MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 8027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_017066	ATT	2	6	951105	951110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_017066	T	6	6	951120	951125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_017066	TTATT	2	10	951163	951172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_017066	ACT	2	6	951330	951335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_017066	ATC	2	6	951382	951387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_017066	ATTTCT	2	12	951389	951400	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7008	NC_017066	AC	3	6	951415	951420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_017066	TAA	2	6	951434	951439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_017066	CAATA	2	10	951446	951455	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7011	NC_017066	TCTT	2	8	951497	951504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7012	NC_017066	ACA	2	6	951505	951510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_017066	CATT	2	8	951514	951521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7014	NC_017066	ATT	2	6	951549	951554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_017066	CAA	2	6	951718	951723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_017066	AT	3	6	951739	951744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_017066	AT	3	6	951856	951861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_017066	CAATA	2	10	951899	951908	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7019	NC_017066	T	6	6	951963	951968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_017066	A	6	6	951981	951986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_017066	A	6	6	952043	952048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_017066	AAT	2	6	952051	952056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_017066	A	6	6	952081	952086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_017066	CAA	2	6	952181	952186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_017066	GTA	2	6	952211	952216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_017066	AAT	2	6	952229	952234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_017066	ATTA	2	8	952247	952254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_017066	TGT	2	6	952263	952268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_017066	TTA	2	6	952280	952285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_017066	TATG	2	8	952317	952324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_017066	GT	3	6	952409	952414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_017066	ATT	2	6	952432	952437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_017066	TAAT	2	8	952464	952471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_017066	AAT	2	6	952493	952498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_017066	ATAAC	2	10	952501	952510	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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7037	NC_017066	AATA	2	8	952556	952563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_017066	TTTC	2	8	952574	952581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7039	NC_017066	A	6	6	954389	954394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7041	NC_017066	AAT	2	6	954484	954489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_017066	TAT	2	6	954493	954498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_017066	ATA	2	6	954499	954504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_017066	TA	3	6	954503	954508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_017066	TAAAT	2	10	954788	954797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_017066	ATT	2	6	956101	956106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_017066	TGT	2	6	956239	956244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7049	NC_017066	GAT	2	6	956280	956285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7051	NC_017066	AAC	2	6	956327	956332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_017066	TAT	2	6	956369	956374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7055	NC_017066	TACAA	2	10	956417	956426	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7056	NC_017066	ACA	2	6	956522	956527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_017066	CATA	2	8	956535	956542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7058	NC_017066	A	6	6	956573	956578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_017066	TAT	2	6	956579	956584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_017066	TTG	2	6	956640	956645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7062	NC_017066	TAT	2	6	956705	956710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_017066	AAT	2	6	956724	956729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_017066	CAA	2	6	956778	956783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_017066	CAT	2	6	956791	956796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7073	NC_017066	TAC	2	6	957994	957999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7105	NC_017066	TCAAG	2	10	961876	961885	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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7118	NC_017066	TA	3	6	962786	962791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_017066	ATT	2	6	962794	962799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_017066	AT	3	6	962897	962902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_017066	CAG	2	6	962949	962954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7123	NC_017066	TAAA	2	8	964206	964213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7131	NC_017066	A	6	6	964925	964930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_017066	TG	3	6	965860	965865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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