MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_019678	TAGA	2	8	1547636	1547643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_019678	ATT	2	6	1547657	1547662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_019678	T	6	6	1547686	1547691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_019678	TGA	2	6	1547693	1547698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_019678	AAT	2	6	1547713	1547718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_019678	A	6	6	1547760	1547765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_019678	TAT	2	6	1547766	1547771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_019678	T	8	8	1547775	1547782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_019678	TTTA	2	8	1547849	1547856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_019678	AATAGA	2	12	1547884	1547895	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_019678	GTA	2	6	1547965	1547970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_019678	CAC	2	6	1547976	1547981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_019678	TATT	2	8	1548012	1548019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_019678	AT	3	6	1548024	1548029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_019678	TAG	2	6	1548081	1548086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_019678	ATT	2	6	1549126	1549131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_019678	T	6	6	1549138	1549143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_019678	ATA	2	6	1549188	1549193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_019678	AACA	2	8	1550070	1550077	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_019678	AAGCTT	2	12	1550105	1550116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8022	NC_019678	AAG	2	6	1550117	1550122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_019678	GAA	2	6	1550157	1550162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_019678	GTT	2	6	1550228	1550233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_019678	T	6	6	1550317	1550322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8027	NC_019678	TAA	2	6	1550877	1550882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_019678	TTA	2	6	1550930	1550935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_019678	A	9	9	1552070	1552078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_019678	TAT	2	6	1552152	1552157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_019678	TTTG	2	8	1552223	1552230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_019678	GA	3	6	1552294	1552299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_019678	TA	3	6	1552313	1552318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_019678	AAT	2	6	1552332	1552337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8041	NC_019678	TAGT	2	8	1552484	1552491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_019678	TA	3	6	1552502	1552507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_019678	TA	3	6	1552512	1552517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_019678	ATTT	2	8	1552529	1552536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_019678	TA	3	6	1552579	1552584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_019678	TAGT	2	8	1552630	1552637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8052	NC_019678	TTG	2	6	1552894	1552899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_019678	TGG	2	6	1552915	1552920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8055	NC_019678	TAT	2	6	1555191	1555196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_019678	AAG	2	6	1555207	1555212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_019678	ATA	2	6	1555225	1555230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_019678	AGA	2	6	1555273	1555278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_019678	AGG	4	12	1555295	1555306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8064	NC_019678	CAT	3	9	1555366	1555374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_019678	TAT	2	6	1555386	1555391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_019678	A	6	6	1556520	1556525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_019678	TCT	2	6	1556538	1556543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8071	NC_019678	TA	3	6	1556688	1556693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_019678	GTAT	2	8	1556728	1556735	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_019678	TTAC	2	8	1556745	1556752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8074	NC_019678	TAA	2	6	1556756	1556761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_019678	AAT	2	6	1556762	1556767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_019678	AGTA	2	8	1556779	1556786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_019678	TGA	2	6	1557165	1557170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8079	NC_019678	TA	3	6	1557190	1557195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8081	NC_019678	GTAA	2	8	1557302	1557309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8083	NC_019678	CTA	2	6	1557412	1557417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8085	NC_019678	ATT	2	6	1557452	1557457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8089	NC_019678	TA	3	6	1559399	1559404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_019678	CTA	2	6	1563085	1563090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8099	NC_019678	ATA	2	6	1563170	1563175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_019678	GATTAT	2	12	1563312	1563323	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_019678	GTA	2	6	1564001	1564006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_019678	A	6	6	1564013	1564018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_019678	AT	3	6	1564042	1564047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_019678	ATTA	2	8	1564050	1564057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8107	NC_019678	A	6	6	1564200	1564205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_019678	CA	3	6	1567652	1567657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8109	NC_019678	TTA	2	6	1567715	1567720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_019678	TAA	2	6	1567979	1567984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_019678	CTG	2	6	1568004	1568009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_019678	A	6	6	1568125	1568130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_019678	AT	4	8	1568134	1568141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_019678	ATT	2	6	1568147	1568152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_019678	GAA	2	6	1568156	1568161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_019678	CAAT	2	8	1568162	1568169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8117	NC_019678	T	8	8	1568169	1568176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_019678	AT	3	6	1568185	1568190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_019678	TAA	2	6	1568276	1568281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_019678	GCTTT	2	10	1568310	1568319	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8121	NC_019678	AT	3	6	1568372	1568377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_019678	TGC	2	6	1568460	1568465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_019678	TA	3	6	1568486	1568491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_019678	TTC	2	6	1568517	1568522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_019678	AAG	2	6	1568530	1568535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_019678	AACG	2	8	1568589	1568596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8127	NC_019678	ATT	3	9	1568904	1568912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_019678	GGA	2	6	1568960	1568965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_019678	TAGC	2	8	1569008	1569015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8130	NC_019678	GTAGA	2	10	1569023	1569032	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_019678	ATT	2	6	1569054	1569059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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