109	NC_019678	AACAA	2	10	3396406	3396415	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17110	NC_019678	TCA	2	6	3396432	3396437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17111	NC_019678	AAT	2	6	3396474	3396479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_019678	TAA	2	6	3396514	3396519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17113	NC_019678	GTT	2	6	3396532	3396537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17114	NC_019678	TGA	2	6	3396577	3396582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17115	NC_019678	AAGCG	2	10	3396622	3396631	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17116	NC_019678	CAACC	2	10	3396707	3396716	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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17119	NC_019678	CTC	2	6	3399000	3399005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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17127	NC_019678	GT	3	6	3400933	3400938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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