MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_019678	TTG	2	6	2018798	2018803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_019678	A	7	7	2018826	2018832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_019678	TA	3	6	2018915	2018920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_019678	AGA	2	6	2018934	2018939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_019678	T	7	7	2019008	2019014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_019678	ATT	2	6	2019073	2019078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_019678	GTT	2	6	2019106	2019111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_019678	AATT	2	8	2019112	2019119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_019678	TAA	2	6	2019126	2019131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_019678	TGT	2	6	2019167	2019172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_019678	AGT	2	6	2019202	2019207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_019678	CAAA	3	12	2019216	2019227	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10513	NC_019678	AAAGA	2	10	2019350	2019359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_019678	ATT	2	6	2019380	2019385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_019678	TAA	3	9	2019445	2019453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_019678	TTA	2	6	2019837	2019842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_019678	ATT	2	6	2019889	2019894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_019678	TCT	2	6	2019940	2019945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_019678	TTC	2	6	2019949	2019954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_019678	TATT	2	8	2019959	2019966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_019678	TCA	2	6	2020040	2020045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_019678	AAT	4	12	2020053	2020064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_019678	T	6	6	2020064	2020069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_019678	CAGT	2	8	2020076	2020083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10525	NC_019678	T	6	6	2020097	2020102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_019678	AATTC	2	10	2020103	2020112	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10527	NC_019678	TAA	2	6	2020118	2020123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_019678	CAC	2	6	2020177	2020182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10529	NC_019678	T	7	7	2020198	2020204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_019678	T	7	7	2021192	2021198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_019678	ACAG	2	8	2021219	2021226	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10532	NC_019678	CAAG	2	8	2021248	2021255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10533	NC_019678	AGCT	2	8	2021345	2021352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10534	NC_019678	TA	4	8	2021354	2021361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_019678	A	6	6	2021377	2021382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_019678	A	6	6	2021391	2021396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_019678	AAC	2	6	2021404	2021409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_019678	GCAA	2	8	2021512	2021519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10539	NC_019678	GGA	2	6	2021534	2021539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_019678	TCT	2	6	2021559	2021564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10541	NC_019678	A	6	6	2021565	2021570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_019678	TTCC	2	8	2021600	2021607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10543	NC_019678	GTA	2	6	2021611	2021616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_019678	CTT	2	6	2021649	2021654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_019678	ATT	2	6	2021697	2021702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_019678	AAATA	2	10	2021707	2021716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_019678	T	6	6	2021801	2021806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_019678	GAC	2	6	2021815	2021820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_019678	GAG	2	6	2021953	2021958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_019678	TCC	2	6	2022393	2022398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10551	NC_019678	TA	3	6	2022420	2022425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_019678	TTAG	2	8	2022495	2022502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_019678	CAAA	2	8	2022511	2022518	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10554	NC_019678	ATTTT	2	10	2024276	2024285	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_019678	T	6	6	2024282	2024287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_019678	ATA	2	6	2024306	2024311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_019678	T	6	6	2026680	2026685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_019678	CCTC	2	8	2026696	2026703	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10559	NC_019678	CAAA	2	8	2026749	2026756	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10560	NC_019678	ATTT	2	8	2026764	2026771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_019678	ATTT	2	8	2026814	2026821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_019678	C	6	6	2026846	2026851	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10563	NC_019678	CAG	2	6	2026868	2026873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10564	NC_019678	A	7	7	2026927	2026933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_019678	TGTAT	2	10	2026934	2026943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_019678	TAA	2	6	2026956	2026961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_019678	TG	4	8	2026974	2026981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_019678	ATA	2	6	2027039	2027044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_019678	GTTTT	2	10	2027063	2027072	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_019678	A	8	8	2027146	2027153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_019678	A	6	6	2027164	2027169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_019678	TGTC	2	8	2027236	2027243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10575	NC_019678	GTAA	2	8	2027906	2027913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_019678	GAA	2	6	2027926	2027931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10581	NC_019678	AAAT	2	8	2028063	2028070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_019678	TAA	2	6	2028234	2028239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10588	NC_019678	TTTA	2	8	2028458	2028465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_019678	T	9	9	2028566	2028574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_019678	T	6	6	2028594	2028599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_019678	A	7	7	2028621	2028627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10595	NC_019678	AT	3	6	2028753	2028758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_019678	ATTAA	2	10	2028778	2028787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_019678	GCT	2	6	2028849	2028854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10599	NC_019678	CAA	2	6	2028883	2028888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10600	NC_019678	TAA	2	6	2030164	2030169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_019678	ATAA	2	8	2030173	2030180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_019678	AAT	2	6	2030264	2030269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_019678	TA	3	6	2030297	2030302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_019678	T	6	6	2030332	2030337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_019678	AAGC	2	8	2030338	2030345	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10612	NC_019678	TAAA	2	8	2030637	2030644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_019678	T	6	6	2030666	2030671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_019678	CA	3	6	2030726	2030731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10615	NC_019678	ATA	2	6	2030750	2030755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10617	NC_019678	TTGTA	2	10	2030852	2030861	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_019678	T	7	7	2030871	2030877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10621	NC_019678	CAA	2	6	2030925	2030930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10625	NC_019678	AATTTA	2	12	2031720	2031731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10627	NC_019678	TTAA	2	8	2031752	2031759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_019678	T	6	6	2031763	2031768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10629	NC_019678	TA	3	6	2031821	2031826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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