MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 11820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017584	CTC	2	6	4215874	4215879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11502	NC_017584	CGC	2	6	4215967	4215972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11503	NC_017584	TCC	2	6	4215976	4215981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11504	NC_017584	CGGC	2	8	4217757	4217764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11505	NC_017584	AAGG	2	8	4217793	4217800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_017584	CCG	2	6	4220382	4220387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11507	NC_017584	CGGG	3	12	4220415	4220426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11508	NC_017584	TGG	2	6	4220850	4220855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_017584	GCG	2	6	4220867	4220872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_017584	CGG	2	6	4220888	4220893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_017584	GCG	2	6	4222107	4222112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_017584	CGGC	2	8	4222135	4222142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11513	NC_017584	GCG	2	6	4222147	4222152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_017584	GGGC	2	8	4222430	4222437	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11515	NC_017584	CGG	2	6	4222471	4222476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_017584	CGC	2	6	4222526	4222531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11517	NC_017584	GAC	2	6	4223289	4223294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_017584	GCGG	2	8	4223318	4223325	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11519	NC_017584	A	6	6	4223326	4223331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_017584	TGG	2	6	4223364	4223369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_017584	CGA	2	6	4225409	4225414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_017584	CGA	2	6	4225467	4225472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_017584	TCC	2	6	4226526	4226531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11524	NC_017584	CAT	2	6	4226557	4226562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_017584	CCCAT	2	10	4226578	4226587	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11526	NC_017584	CAAT	2	8	4226603	4226610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11527	NC_017584	GC	3	6	4226647	4226652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11528	NC_017584	ATT	2	6	4226670	4226675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_017584	G	6	6	4226692	4226697	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_017584	CCCCG	2	10	4227857	4227866	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11531	NC_017584	GGGCG	2	10	4227869	4227878	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11532	NC_017584	TGA	2	6	4227881	4227886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_017584	CGG	2	6	4228937	4228942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_017584	CCG	2	6	4228964	4228969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11535	NC_017584	GGC	2	6	4229039	4229044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_017584	CTT	2	6	4229049	4229054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_017584	T	6	6	4229053	4229058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_017584	T	6	6	4229064	4229069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_017584	GGGCG	2	10	4229070	4229079	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11540	NC_017584	TTG	2	6	4229153	4229158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_017584	CGG	2	6	4229164	4229169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_017584	AGG	2	6	4229840	4229845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_017584	TGT	2	6	4233200	4233205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_017584	TC	3	6	4233271	4233276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11545	NC_017584	CGC	2	6	4233289	4233294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11546	NC_017584	CGGG	2	8	4234449	4234456	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11547	NC_017584	G	6	6	4234454	4234459	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_017584	GC	3	6	4234464	4234469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_017584	CGG	2	6	4234476	4234481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_017584	GAA	2	6	4237240	4237245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_017584	GCT	2	6	4237314	4237319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_017584	T	6	6	4237344	4237349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_017584	GCC	2	6	4237389	4237394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11554	NC_017584	GAA	2	6	4237964	4237969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_017584	CGG	3	9	4237987	4237995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_017584	GAGG	2	8	4238056	4238063	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_017584	G	6	6	4239319	4239324	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_017584	TCCG	2	8	4239417	4239424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11559	NC_017584	GCG	2	6	4239468	4239473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_017584	C	6	6	4239489	4239494	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11561	NC_017584	CCG	3	9	4239513	4239521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11562	NC_017584	ACG	2	6	4240659	4240664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_017584	GCC	2	6	4240704	4240709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11564	NC_017584	C	6	6	4240708	4240713	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11565	NC_017584	GAG	2	6	4240723	4240728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_017584	CAGGCG	2	12	4243500	4243511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_017584	G	6	6	4243561	4243566	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_017584	TC	3	6	4244274	4244279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11569	NC_017584	GAGG	2	8	4244283	4244290	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_017584	GAGG	2	8	4244300	4244307	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_017584	CGG	2	6	4244338	4244343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_017584	G	6	6	4244350	4244355	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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11574	NC_017584	G	7	7	4244420	4244426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_017584	GTCTT	2	10	4244436	4244445	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11576	NC_017584	G	6	6	4244459	4244464	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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11579	NC_017584	CGG	2	6	4244527	4244532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11580	NC_017584	GAT	2	6	4244538	4244543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11582	NC_017584	TCCCC	2	10	4245366	4245375	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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11584	NC_017584	AAG	2	6	4245419	4245424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11593	NC_017584	A	6	6	4250434	4250439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11595	NC_017584	T	6	6	4252323	4252328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_017584	GC	3	6	4252329	4252334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11597	NC_017584	GGT	2	6	4257175	4257180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_017584	G	6	6	4257231	4257236	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_017584	CGG	2	6	4257337	4257342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11604	NC_017584	ATC	2	6	4260063	4260068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_017584	CG	3	6	4260079	4260084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11606	NC_017584	GCG	2	6	4260106	4260111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_017584	GCGGG	2	10	4260370	4260379	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11608	NC_017584	CGG	2	6	4261065	4261070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_017584	GCC	2	6	4261075	4261080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11610	NC_017584	TCGCC	2	10	4262047	4262056	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11611	NC_017584	CCG	2	6	4262105	4262110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11612	NC_017584	GC	4	8	4262125	4262132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11613	NC_017584	A	7	7	4262149	4262155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_017584	A	9	9	4262166	4262174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_017584	TAT	2	6	4262220	4262225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11622	NC_017584	GC	3	6	4263148	4263153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11624	NC_017584	TA	3	6	4264057	4264062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11629	NC_017584	GCCC	2	8	4273895	4273902	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.