MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum Po82 chromosome

Total Repeats: 8499

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017574	GCATC	2	10	123	132	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017574	CCA	2	6	146	151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017574	CAA	2	6	269	274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017574	GCC	2	6	280	285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017574	CGG	2	6	309	314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017574	GAC	2	6	338	343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017574	GCG	2	6	1949	1954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017574	GC	3	6	1960	1965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017574	GGC	2	6	1979	1984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017574	ATCCG	2	10	1988	1997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017574	GCC	2	6	2004	2009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017574	ACA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017574	GC	3	6	2183	2188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017574	CG	3	6	6095	6100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017574	CCA	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017574	TAT	2	6	6147	6152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017574	AT	3	6	6190	6195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017574	CTT	2	6	10902	10907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017574	GTT	2	6	10932	10937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017574	TGC	2	6	10949	10954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017574	TGG	2	6	11045	11050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017574	ATGC	2	8	11093	11100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017574	GC	3	6	11128	11133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017574	GCC	2	6	11153	11158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017574	CA	4	8	11176	11183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017574	GGGA	2	8	11251	11258	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017574	TCA	2	6	11279	11284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017574	CGG	2	6	11375	11380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017574	GT	3	6	11430	11435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017574	GCTG	2	8	11658	11665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017574	CGA	2	6	11682	11687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017574	GAGCG	2	10	11692	11701	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017574	TCG	2	6	11780	11785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017574	ACT	3	9	11819	11827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017574	CTA	2	6	11883	11888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017574	GTT	2	6	12006	12011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017574	GA	3	6	13193	13198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017574	TCGG	2	8	14135	14142	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017574	TGT	2	6	14144	14149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017574	GGTC	2	8	14175	14182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017574	CCCAG	2	10	14194	14203	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_017574	CCG	2	6	14243	14248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017574	CCA	2	6	14252	14257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017574	GAG	2	6	14286	14291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017574	CGG	2	6	14298	14303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017574	GAG	2	6	14304	14309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017574	GCT	2	6	14389	14394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017574	CCGG	2	8	16809	16816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017574	GTCG	2	8	16822	16829	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017574	ACCT	2	8	16845	16852	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017574	AGG	3	9	16928	16936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017574	TGT	2	6	17017	17022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017574	CGG	2	6	17023	17028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017574	CAAC	2	8	17075	17082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017574	GC	3	6	17272	17277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017574	GAT	2	6	17365	17370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017574	GGC	2	6	17371	17376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017574	GAG	2	6	17386	17391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017574	TG	3	6	19558	19563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017574	ACGCT	2	10	19609	19618	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017574	GCCTGC	2	12	19627	19638	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017574	CCG	2	6	19645	19650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017574	GCA	2	6	19688	19693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017574	CAA	2	6	19698	19703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017574	GCCGGC	2	12	19722	19733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017574	CGCT	2	8	19741	19748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017574	AGA	2	6	19797	19802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017574	GC	4	8	20345	20352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017574	GCCA	2	8	20395	20402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017574	GAA	2	6	20440	20445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017574	AAG	2	6	20505	20510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017574	TAA	2	6	20514	20519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017574	ACCA	2	8	20524	20531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017574	TGC	2	6	20603	20608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017574	GTGA	2	8	20643	20650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017574	CTCCG	2	10	23988	23997	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_017574	T	8	8	24008	24015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017574	TTGC	2	8	24864	24871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017574	GGA	2	6	26315	26320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017574	CAC	2	6	26359	26364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017574	CA	3	6	26432	26437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017574	CT	3	6	26450	26455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017574	GCAAT	2	10	26473	26482	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017574	CCA	2	6	26532	26537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017574	AGC	2	6	26645	26650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017574	GAT	2	6	26651	26656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017574	GAC	2	6	26661	26666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017574	GAC	2	6	27459	27464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017574	CG	4	8	27506	27513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017574	GTGC	2	8	27571	27578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017574	CTC	2	6	27622	27627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017574	TATC	2	8	27654	27661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017574	GC	3	6	27680	27685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017574	TCT	2	6	27686	27691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017574	TCT	2	6	27711	27716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017574	TC	3	6	28723	28728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017574	CGC	2	6	28755	28760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017574	C	8	8	28796	28803	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_017574	TCA	2	6	29794	29799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017574	CG	3	6	31008	31013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017574	CCGCC	2	10	31055	31064	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
