MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq203

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017092	GCC	2	6	52	57	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017092	TGCGCA	2	12	73	84	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017092	GAG	2	6	100	105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017092	GTT	2	6	138	143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017092	GAGC	2	8	639	646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017092	T	6	6	653	658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017092	TGG	2	6	675	680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017092	TGT	2	6	765	770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017092	GGC	2	6	859	864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017092	GA	3	6	888	893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017092	GA	3	6	934	939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017092	AGC	2	6	1049	1054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017092	CTGC	2	8	1056	1063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017092	CCA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017092	CG	3	6	1107	1112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017092	CG	4	8	1146	1153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017092	AC	4	8	1209	1216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017092	CCG	2	6	1250	1255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017092	ATT	2	6	1262	1267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017092	ACGAC	2	10	1285	1294	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017092	GT	3	6	1319	1324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017092	CGC	2	6	1407	1412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017092	TGTC	2	8	1426	1433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017092	GCC	2	6	1462	1467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017092	AGT	2	6	1954	1959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017092	TAA	2	6	1965	1970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017092	GAA	2	6	1975	1980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017092	GA	3	6	1982	1987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017092	GCG	2	6	2073	2078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017092	N	1950	1950	2140	4089	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017092	T	6	6	6663	6668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017092	TTG	2	6	6702	6707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017092	ACTAA	2	10	6744	6753	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017092	TTAGT	2	10	6767	6776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017092	TATC	2	8	6846	6853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017092	ATA	2	6	6894	6899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017092	ATT	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017092	TTAT	2	8	6970	6977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017092	TC	3	6	7002	7007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017092	T	7	7	7058	7064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017092	AAAC	2	8	7084	7091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017092	GTCG	2	8	7452	7459	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017092	T	6	6	7478	7483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017092	CAT	2	6	7555	7560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017092	AATC	2	8	7586	7593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017092	TCA	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017092	TTC	2	6	7625	7630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017092	CAAT	2	8	7660	7667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017092	TTG	2	6	7913	7918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017092	A	6	6	7927	7932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017092	T	6	6	7952	7957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017092	CACCG	2	10	7996	8005	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_017092	CGC	2	6	8081	8086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.