MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019678	TCTTT	2	10	215263	215272	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1002	NC_019678	A	6	6	215273	215278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019678	ATTT	2	8	215302	215309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019678	TTA	2	6	215318	215323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019678	TAAA	2	8	215335	215342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019678	TAAT	2	8	217943	217950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019678	TAAT	2	8	218364	218371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019678	CTT	2	6	218380	218385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_019678	GTT	2	6	218427	218432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019678	CAG	2	6	218494	218499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_019678	TAT	2	6	218532	218537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019678	TAA	2	6	218553	218558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019678	TCA	2	6	218589	218594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_019678	T	6	6	218598	218603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019678	TGC	2	6	218626	218631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_019678	TAT	2	6	218640	218645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019678	ATT	2	6	218652	218657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019678	TCA	2	6	218688	218693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_019678	AAT	2	6	218699	218704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019678	TAAA	2	8	218776	218783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019678	TAA	2	6	218805	218810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019678	TAA	2	6	218840	218845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019678	CA	3	6	218892	218897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_019678	CT	3	6	218927	218932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_019678	TAC	2	6	218993	218998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019678	ATTA	2	8	221098	221105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019678	AG	3	6	221116	221121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019678	G	6	6	221127	221132	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019678	TTC	2	6	221139	221144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_019678	CTGC	2	8	221165	221172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_019678	TTG	2	6	221180	221185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019678	T	7	7	221263	221269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019678	AT	3	6	221276	221281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_019678	A	7	7	221325	221331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019678	ATT	2	6	221864	221869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019678	ATAGG	2	10	221870	221879	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_019678	AT	3	6	221896	221901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019678	ACT	2	6	221936	221941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_019678	ATTTT	2	10	221957	221966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019678	ATT	2	6	222776	222781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019678	AAATT	2	10	222800	222809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019678	AAT	2	6	222815	222820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019678	AT	3	6	222858	222863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_019678	ATTT	2	8	222898	222905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019678	TAAA	2	8	223616	223623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019678	AGATT	2	10	224133	224142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019678	CAT	2	6	224145	224150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_019678	CT	3	6	225560	225565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_019678	AT	3	6	225577	225582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019678	TGAA	2	8	225608	225615	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019678	TTAA	2	8	225622	225629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019678	TTA	2	6	225631	225636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019678	TACTT	2	10	225640	225649	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_019678	AT	3	6	225708	225713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_019678	TAT	2	6	225764	225769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_019678	TTA	2	6	225770	225775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019678	AATTT	2	10	226360	226369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019678	TAG	2	6	226370	226375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019678	ATT	2	6	226381	226386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019678	GAA	2	6	226418	226423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019678	A	6	6	226431	226436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019678	A	6	6	226456	226461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019678	CAA	2	6	226473	226478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_019678	AGC	2	6	226493	226498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_019678	ATT	2	6	226500	226505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019678	TTC	2	6	226516	226521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_019678	AAT	2	6	227047	227052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019678	AAG	2	6	227062	227067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019678	AT	3	6	227076	227081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019678	ATAG	2	8	228921	228928	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_019678	ATT	2	6	228961	228966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019678	TCCT	2	8	230023	230030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_019678	TAA	2	6	230038	230043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_019678	A	6	6	230042	230047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019678	TTA	2	6	230058	230063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_019678	AGG	2	6	230110	230115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_019678	G	6	6	230114	230119	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_019678	A	6	6	230149	230154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019678	ACT	2	6	230165	230170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_019678	CTC	2	6	230735	230740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_019678	TAC	2	6	230795	230800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_019678	TGT	2	6	230879	230884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019678	AAT	2	6	230998	231003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019678	CAAA	2	8	231032	231039	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_019678	TGA	2	6	231117	231122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_019678	A	8	8	231178	231185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_019678	CAA	2	6	231211	231216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_019678	AAC	2	6	231265	231270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_019678	AAT	2	6	231320	231325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_019678	AT	3	6	231324	231329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019678	ATT	3	9	231334	231342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019678	ATT	2	6	231348	231353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019678	ATTGTT	2	12	231427	231438	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_019678	A	7	7	231447	231453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_019678	A	8	8	231533	231540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_019678	TCG	2	6	231556	231561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_019678	CAA	2	6	231604	231609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_019678	CAGT	2	8	231635	231642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_019678	ACAA	2	8	231678	231685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_019678	AAT	2	6	232904	232909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019678	GAAT	2	8	232953	232960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_019678	TAAT	2	8	232983	232990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019678	TTAA	2	8	232999	233006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019678	TAA	2	6	233008	233013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019678	TTA	2	6	233014	233019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019678	T	7	7	233084	233090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019678	TAG	2	6	233400	233405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_019678	ATC	2	6	233449	233454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_019678	AAC	2	6	233459	233464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_019678	AAC	2	6	233466	233471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_019678	AAC	2	6	233494	233499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_019678	ATC	2	6	233519	233524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_019678	ATT	2	6	234983	234988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019678	TAA	2	6	234989	234994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019678	GTATTA	2	12	235022	235033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019678	TA	3	6	235045	235050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_019678	TACAT	2	10	235111	235120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1118	NC_019678	TTG	2	6	235210	235215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019678	T	6	6	235226	235231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019678	AAATT	2	10	235252	235261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_019678	CAG	2	6	235319	235324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_019678	A	7	7	235385	235391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019678	A	6	6	235422	235427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019678	GAA	2	6	235429	235434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019678	AGTTT	2	10	235462	235471	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019678	ATT	2	6	235490	235495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_019678	AG	4	8	238357	238364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_019678	AGA	2	6	238403	238408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019678	T	6	6	238602	238607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_019678	AAC	2	6	238928	238933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_019678	ATC	2	6	238951	238956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_019678	TAGAA	2	10	240088	240097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019678	ACA	2	6	240195	240200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_019678	TAT	2	6	240269	240274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_019678	TGA	2	6	241281	241286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_019678	T	6	6	241291	241296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_019678	ATT	2	6	241312	241317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_019678	TTA	2	6	242404	242409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1277	NC_019678	TGA	2	6	263518	263523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1278	NC_019678	ACC	2	6	263568	263573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1279	NC_019678	ACC	2	6	263617	263622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1280	NC_019678	ACC	2	6	263638	263643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1281	NC_019678	GAA	2	6	264063	264068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_019678	TC	3	6	286246	286251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1409	NC_019678	AAG	2	6	286256	286261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_019678	A	8	8	286292	286299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_019678	ATT	2	6	286371	286376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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