102	NC_017574	GAGGG	2	10	31065	31074	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017574	GC	3	6	31101	31106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017574	C	6	6	31124	31129	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_017574	GC	4	8	31154	31161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017574	GCCC	2	8	32829	32836	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_017574	GGT	2	6	32864	32869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017574	ACG	2	6	32914	32919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017574	GCG	2	6	32955	32960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017574	ACC	2	6	33027	33032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017574	GCCAT	2	10	33059	33068	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017574	GCA	2	6	33083	33088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017574	CGAT	2	8	34072	34079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017574	CCGC	2	8	38632	38639	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_017574	CGG	2	6	38682	38687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017574	AGG	2	6	38706	38711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017574	GAT	2	6	41563	41568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017574	CGG	2	6	41569	41574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017574	GCGCC	2	10	41583	41592	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_017574	CCG	2	6	42444	42449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017574	CGC	2	6	42506	42511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017574	GGC	2	6	49909	49914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017574	ACC	2	6	49957	49962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017574	GCA	2	6	49967	49972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017574	GC	3	6	49983	49988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017574	CGC	2	6	50021	50026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017574	A	6	6	50032	50037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017574	GCG	2	6	50045	50050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017574	CCG	2	6	50053	50058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017574	AGTC	2	8	50061	50068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017574	GCGA	2	8	50085	50092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017574	ACC	2	6	50155	50160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017574	CA	3	6	50264	50269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017574	CGA	2	6	50286	50291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017574	ATG	2	6	50323	50328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017574	CG	4	8	50337	50344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017574	CA	3	6	50373	50378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017574	AT	3	6	50380	50385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017574	AT	3	6	50392	50397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017574	CAGC	2	8	51763	51770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017574	TCAG	2	8	51842	51849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017574	CGG	2	6	51850	51855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017574	TCG	2	6	51889	51894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017574	GGC	2	6	51940	51945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017574	TCC	2	6	52003	52008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_017574	GCC	2	6	52029	52034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017574	GCG	2	6	52042	52047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_017574	CGG	2	6	115650	115655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_017574	CGCCT	2	10	117610	117619	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
292	NC_017574	TGC	2	6	117667	117672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_017574	GAG	2	6	117733	117738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017574	ACG	2	6	117739	117744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_017574	CA	3	6	117746	117751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
296	NC_017574	TGG	2	6	117820	117825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
297	NC_017574	CTC	2	6	118065	118070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
298	NC_017574	CCG	2	6	118628	118633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
299	NC_017574	TCC	2	6	118639	118644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_017574	CGG	2	6	119430	119435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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304	NC_017574	TG	3	6	123175	123180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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310	NC_017574	GCCC	2	8	124058	124065	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
311	NC_017574	CTC	2	6	124073	124078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
312	NC_017574	CTC	2	6	124084	124089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
313	NC_017574	TCGG	2	8	124106	124113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
314	NC_017574	CGCGG	2	10	124123	124132	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
315	NC_017574	CCACA	2	10	125398	125407	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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330	NC_017574	GAA	2	6	133484	133489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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336	NC_017574	CTG	2	6	138023	138028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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339	NC_017574	GCG	2	6	140457	140462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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352	NC_017574	GGC	2	6	140857	140862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_017574	GC	3	6	167341	167346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
422	NC_017574	GAT	2	6	167349	167354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_017574	GGCCA	2	10	167400	167409	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
424	NC_017574	GCC	2	6	167415	167420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_017574	G	6	6	167468	167473	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
426	NC_017574	CGG	3	9	167498	167506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_017574	GCG	2	6	167524	167529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_017574	GGC	2	6	167561	167566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_017574	GCG	2	6	167623	167628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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433	NC_017574	GCG	2	6	167677	167682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_017574	GGT	2	6	167688	167693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017574	AGA	2	6	177022	177027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_017574	GGC	2	6	177125	177130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_017574	GCC	3	9	177169	177177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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458	NC_017574	GCC	2	6	178647	178652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_017574	GAA	2	6	182121	182126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017574	TC	3	6	183286	183291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
463	NC_017574	GCC	2	6	183301	183306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
464	NC_017574	GC	3	6	183319	183324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
465	NC_017574	ATG	2	6	183330	183335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
466	NC_017574	GA	3	6	183438	183443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
467	NC_017574	GCG	2	6	183451	183456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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