MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 8027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017066	AGATA	2	10	510377	510386	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017066	TAA	2	6	510399	510404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017066	AT	3	6	510415	510420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017066	TA	3	6	510456	510461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017066	TGT	2	6	510532	510537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017066	AAGTA	2	10	510578	510587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017066	TAT	2	6	510597	510602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017066	TA	3	6	510612	510617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017066	TCT	2	6	510638	510643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_017066	TAC	2	6	510666	510671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_017066	T	6	6	510684	510689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017066	TTA	2	6	510705	510710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017066	TCA	2	6	510716	510721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_017066	AAT	2	6	510757	510762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017066	T	8	8	510773	510780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017066	AAG	2	6	510819	510824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017066	ATA	2	6	510837	510842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017066	GAAA	2	8	510878	510885	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017066	TACA	2	8	512980	512987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_017066	TGT	2	6	513051	513056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017066	TAAAAA	2	12	513077	513088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017066	A	7	7	517778	517784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017066	TAT	2	6	517832	517837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017066	T	6	6	517851	517856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017066	AAGAAC	2	12	517889	517900	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3527	NC_017066	T	6	6	517989	517994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_017066	CGTG	2	8	518000	518007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3530	NC_017066	TAA	2	6	518037	518042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_017066	ATG	2	6	518627	518632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017066	AAAT	2	8	518635	518642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017066	ACA	2	6	518646	518651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_017066	TCT	2	6	521160	521165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3540	NC_017066	TCT	2	6	521297	521302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_017066	T	7	7	521325	521331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017066	TAC	2	6	521341	521346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3544	NC_017066	AAT	2	6	522032	522037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017066	TTA	3	9	522039	522047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_017066	T	6	6	522057	522062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017066	ATTA	2	8	522063	522070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3549	NC_017066	ATA	2	6	522136	522141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3552	NC_017066	AAC	2	6	523872	523877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_017066	T	7	7	523888	523894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017066	ATTT	2	8	523895	523902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017066	T	6	6	523900	523905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3559	NC_017066	ATT	2	6	525943	525948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017066	GTT	2	6	525958	525963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017066	T	6	6	525962	525967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017066	AATATA	2	12	526006	526017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017066	TAA	2	6	526021	526026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017066	TGT	2	6	526939	526944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017066	ATATT	2	10	526975	526984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017066	T	6	6	527039	527044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017066	TAA	2	6	527053	527058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017066	TAT	3	9	527069	527077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_017066	GTAAC	2	10	527098	527107	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3570	NC_017066	GTA	2	6	528504	528509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3606	NC_017066	T	6	6	533995	534000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017066	ATT	2	6	534009	534014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3612	NC_017066	A	7	7	534687	534693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3624	NC_017066	GGTCA	2	10	536791	536800	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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