MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_019678	TAA	2	6	2698449	2698454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_019678	A	6	6	2698453	2698458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_019678	ATTTT	2	10	2698488	2698497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_019678	TGTT	2	8	2698513	2698520	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_019678	TGA	2	6	2698524	2698529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_019678	GAA	2	6	2698530	2698535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_019678	CTA	2	6	2698540	2698545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_019678	TAC	2	6	2698578	2698583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_019678	TA	3	6	2698599	2698604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_019678	CAA	2	6	2698610	2698615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_019678	AAG	2	6	2698640	2698645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_019678	TCT	2	6	2699025	2699030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_019678	CTACA	2	10	2699048	2699057	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13514	NC_019678	GACG	2	8	2699098	2699105	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13515	NC_019678	AAG	2	6	2699132	2699137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_019678	T	6	6	2699223	2699228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_019678	A	6	6	2699249	2699254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_019678	TAC	2	6	2699531	2699536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_019678	TAA	2	6	2699552	2699557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_019678	AGC	2	6	2699646	2699651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_019678	TCC	2	6	2699658	2699663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13522	NC_019678	GT	3	6	2699667	2699672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_019678	TGAA	2	8	2699730	2699737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_019678	TCCT	2	8	2699925	2699932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13525	NC_019678	ACC	2	6	2699988	2699993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13526	NC_019678	AAC	2	6	2700072	2700077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13527	NC_019678	CCA	2	6	2700130	2700135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13528	NC_019678	GCACCA	2	12	2700142	2700153	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13529	NC_019678	CAG	2	6	2700167	2700172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_019678	GCT	2	6	2700178	2700183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_019678	TCC	2	6	2700213	2700218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13532	NC_019678	CCGTA	2	10	2700244	2700253	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13533	NC_019678	TGT	2	6	2700267	2700272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_019678	CTG	2	6	2700302	2700307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_019678	TTA	2	6	2700322	2700327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_019678	TAT	2	6	2700404	2700409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_019678	CAG	2	6	2700479	2700484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13538	NC_019678	CAT	2	6	2700485	2700490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13539	NC_019678	ATA	3	9	2700504	2700512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_019678	TCA	2	6	2700526	2700531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_019678	ACCGT	2	10	2700625	2700634	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13542	NC_019678	TAT	2	6	2700635	2700640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_019678	AGTTA	2	10	2700753	2700762	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_019678	CCATCA	2	12	2700763	2700774	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
13545	NC_019678	CAT	2	6	2700797	2700802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_019678	AAAC	2	8	2700803	2700810	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13547	NC_019678	ACG	2	6	2700867	2700872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13548	NC_019678	CAG	2	6	2700896	2700901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13549	NC_019678	ACA	2	6	2700931	2700936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_019678	TCA	3	9	2701021	2701029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13551	NC_019678	CAT	2	6	2701088	2701093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_019678	TCG	2	6	2701111	2701116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_019678	TCA	2	6	2701129	2701134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_019678	ATCGTA	2	12	2701176	2701187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13555	NC_019678	AAG	2	6	2701214	2701219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_019678	AGC	2	6	2701254	2701259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_019678	GAC	2	6	2701298	2701303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13558	NC_019678	CAT	2	6	2701310	2701315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_019678	GCT	2	6	2701323	2701328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_019678	CAA	2	6	2701334	2701339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_019678	GCA	2	6	2701390	2701395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_019678	ATT	2	6	2701522	2701527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_019678	CTA	2	6	2701529	2701534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13564	NC_019678	TAT	2	6	2701548	2701553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_019678	T	8	8	2701633	2701640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_019678	TTA	3	9	2701669	2701677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_019678	GTAG	2	8	2701698	2701705	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_019678	CTT	2	6	2701738	2701743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13569	NC_019678	ACA	2	6	2701798	2701803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_019678	A	6	6	2702240	2702245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_019678	ATT	2	6	2702261	2702266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_019678	AC	3	6	2702346	2702351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13573	NC_019678	ATG	2	6	2703928	2703933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_019678	TGA	2	6	2705635	2705640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_019678	GAA	2	6	2705667	2705672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_019678	TGA	2	6	2705677	2705682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_019678	ATT	2	6	2705683	2705688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_019678	AATA	2	8	2705689	2705696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_019678	AT	3	6	2705711	2705716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_019678	ATC	2	6	2705744	2705749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_019678	GTT	2	6	2710599	2710604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13582	NC_019678	AGCA	2	8	2710627	2710634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13583	NC_019678	AG	4	8	2710664	2710671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13584	NC_019678	CTAA	2	8	2712512	2712519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13585	NC_019678	AAT	2	6	2712521	2712526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13586	NC_019678	ATTAC	2	10	2712533	2712542	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13587	NC_019678	AGG	2	6	2712576	2712581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_019678	GAA	2	6	2712584	2712589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_019678	GAAG	2	8	2712611	2712618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_019678	TGGAAT	2	12	2712624	2712635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_019678	CCG	2	6	2712669	2712674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13592	NC_019678	CGC	2	6	2712678	2712683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13593	NC_019678	TTG	2	6	2712724	2712729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_019678	AGC	2	6	2712804	2712809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13595	NC_019678	ATCT	2	8	2713459	2713466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13596	NC_019678	C	6	6	2713507	2713512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13597	NC_019678	TGC	2	6	2713545	2713550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13598	NC_019678	T	6	6	2713561	2713566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_019678	GAA	3	9	2713577	2713585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_019678	CTC	2	6	2713596	2713601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13601	NC_019678	AGCTAT	2	12	2719205	2719216	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13602	NC_019678	TCT	2	6	2719220	2719225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13603	NC_019678	ATAGC	2	10	2719230	2719239	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13604	NC_019678	TAA	2	6	2719248	2719253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_019678	TAAT	3	12	2719272	2719283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_019678	ATA	2	6	2719287	2719292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_019678	CTAA	2	8	2719325	2719332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13608	NC_019678	ATTG	2	8	2719361	2719368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_019678	CTACTT	2	12	2719395	2719406	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13610	NC_019678	AAT	2	6	2719779	2719784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_019678	AGTT	2	8	2719793	2719800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_019678	A	8	8	2719827	2719834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_019678	AC	3	6	2719855	2719860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13614	NC_019678	T	7	7	2719862	2719868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_019678	AATT	2	8	2719885	2719892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_019678	GTTA	2	8	2719943	2719950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_019678	TAA	2	6	2719959	2719964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_019678	ATT	2	6	2720002	2720007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_019678	GAT	2	6	2720046	2720051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_019678	AAT	2	6	2720072	2720077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_019678	T	6	6	2720084	2720089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_019678	A	6	6	2720106	2720111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_019678	ATC	2	6	2720126	2720131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13624	NC_019678	TA	3	6	2720176	2720181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_019678	GTT	2	6	2720212	2720217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_019678	GGT	2	6	2720231	2720236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13628	NC_019678	A	6	6	2720300	2720305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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