MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019678	ACG	2	6	16	21	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019678	GGT	2	6	35	40	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019678	A	6	6	1442	1447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019678	T	6	6	1562	1567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019678	AAT	2	6	1580	1585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019678	AAT	2	6	1625	1630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019678	TTAA	2	8	1751	1758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019678	A	6	6	1760	1765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019678	A	6	6	1775	1780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019678	CTT	2	6	1787	1792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019678	TTG	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019678	TATT	2	8	1831	1838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019678	AGC	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019678	A	6	6	1857	1862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019678	TGGG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019678	CCTTTA	2	12	3091	3102	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019678	CTT	2	6	6495	6500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019678	A	6	6	6502	6507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019678	TAG	2	6	6518	6523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019678	ATTT	2	8	6531	6538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019678	ATC	2	6	6550	6555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019678	AT	4	8	6563	6570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019678	TAT	2	6	6589	6594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019678	AAT	2	6	7803	7808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019678	ATTT	2	8	7833	7840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019678	AT	3	6	7843	7848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019678	TTG	2	6	8255	8260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019678	GTT	2	6	8261	8266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019678	GTT	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019678	T	6	6	8314	8319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019678	ACTC	2	8	8320	8327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019678	CAT	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019678	T	6	6	9067	9072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019678	TAA	2	6	10182	10187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019678	CTCTTT	2	12	10201	10212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019678	GCT	2	6	10280	10285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019678	TGC	2	6	10324	10329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019678	A	8	8	10344	10351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019678	AAT	2	6	10361	10366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019678	GAG	2	6	10372	10377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019678	TCA	2	6	10403	10408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019678	CTA	2	6	10419	10424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019678	CCT	2	6	11682	11687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019678	GAA	2	6	11699	11704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019678	GGTC	2	8	11725	11732	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019678	CTT	2	6	11904	11909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019678	TA	3	6	11929	11934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019678	TAC	2	6	11948	11953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019678	GA	3	6	11971	11976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019678	TTGG	2	8	12011	12018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019678	T	6	6	12040	12045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019678	TCAA	2	8	12111	12118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019678	AAC	2	6	12235	12240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019678	TCT	2	6	12264	12269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019678	AGT	2	6	12273	12278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019678	AGA	2	6	12323	12328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019678	GTA	2	6	12336	12341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019678	TGCT	2	8	12450	12457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019678	TTTA	2	8	12983	12990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019678	ACTT	2	8	12996	13003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019678	TAGT	2	8	15182	15189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019678	A	6	6	15221	15226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019678	A	6	6	15232	15237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019678	T	6	6	15280	15285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019678	ATT	2	6	15294	15299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019678	TA	4	8	15346	15353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019678	ATA	2	6	15465	15470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019678	A	9	9	15484	15492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019678	ATT	2	6	15508	15513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019678	CTG	2	6	15518	15523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019678	TAAT	2	8	15529	15536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019678	T	6	6	15547	15552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019678	T	6	6	15573	15578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019678	ATT	2	6	17029	17034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019678	TAAA	2	8	17035	17042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019678	TTTG	2	8	17061	17068	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019678	GTT	2	6	18359	18364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019678	GTT	2	6	18366	18371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019678	GTT	2	6	18373	18378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019678	ATT	2	6	19209	19214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019678	ATT	2	6	19237	19242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019678	GATT	2	8	19255	19262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019678	TTA	2	6	19295	19300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019678	CA	3	6	19322	19327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019678	ATT	2	6	19337	19342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019678	ATTC	2	8	21440	21447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019678	ATC	2	6	21501	21506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019678	AAT	2	6	21517	21522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019678	CGC	2	6	21557	21562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_019678	CTAG	2	8	21569	21576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019678	GCG	2	6	21584	21589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019678	ACAA	2	8	22093	22100	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019678	ATA	2	6	22114	22119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019678	TC	3	6	22134	22139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019678	ATTC	2	8	22142	22149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019678	AGAA	2	8	22186	22193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019678	ATA	2	6	22216	22221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019678	GGT	2	6	22256	22261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019678	AGG	2	6	22277	22282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019678	CAC	2	6	22358	22363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_019678	A	6	6	22412	22417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019678	ACC	2	6	22440	22445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019678	ATT	2	6	22518	22523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019678	CAG	2	6	22526	22531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019678	CTG	2	6	22562	22567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019678	CTA	2	6	22609	22614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019678	AAT	2	6	22660	22665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019678	GAA	2	6	22675	22680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019678	TAC	2	6	22698	22703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019678	TAA	2	6	22717	22722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019678	ATTA	2	8	22734	22741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019678	A	7	7	22802	22808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019678	TAT	2	6	22809	22814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019678	TTAG	2	8	22892	22899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019678	GAA	2	6	22922	22927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019678	A	7	7	22936	22942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019678	TAAA	2	8	22963	22970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019678	CTAA	2	8	23018	23025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019678	TA	3	6	24843	24848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019678	AGTA	2	8	25055	25062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019678	ATT	2	6	25081	25086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019678	A	6	6	25798	25803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019678	ATT	2	6	25812	25817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019678	TAT	2	6	25834	25839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019678	TGAT	2	8	27120	27127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019678	TTAT	2	8	27151	27158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019678	A	6	6	27218	27223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019678	AGA	2	6	27250	27255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019678	TATC	2	8	27354	27361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019678	GT	3	6	27389	27394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019678	TCC	2	6	27499	27504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019678	AGCGA	2	10	27516	27525	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019678	GGAG	2	8	27542	27549	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019678	AG	3	6	29054	29059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019678	G	6	6	29076	29081	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019678	A	6	6	29093	29098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019678	TAAA	2	8	29126	29133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019678	AT	3	6	29137	29142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019678	AAAT	2	8	29155	29162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019678	AAT	2	6	29269	29274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019678	AC	3	6	29302	29307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019678	AAGT	2	8	32560	32567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019678	AGA	2	6	32573	32578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019678	AG	3	6	33548	33553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019678	CAA	2	6	33591	33596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019678	A	7	7	33603	33609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019678	ATA	2	6	33615	33620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019678	A	6	6	33634	33639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019678	T	7	7	36407	36413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019678	ATTG	2	8	36456	36463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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