MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 7521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017065	A	6	6	66661	66666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017065	ATT	2	6	66670	66675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017065	TAA	2	6	66688	66693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017065	TAA	2	6	67099	67104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017065	TAGT	2	8	67118	67125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017065	A	7	7	67134	67140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017065	GCA	2	6	67152	67157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017065	ATAA	2	8	69187	69194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017065	GTAA	2	8	69235	69242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017065	AGT	2	6	70611	70616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017065	A	7	7	70623	70629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017065	TAAAT	2	10	70630	70639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017065	ACT	2	6	70680	70685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017065	TAT	2	6	70704	70709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017065	ACT	2	6	70710	70715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017065	ATT	2	6	70718	70723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017065	AT	3	6	73040	73045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017065	TAT	2	6	73058	73063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017065	GCT	2	6	73086	73091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017065	AAGT	2	8	73132	73139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017065	AGA	2	6	73244	73249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017065	AGA	2	6	73328	73333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017065	ACATA	2	10	73358	73367	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
525	NC_017065	GCA	2	6	73458	73463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017065	GCA	2	6	73467	73472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017065	ATA	2	6	73494	73499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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529	NC_017065	GTA	2	6	73554	73559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017065	GTT	2	6	73594	73599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017065	TTA	2	6	73669	73674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017065	GCC	2	6	73687	73692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_017065	GCT	2	6	73703	73708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017065	CTT	2	6	74199	74204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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538	NC_017065	TCC	2	6	74308	74313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_017065	AAG	2	6	74331	74336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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541	NC_017065	TAA	3	9	74433	74441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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543	NC_017065	T	6	6	74571	74576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017065	CAAT	2	8	74750	74757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_017065	A	6	6	74764	74769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017065	TGC	2	6	74774	74779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017065	T	6	6	74797	74802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017065	TGA	2	6	74840	74845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017065	TC	3	6	74941	74946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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551	NC_017065	GATTA	2	10	75001	75010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017065	TAA	2	6	75030	75035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017065	GCT	3	9	75219	75227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017065	TGA	2	6	75260	75265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017065	AAC	2	6	75319	75324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017065	TAG	2	6	75388	75393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017065	ATT	2	6	75430	75435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017065	T	6	6	75458	75463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017065	TAAG	2	8	75477	75484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017065	CAA	2	6	75537	75542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017065	GTA	2	6	75551	75556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017065	TGT	2	6	75679	75684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017065	GAT	2	6	75701	75706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017065	GT	3	6	75734	75739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017065	TATAGT	2	12	75751	75762	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017065	AGAA	2	8	75837	75844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017065	TAA	2	6	75861	75866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017065	CAAT	2	8	75973	75980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_017065	TTC	2	6	75995	76000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017065	ATT	2	6	76004	76009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017065	TAT	2	6	76866	76871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017065	AAT	2	6	76872	76877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017065	TAGA	2	8	76895	76902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017065	TAAA	2	8	76916	76923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017065	TAA	2	6	76954	76959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017065	TTTA	2	8	76961	76968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_017065	TAA	2	6	78626	78631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017065	T	6	6	78641	78646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017065	A	6	6	78673	78678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017065	ATT	2	6	78687	78692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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586	NC_017065	TAA	2	6	80063	80068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_017065	TA	4	8	84633	84640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017065	AAAT	2	8	84658	84665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017065	ATACA	2	10	84740	84749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
591	NC_017065	GTA	2	6	84750	84755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017065	AT	5	10	84757	84766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017065	ATA	3	9	84776	84784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017065	AT	4	8	87672	87679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017065	TAA	2	6	87715	87720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_017065	ATA	3	9	87990	87998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_017065	TAT	2	6	88058	88063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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609	NC_017065	ATT	3	9	88152	88160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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612	NC_017065	A	6	6	88480	88485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017065	TATC	2	8	88498	88505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_017065	A	7	7	88509	88515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017065	TA	3	6	88522	88527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017065	AGA	2	6	88533	88538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_017065	GAA	2	6	88616	88621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017065	ATT	2	6	88627	88632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017065	GGA	2	6	88666	88671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017065	TAA	2	6	88779	88784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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626	NC_017065	TAA	2	6	88861	88866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017065	CAA	2	6	88868	88873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017065	ATA	2	6	88943	88948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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630	NC_017065	TAA	2	6	89465	89470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017065	TA	3	6	89861	89866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017065	TGT	2	6	89896	89901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017065	AGC	2	6	89925	89930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017065	ATA	2	6	89957	89962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017065	A	7	7	90016	90022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017065	CAA	2	6	90033	90038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_017065	TGC	2	6	91277	91282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017065	TCC	2	6	91303	91308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_017065	TTA	2	6	91309	91314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017065	TAA	2	6	91349	91354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017065	TAA	2	6	91359	91364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017065	AGG	2	6	93120	93125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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