MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 1610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017060	GAG	2	6	148548	148553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017060	TCG	2	6	148606	148611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017060	CGCGC	2	10	148622	148631	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
504	NC_017060	GCG	2	6	148675	148680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017060	GCG	2	6	148740	148745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017060	GCC	3	9	148794	148802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017060	GC	3	6	148810	148815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_017060	GGT	2	6	148877	148882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017060	GC	3	6	148891	148896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_017060	GCG	2	6	148918	148923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017060	GCC	3	9	148938	148946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_017060	AAC	2	6	149097	149102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017060	GCG	2	6	149115	149120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017060	A	6	6	149124	149129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017060	CGG	2	6	149140	149145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017060	GGC	3	9	149193	149201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017060	ACGGC	2	10	149236	149245	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
518	NC_017060	CGC	2	6	149266	149271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_017060	G	6	6	149324	149329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017060	CAT	2	6	149399	149404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017060	CTGG	2	8	149424	149431	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
522	NC_017060	TGA	2	6	149438	149443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017060	TGCAT	2	10	149452	149461	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
524	NC_017060	ACC	2	6	149716	149721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_017060	GTC	2	6	149729	149734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017060	TGG	2	6	149793	149798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017060	A	7	7	149807	149813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017060	GAC	2	6	149822	149827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017060	GCT	2	6	149872	149877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017060	AAC	2	6	149959	149964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017060	GC	3	6	150042	150047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_017060	GAG	2	6	150086	150091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017060	TGA	2	6	150145	150150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017060	CTC	2	6	150152	150157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_017060	A	6	6	150167	150172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017060	CG	3	6	150356	150361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_017060	CGG	2	6	150388	150393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017060	GGC	2	6	150400	150405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017060	AAG	2	6	150408	150413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017060	GAA	2	6	150457	150462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017060	A	6	6	150461	150466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017060	TGA	3	9	150493	150501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017060	GA	3	6	150615	150620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017060	TCC	2	6	150647	150652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_017060	CTG	2	6	150664	150669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017060	CCG	2	6	150779	150784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_017060	TGC	2	6	150814	150819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017060	A	6	6	150899	150904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017060	CGG	2	6	150920	150925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017060	GCG	2	6	151903	151908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017060	AAAG	2	8	152007	152014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017060	CTG	2	6	152040	152045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017060	GAT	2	6	152052	152057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017060	ATAA	2	8	153288	153295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017060	A	6	6	153294	153299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017060	A	6	6	154215	154220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017060	TTG	2	6	154230	154235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017060	T	6	6	156432	156437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017060	GAG	2	6	156457	156462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017060	TAAA	2	8	156488	156495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017060	TAA	2	6	156549	156554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017060	TA	3	6	156563	156568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017060	A	6	6	157404	157409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017060	GGC	2	6	158866	158871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017060	T	6	6	159389	159394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017060	A	7	7	159429	159435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017060	CA	3	6	159558	159563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_017060	CAA	2	6	159632	159637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017060	TTCCC	2	10	159664	159673	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
570	NC_017060	TCCC	2	8	159697	159704	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
571	NC_017060	CG	3	6	159775	159780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
572	NC_017060	TCAT	2	8	159827	159834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
573	NC_017060	AC	3	6	159903	159908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017060	GTT	2	6	159916	159921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017060	GGA	2	6	162546	162551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017060	AAGC	2	8	162576	162583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_017060	ACCCC	2	10	162609	162618	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
578	NC_017060	GGGA	2	8	162636	162643	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017060	CTC	2	6	162695	162700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_017060	AGAT	2	8	164882	164889	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017060	AGC	2	6	164942	164947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017060	TGA	2	6	164962	164967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017060	A	6	6	165013	165018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017060	TTA	2	6	165072	165077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017060	CCG	2	6	170475	170480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_017060	T	6	6	171397	171402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017060	CGC	2	6	171416	171421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_017060	TTA	2	6	171441	171446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017060	GCT	2	6	172380	172385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_017060	AGC	2	6	172401	172406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017060	ATC	2	6	173435	173440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017060	TGA	2	6	174748	174753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017060	CA	3	6	174792	174797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_017060	ATC	2	6	174832	174837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017060	TTA	2	6	174892	174897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017060	CGG	2	6	174934	174939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017060	A	6	6	174943	174948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017060	A	7	7	175058	175064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017060	CAA	2	6	175065	175070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_017060	ATA	2	6	175156	175161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017060	TATG	2	8	175210	175217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017060	TTAATT	2	12	175218	175229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017060	A	6	6	178777	178782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017060	T	7	7	178855	178861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017060	AGC	2	6	181883	181888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017060	A	6	6	183926	183931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017060	ACA	2	6	183981	183986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017060	CAC	2	6	185262	185267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_017060	CCT	2	6	185274	185279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_017060	TAA	2	6	185399	185404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017060	A	7	7	185416	185422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017060	AAGC	2	8	186648	186655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
613	NC_017060	TTA	2	6	188133	188138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017060	GT	3	6	188173	188178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017060	T	7	7	188256	188262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017060	CAG	2	6	188343	188348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017060	A	6	6	189359	189364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017060	AGC	2	6	190506	190511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017060	TGTT	2	8	190525	190532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017060	T	6	6	190548	190553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017060	TGT	2	6	191201	191206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017060	CCACTC	2	12	192364	192375	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_017060	CAA	2	6	192379	192384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017060	GACA	2	8	192412	192419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_017060	TA	4	8	192440	192447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017060	ATA	2	6	192481	192486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017060	T	6	6	192493	192498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017060	GCTG	2	8	192505	192512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
629	NC_017060	GT	3	6	192581	192586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017060	TTA	2	6	192616	192621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017060	TTC	2	6	193917	193922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017060	TAA	2	6	193937	193942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017060	TGA	2	6	193994	193999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017060	CACT	2	8	194026	194033	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_017060	GGC	2	6	194049	194054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017060	A	6	6	194088	194093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017060	TGC	2	6	194686	194691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017060	CATTG	2	10	194702	194711	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
639	NC_017060	A	6	6	194750	194755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017060	GGGA	2	8	196089	196096	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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