MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 6330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018609	GAA	2	6	1498993	1498998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_018609	AAC	2	6	1499011	1499016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_018609	ATT	2	6	1499929	1499934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_018609	ATT	2	6	1499956	1499961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_018609	TAAA	2	8	1499963	1499970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_018609	ATTT	2	8	1499991	1499998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_018609	ATA	2	6	1500012	1500017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_018609	ATA	2	6	1502114	1502119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_018609	AATTA	2	10	1502123	1502132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_018609	ATTTT	2	10	1502792	1502801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_018609	T	7	7	1502927	1502933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_018609	AGT	2	6	1502948	1502953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_018609	CTAGT	2	10	1502967	1502976	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4014	NC_018609	A	6	6	1503005	1503010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_018609	ATA	3	9	1503014	1503022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_018609	TGA	2	6	1503023	1503028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_018609	AAAT	2	8	1503079	1503086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_018609	TACAAT	2	12	1503099	1503110	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4019	NC_018609	A	6	6	1503152	1503157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_018609	T	7	7	1503170	1503176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_018609	T	6	6	1503178	1503183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_018609	TTTG	2	8	1503220	1503227	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_018609	TAAA	2	8	1503229	1503236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_018609	A	7	7	1503234	1503240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_018609	ATA	2	6	1503252	1503257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_018609	A	6	6	1509045	1509050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_018609	AAAAT	2	10	1509173	1509182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_018609	TAA	2	6	1509185	1509190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_018609	A	7	7	1510055	1510061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_018609	ATT	3	9	1510074	1510082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_018609	ATTTT	2	10	1510099	1510108	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_018609	TAT	2	6	1510116	1510121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_018609	TAAA	2	8	1510285	1510292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_018609	A	6	6	1510290	1510295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_018609	ACT	2	6	1510789	1510794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_018609	A	7	7	1510818	1510824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_018609	ATT	2	6	1510831	1510836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_018609	ATT	2	6	1512244	1512249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_018609	CTCA	2	8	1513048	1513055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_018609	TAGTA	2	10	1515180	1515189	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_018609	T	8	8	1515222	1515229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_018609	AAT	2	6	1516542	1516547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_018609	AGA	2	6	1516565	1516570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_018609	T	6	6	1516582	1516587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_018609	TAA	2	6	1516645	1516650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_018609	TAA	2	6	1518077	1518082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_018609	ATT	2	6	1518099	1518104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_018609	TACTA	2	10	1518141	1518150	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4049	NC_018609	GGA	3	9	1518193	1518201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_018609	TAGA	2	8	1518227	1518234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_018609	AAC	2	6	1518241	1518246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_018609	ATTT	2	8	1518248	1518255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_018609	T	6	6	1518343	1518348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_018609	A	8	8	1518350	1518357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_018609	TAT	2	6	1518394	1518399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_018609	TAT	2	6	1518412	1518417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_018609	ATA	2	6	1518438	1518443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_018609	GGT	2	6	1518445	1518450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_018609	AT	3	6	1518467	1518472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_018609	TAA	2	6	1518486	1518491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_018609	ATTT	2	8	1519540	1519547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_018609	TAA	2	6	1519558	1519563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_018609	TTTTA	2	10	1521236	1521245	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_018609	A	6	6	1521261	1521266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_018609	ATA	2	6	1521270	1521275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_018609	TA	3	6	1521283	1521288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_018609	TTAC	2	8	1521293	1521300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_018609	TAAA	2	8	1521331	1521338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_018609	TAA	2	6	1521340	1521345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_018609	A	6	6	1521344	1521349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_018609	TAAA	2	8	1521359	1521366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_018609	A	6	6	1521364	1521369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_018609	GGT	2	6	1521454	1521459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4075	NC_018609	AAT	2	6	1521499	1521504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_018609	T	6	6	1521515	1521520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_018609	TA	3	6	1521542	1521547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_018609	A	6	6	1521615	1521620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_018609	ACA	2	6	1521666	1521671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_018609	TAT	2	6	1521682	1521687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_018609	A	6	6	1522882	1522887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_018609	A	6	6	1522895	1522900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_018609	CTT	2	6	1524378	1524383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_018609	ATA	3	9	1524586	1524594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_018609	CTA	2	6	1524622	1524627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4088	NC_018609	ATT	2	6	1524729	1524734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_018609	T	6	6	1524733	1524738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_018609	A	7	7	1524746	1524752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_018609	AAATT	2	10	1524773	1524782	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_018609	ATT	2	6	1534907	1534912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_018609	CTA	2	6	1534922	1534927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4095	NC_018609	TAG	2	6	1534937	1534942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4097	NC_018609	TGTC	2	8	1534995	1535002	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_018609	A	7	7	1535009	1535015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_018609	A	9	9	1535024	1535032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_018609	A	8	8	1535038	1535045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_018609	CA	3	6	1535046	1535051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_018609	C	6	6	1535075	1535080	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4103	NC_018609	CTATAT	2	12	1535184	1535195	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4104	NC_018609	TA	3	6	1535200	1535205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_018609	TAT	2	6	1535218	1535223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_018609	ATT	2	6	1535265	1535270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_018609	ATA	2	6	1535290	1535295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_018609	T	6	6	1535327	1535332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_018609	TC	3	6	1535334	1535339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_018609	GTA	2	6	1535397	1535402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_018609	T	6	6	1535407	1535412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_018609	ATT	2	6	1535952	1535957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_018609	T	8	8	1535956	1535963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_018609	TAA	2	6	1535970	1535975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_018609	ACC	2	6	1535976	1535981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_018609	TAT	2	6	1535993	1535998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_018609	GTA	2	6	1536000	1536005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_018609	A	9	9	1536023	1536031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_018609	TG	4	8	1536043	1536050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_018609	GTA	2	6	1536056	1536061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_018609	A	7	7	1536069	1536075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_018609	ATA	2	6	1536108	1536113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_018609	AGT	3	9	1536132	1536140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_018609	CTAA	2	8	1536420	1536427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_018609	AT	3	6	1536433	1536438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_018609	TCTAC	2	10	1536453	1536462	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4127	NC_018609	AAAT	2	8	1536482	1536489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_018609	TAA	2	6	1536494	1536499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_018609	TAA	2	6	1536504	1536509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_018609	A	7	7	1537201	1537207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_018609	ATT	2	6	1537210	1537215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_018609	TCT	2	6	1537243	1537248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_018609	TTA	2	6	1537714	1537719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4135	NC_018609	AGT	2	6	1538003	1538008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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