MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_019678	TAAT	2	8	3191023	3191030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_019678	AAAAC	2	10	3191032	3191041	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16003	NC_019678	TTA	2	6	3191669	3191674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_019678	T	7	7	3191704	3191710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_019678	TA	4	8	3191712	3191719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_019678	GTTG	2	8	3193832	3193839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_019678	AAG	2	6	3193870	3193875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_019678	ATTC	2	8	3193899	3193906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16009	NC_019678	TGTT	2	8	3193939	3193946	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_019678	T	6	6	3194003	3194008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_019678	AGC	2	6	3194018	3194023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_019678	ATT	3	9	3194036	3194044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_019678	CTAA	2	8	3194082	3194089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16014	NC_019678	AGC	2	6	3194956	3194961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16015	NC_019678	T	6	6	3195529	3195534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_019678	AGTA	2	8	3195729	3195736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_019678	GAA	2	6	3195739	3195744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_019678	TCT	2	6	3195752	3195757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_019678	AATTAA	2	12	3197724	3197735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_019678	AGC	2	6	3197758	3197763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_019678	A	6	6	3197765	3197770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_019678	GACTA	2	10	3197781	3197790	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16023	NC_019678	T	6	6	3197815	3197820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_019678	T	6	6	3197864	3197869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_019678	TTAA	2	8	3197924	3197931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_019678	AAT	2	6	3197971	3197976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_019678	CTT	2	6	3198002	3198007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_019678	GTT	3	9	3198546	3198554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_019678	AAG	2	6	3199628	3199633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_019678	ATT	2	6	3199637	3199642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_019678	TAC	2	6	3200137	3200142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16033	NC_019678	CTCCCC	2	12	3200609	3200620	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
16034	NC_019678	CCCTCT	2	12	3200647	3200658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16035	NC_019678	TTGCA	2	10	3201394	3201403	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16036	NC_019678	TCAT	2	8	3201439	3201446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16037	NC_019678	TA	3	6	3201456	3201461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_019678	TAT	2	6	3201488	3201493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_019678	TAA	2	6	3206232	3206237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_019678	GAA	2	6	3206359	3206364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_019678	ATT	2	6	3206382	3206387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_019678	ATT	2	6	3206461	3206466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_019678	AAT	2	6	3206467	3206472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_019678	T	7	7	3206509	3206515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_019678	TCG	2	6	3206536	3206541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_019678	T	6	6	3208005	3208010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_019678	CTAAA	2	10	3211085	3211094	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16048	NC_019678	C	6	6	3211112	3211117	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16049	NC_019678	TAT	2	6	3211923	3211928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_019678	TAA	2	6	3211946	3211951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_019678	ATG	2	6	3211990	3211995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_019678	ATT	2	6	3213452	3213457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_019678	ATA	2	6	3213473	3213478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_019678	T	6	6	3213533	3213538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_019678	TATT	2	8	3214192	3214199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_019678	CT	3	6	3214206	3214211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16057	NC_019678	CT	3	6	3214214	3214219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16058	NC_019678	CT	3	6	3214222	3214227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16059	NC_019678	CT	3	6	3214230	3214235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16060	NC_019678	CT	3	6	3214238	3214243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16061	NC_019678	AAT	2	6	3216398	3216403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_019678	TTA	2	6	3216791	3216796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_019678	TCT	2	6	3216827	3216832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_019678	T	6	6	3216847	3216852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_019678	T	6	6	3216879	3216884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_019678	TGTT	2	8	3216974	3216981	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_019678	TTA	2	6	3217092	3217097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16069	NC_019678	TA	3	6	3217172	3217177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_019678	TTA	2	6	3217190	3217195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_019678	TTA	2	6	3217233	3217238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16073	NC_019678	ATTTG	2	10	3217322	3217331	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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16078	NC_019678	TCAAT	2	10	3217528	3217537	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16079	NC_019678	TGA	2	6	3217554	3217559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_019678	AAT	2	6	3217560	3217565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_019678	ATA	2	6	3217598	3217603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_019678	ATT	3	9	3217626	3217634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_019678	CTTG	2	8	3217664	3217671	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16084	NC_019678	AAAT	2	8	3217674	3217681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16088	NC_019678	ACA	2	6	3218919	3218924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16095	NC_019678	T	6	6	3219139	3219144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_019678	ATA	2	6	3219215	3219220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16098	NC_019678	ATT	2	6	3219252	3219257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_019678	A	7	7	3219296	3219302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_019678	T	6	6	3219310	3219315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_019678	TAAA	2	8	3219375	3219382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_019678	TA	3	6	3219396	3219401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_019678	TAGT	2	8	3219426	3219433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_019678	AAAT	2	8	3219538	3219545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_019678	T	6	6	3219595	3219600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_019678	AT	3	6	3219626	3219631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_019678	T	6	6	3219712	3219717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_019678	CTG	2	6	3219719	3219724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16113	NC_019678	AGA	2	6	3222660	3222665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_019678	TCT	2	6	3222695	3222700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_019678	ATTA	2	8	3222706	3222713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_019678	TC	3	6	3222719	3222724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16117	NC_019678	A	6	6	3222753	3222758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_019678	ATA	2	6	3222883	3222888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_019678	TGT	2	6	3222889	3222894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_019678	GCA	2	6	3222912	3222917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16122	NC_019678	GAA	2	6	3223090	3223095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_019678	TTA	2	6	3223107	3223112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16125	NC_019678	A	7	7	3223177	3223183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_019678	TA	4	8	3223209	3223216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_019678	AGA	2	6	3223277	3223282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_019678	ATA	2	6	3223361	3223366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16129	NC_019678	TA	3	6	3223365	3223370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16130	NC_019678	TA	3	6	3225280	3225285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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