MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_019678	A	7	7	2996306	2996312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_019678	GA	3	6	2996324	2996329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_019678	A	6	6	2998391	2998396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_019678	AAT	2	6	2998435	2998440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_019678	GGA	2	6	2998458	2998463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_019678	CCT	2	6	2998477	2998482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15007	NC_019678	TAT	2	6	2998559	2998564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_019678	ATTC	2	8	2998592	2998599	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15009	NC_019678	CGAA	2	8	2998615	2998622	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15010	NC_019678	TCGT	2	8	2998663	2998670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15011	NC_019678	ACA	2	6	2998749	2998754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15012	NC_019678	GATTG	2	10	2998767	2998776	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_019678	T	8	8	2998785	2998792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_019678	TAA	2	6	2998808	2998813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_019678	ACT	2	6	2998815	2998820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_019678	ATT	2	6	3000372	3000377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_019678	ATT	2	6	3000430	3000435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_019678	TTTAAA	2	12	3000437	3000448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_019678	AT	3	6	3000517	3000522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_019678	GAT	2	6	3000523	3000528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_019678	TTA	2	6	3000544	3000549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_019678	TAAC	2	8	3000569	3000576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15023	NC_019678	ATTTA	2	10	3000580	3000589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_019678	AT	3	6	3002336	3002341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_019678	ATTA	2	8	3002353	3002360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_019678	TAA	2	6	3002366	3002371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_019678	AAC	2	6	3002948	3002953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_019678	AT	3	6	3003054	3003059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_019678	TTA	2	6	3003819	3003824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_019678	G	6	6	3004475	3004480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_019678	G	6	6	3004484	3004489	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_019678	AAT	2	6	3004502	3004507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_019678	CT	3	6	3006009	3006014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15034	NC_019678	GTT	2	6	3006641	3006646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_019678	CTA	2	6	3007597	3007602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_019678	TTTC	2	8	3007612	3007619	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15037	NC_019678	TAA	2	6	3007638	3007643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_019678	TCA	2	6	3007655	3007660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15039	NC_019678	T	6	6	3008539	3008544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_019678	T	6	6	3008580	3008585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_019678	ATTA	2	8	3008606	3008613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_019678	GAAG	2	8	3008617	3008624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_019678	GAA	2	6	3008628	3008633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_019678	GAA	2	6	3008635	3008640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_019678	CCCAA	2	10	3008668	3008677	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
15046	NC_019678	AT	3	6	3008712	3008717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_019678	ATA	2	6	3008738	3008743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15049	NC_019678	AAT	2	6	3008778	3008783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_019678	AAT	3	9	3008787	3008795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_019678	TAT	2	6	3008825	3008830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_019678	ACTA	2	8	3008840	3008847	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15053	NC_019678	ATT	2	6	3008869	3008874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_019678	TTCG	2	8	3008905	3008912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15055	NC_019678	GAT	2	6	3009000	3009005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_019678	GAG	2	6	3009012	3009017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_019678	A	9	9	3009021	3009029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_019678	AGCTA	2	10	3009062	3009071	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15059	NC_019678	T	6	6	3009098	3009103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_019678	CAAA	2	8	3009131	3009138	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15061	NC_019678	TAC	2	6	3009179	3009184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15062	NC_019678	TCG	2	6	3009185	3009190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15063	NC_019678	GGT	2	6	3009210	3009215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_019678	A	6	6	3009266	3009271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_019678	T	6	6	3009273	3009278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_019678	GAT	2	6	3009444	3009449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15068	NC_019678	TCC	2	6	3009638	3009643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15069	NC_019678	GTT	2	6	3009657	3009662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15073	NC_019678	GTA	2	6	3009973	3009978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_019678	CAGA	2	8	3010066	3010073	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15075	NC_019678	TGGC	2	8	3010131	3010138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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15078	NC_019678	TGC	2	6	3010223	3010228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15079	NC_019678	GGT	2	6	3010238	3010243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15083	NC_019678	A	6	6	3010488	3010493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_019678	TC	3	6	3010504	3010509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15088	NC_019678	GTT	2	6	3011470	3011475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15099	NC_019678	GTTTT	2	10	3017092	3017101	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_019678	T	7	7	3017098	3017104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_019678	CTG	2	6	3017113	3017118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15102	NC_019678	TGAG	2	8	3017138	3017145	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_019678	CTGTG	2	10	3017170	3017179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15104	NC_019678	CAC	2	6	3017210	3017215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15106	NC_019678	TTTA	2	8	3017315	3017322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_019678	TTG	2	6	3017417	3017422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_019678	ATTG	2	8	3017428	3017435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_019678	AAG	2	6	3017438	3017443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_019678	TAC	2	6	3017561	3017566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15111	NC_019678	TGC	2	6	3017649	3017654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15112	NC_019678	AAATC	2	10	3017761	3017770	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15113	NC_019678	TATT	2	8	3017798	3017805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_019678	TGA	2	6	3017813	3017818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_019678	A	7	7	3017818	3017824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15118	NC_019678	GGA	2	6	3017973	3017978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_019678	CTT	2	6	3020677	3020682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15122	NC_019678	T	7	7	3020902	3020908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15127	NC_019678	TAG	2	6	3021140	3021145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15130	NC_019678	AAT	2	6	3022865	3022870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15131	NC_019678	ATA	2	6	3024514	3024519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15132	NC_019678	TAA	2	6	3024601	3024606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15133	NC_019678	TCGAT	2	10	3024768	3024777	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15134	NC_019678	AGCA	2	8	3024796	3024803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15135	NC_019678	GTA	2	6	3024864	3024869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15139	NC_019678	AATT	2	8	3026045	3026052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15140	NC_019678	AATT	2	8	3026111	3026118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15144	NC_019678	A	8	8	3026248	3026255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15145	NC_019678	AATT	2	8	3026297	3026304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15148	NC_019678	TGTT	2	8	3026490	3026497	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15149	NC_019678	T	6	6	3026523	3026528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15156	NC_019678	A	7	7	3026797	3026803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15157	NC_019678	TGC	2	6	3026815	3026820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15162	NC_019678	AGA	2	6	3028790	3028795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15163	NC_019678	TA	3	6	3029051	3029056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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