MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_019678	ATT	2	6	2263448	2263453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_019678	AT	3	6	2263455	2263460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_019678	CCA	2	6	2263461	2263466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11504	NC_019678	AAT	2	6	2263498	2263503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_019678	TTC	2	6	2264381	2264386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_019678	CCT	2	6	2264391	2264396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11507	NC_019678	ATC	2	6	2264419	2264424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_019678	TGG	2	6	2264431	2264436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_019678	A	6	6	2264454	2264459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_019678	TTTC	2	8	2264538	2264545	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11511	NC_019678	ATT	2	6	2266243	2266248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_019678	T	6	6	2266257	2266262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_019678	CTTC	2	8	2266276	2266283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11514	NC_019678	GCA	2	6	2267015	2267020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_019678	ATT	2	6	2267032	2267037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_019678	ATA	2	6	2267041	2267046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_019678	TGCAAT	2	12	2267075	2267086	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11518	NC_019678	AATT	2	8	2267137	2267144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_019678	TATATT	2	12	2268624	2268635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_019678	TTA	2	6	2268668	2268673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_019678	AATTA	2	10	2268684	2268693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_019678	TAC	2	6	2268801	2268806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_019678	TAT	2	6	2268824	2268829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_019678	AAG	2	6	2268857	2268862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_019678	TA	3	6	2269068	2269073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_019678	GAA	2	6	2269146	2269151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_019678	AAT	2	6	2269179	2269184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_019678	AGT	2	6	2269207	2269212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_019678	TCC	2	6	2270303	2270308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11530	NC_019678	CAG	2	6	2270310	2270315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_019678	TAT	2	6	2270411	2270416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_019678	ATT	2	6	2271971	2271976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_019678	A	6	6	2276616	2276621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_019678	T	6	6	2276653	2276658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_019678	AATT	2	8	2276673	2276680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_019678	TAG	2	6	2276703	2276708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_019678	TAG	2	6	2276710	2276715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_019678	TTA	2	6	2278127	2278132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_019678	ACT	2	6	2278146	2278151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_019678	ACT	2	6	2278173	2278178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_019678	GTA	2	6	2278181	2278186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_019678	TTA	2	6	2278209	2278214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_019678	ATT	2	6	2278716	2278721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_019678	TCAA	2	8	2278731	2278738	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11545	NC_019678	ACA	2	6	2278848	2278853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_019678	ATTA	2	8	2278868	2278875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_019678	A	6	6	2278902	2278907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_019678	CATT	2	8	2278957	2278964	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11549	NC_019678	TAA	2	6	2278977	2278982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_019678	TTC	2	6	2278983	2278988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_019678	ATT	2	6	2279023	2279028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_019678	ACAA	2	8	2279090	2279097	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11553	NC_019678	GCT	2	6	2279101	2279106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_019678	GTT	2	6	2279133	2279138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_019678	GCC	2	6	2279153	2279158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11556	NC_019678	GTC	2	6	2279201	2279206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_019678	TTC	2	6	2279207	2279212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_019678	TTC	2	6	2279278	2279283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_019678	CAT	2	6	2279380	2279385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_019678	TCT	2	6	2279396	2279401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_019678	TTAT	2	8	2279457	2279464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_019678	CCAT	2	8	2279493	2279500	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11563	NC_019678	TCA	2	6	2279519	2279524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_019678	TGA	2	6	2279555	2279560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_019678	AGT	2	6	2279563	2279568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_019678	TTA	2	6	2279619	2279624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_019678	T	6	6	2279640	2279645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_019678	AAT	2	6	2279656	2279661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_019678	AAG	2	6	2280879	2280884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_019678	T	7	7	2280934	2280940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_019678	AAT	2	6	2280965	2280970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_019678	CTT	2	6	2280981	2280986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_019678	GTC	2	6	2280990	2280995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_019678	TCTT	2	8	2281155	2281162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11575	NC_019678	A	6	6	2281179	2281184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_019678	AAAT	2	8	2281206	2281213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_019678	ATA	3	9	2281226	2281234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_019678	CCT	2	6	2281249	2281254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11579	NC_019678	GTA	2	6	2281265	2281270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_019678	TAA	3	9	2281274	2281282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_019678	AT	3	6	2281356	2281361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_019678	CCT	2	6	2282192	2282197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11583	NC_019678	ATCAGA	2	12	2282210	2282221	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11584	NC_019678	A	6	6	2282301	2282306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_019678	T	6	6	2282369	2282374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_019678	ATA	2	6	2282407	2282412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_019678	AAT	2	6	2282432	2282437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_019678	ATA	2	6	2282451	2282456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_019678	TAA	2	6	2282529	2282534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_019678	AT	3	6	2282612	2282617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_019678	A	6	6	2283892	2283897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_019678	AAT	2	6	2284034	2284039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_019678	T	6	6	2284054	2284059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_019678	ATTA	2	8	2284108	2284115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_019678	ATTG	2	8	2284127	2284134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_019678	ACA	2	6	2284146	2284151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_019678	TTA	2	6	2289664	2289669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_019678	TA	3	6	2289690	2289695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_019678	AAG	2	6	2289710	2289715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_019678	AGG	2	6	2289991	2289996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_019678	ATT	2	6	2291600	2291605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_019678	A	6	6	2291894	2291899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_019678	CTTTG	2	10	2291933	2291942	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11604	NC_019678	GCG	2	6	2291963	2291968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_019678	TCA	2	6	2292264	2292269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_019678	TTTTCA	2	12	2292791	2292802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11607	NC_019678	ACT	2	6	2292803	2292808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_019678	CTAA	2	8	2292865	2292872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11609	NC_019678	CTA	2	6	2292889	2292894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_019678	GGT	2	6	2292936	2292941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_019678	T	7	7	2292955	2292961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_019678	TGG	2	6	2292984	2292989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_019678	C	6	6	2293046	2293051	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11614	NC_019678	TAA	2	6	2293653	2293658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_019678	TGT	2	6	2293685	2293690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_019678	TTG	2	6	2293707	2293712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_019678	CAA	2	6	2293762	2293767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_019678	TTG	2	6	2293780	2293785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_019678	TTG	2	6	2293789	2293794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_019678	AAC	2	6	2293795	2293800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_019678	TTG	2	6	2293804	2293809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_019678	AC	3	6	2293819	2293824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11623	NC_019678	C	6	6	2293827	2293832	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11624	NC_019678	C	9	9	2293834	2293842	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11625	NC_019678	T	6	6	2295087	2295092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_019678	CACT	2	8	2295094	2295101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11627	NC_019678	TGT	2	6	2295120	2295125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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