MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 7521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017065	TAA	2	6	951168	951173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017065	TTTATC	2	12	951211	951222	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5503	NC_017065	T	6	6	951242	951247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017065	CAAAT	2	10	951264	951273	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5505	NC_017065	T	6	6	951307	951312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017065	ATTT	2	8	951339	951346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017065	T	6	6	951909	951914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017065	CCGATA	2	12	951932	951943	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_017065	GAA	2	6	952027	952032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017065	TAA	2	6	953058	953063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017065	ATT	2	6	953072	953077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_017065	TAC	2	6	953090	953095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_017065	AT	3	6	953103	953108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017065	GCA	2	6	953158	953163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_017065	TAC	2	6	953173	953178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_017065	CGA	2	6	953211	953216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_017065	AG	3	6	953236	953241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017065	CTC	2	6	953259	953264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_017065	TTG	2	6	953273	953278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017065	CA	3	6	953336	953341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_017065	CCT	2	6	953348	953353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_017065	AAAG	2	8	954509	954516	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017065	GTAA	2	8	954527	954534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017065	ATT	2	6	954560	954565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017065	AT	4	8	954585	954592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017065	TCC	2	6	954626	954631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_017065	CAT	2	6	954664	954669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_017065	AGC	2	6	954700	954705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_017065	ATA	3	9	954733	954741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017065	TTAC	2	8	954765	954772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5531	NC_017065	TA	3	6	956045	956050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017065	ATT	2	6	956082	956087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_017065	AT	3	6	956122	956127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017065	GCT	2	6	956139	956144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_017065	CT	3	6	956143	956148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_017065	A	6	6	956237	956242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017065	TA	3	6	956271	956276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017065	A	6	6	956290	956295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017065	AT	3	6	956329	956334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017065	AAT	2	6	956347	956352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017065	AAT	2	6	956383	956388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_017065	ATT	2	6	956389	956394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017065	AAT	2	6	956427	956432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017065	TTA	2	6	956433	956438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017065	TA	3	6	956449	956454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017065	TTA	2	6	956457	956462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017065	ACAAAA	2	12	956467	956478	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5548	NC_017065	GCT	2	6	956537	956542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_017065	TAT	2	6	956548	956553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017065	TAGA	2	8	956783	956790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017065	AC	3	6	956810	956815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_017065	TAA	2	6	956821	956826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017065	CTTA	2	8	956852	956859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_017065	TACCT	2	10	956895	956904	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5555	NC_017065	ATT	2	6	956976	956981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017065	TAA	2	6	957012	957017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017065	TAA	2	6	957051	957056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017065	AT	3	6	957075	957080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017065	T	8	8	957109	957116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017065	T	6	6	957357	957362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_017065	ACC	2	6	957532	957537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_017065	T	6	6	957708	957713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017065	TAA	2	6	957717	957722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017065	TAA	2	6	957734	957739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017065	TGT	2	6	957741	957746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_017065	TTA	2	6	957747	957752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_017065	TAT	2	6	957793	957798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_017065	AT	3	6	957873	957878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017065	ATT	2	6	957880	957885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017065	C	6	6	957894	957899	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5571	NC_017065	TC	3	6	957911	957916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5572	NC_017065	AT	3	6	957942	957947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017065	AGA	2	6	957976	957981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5577	NC_017065	TAA	2	6	959168	959173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017065	AGTA	2	8	960140	960147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_017065	GGAGC	2	10	960191	960200	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5580	NC_017065	GAC	2	6	960236	960241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5582	NC_017065	A	6	6	962661	962666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017065	TAA	2	6	962675	962680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_017065	GAG	2	6	964340	964345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_017065	TTA	2	6	964355	964360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_017065	ATT	2	6	964528	964533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_017065	AGT	2	6	964544	964549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5596	NC_017065	ATA	2	6	968625	968630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_017065	TTAC	2	8	968882	968889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5598	NC_017065	TAATTT	2	12	968918	968929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5601	NC_017065	TCT	2	6	969099	969104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_017065	TTAA	2	8	969132	969139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017065	TAT	2	6	969152	969157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017065	A	6	6	969228	969233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017065	ATTCT	2	10	969286	969295	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5606	NC_017065	AT	3	6	969328	969333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_017065	TTA	2	6	969339	969344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5610	NC_017065	T	7	7	969399	969405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_017065	AACT	2	8	969415	969422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5612	NC_017065	CTA	2	6	969423	969428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5614	NC_017065	TAA	2	6	969448	969453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5616	NC_017065	AATT	2	8	969562	969569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_017065	AGT	2	6	969587	969592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5619	NC_017065	T	6	6	969627	969632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5621	NC_017065	TA	3	6	969702	969707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017065	ATTT	2	8	969814	969821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_017065	T	6	6	969819	969824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_017065	T	6	6	969845	969850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_017065	T	7	7	969972	969978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5629	NC_017065	TAT	2	6	970161	970166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_017065	TTA	2	6	970180	970185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_017065	TTTA	2	8	970200	970207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_017065	TCA	2	6	970210	970215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5635	NC_017065	TAT	2	6	970307	970312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5636	NC_017065	TGCTCT	2	12	970324	970335	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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