MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 9023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017058	CCG	2	6	11	16	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017058	TA	4	8	42	49	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017058	AAT	2	6	79	84	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017058	TAAC	2	8	95	102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017058	AAAATC	2	12	118	129	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017058	TTA	2	6	134	139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017058	ATT	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017058	TA	3	6	194	199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017058	GAATT	2	10	215	224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017058	AGT	2	6	314	319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017058	TAT	2	6	327	332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017058	T	6	6	359	364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017058	TTGC	2	8	607	614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017058	GCC	2	6	652	657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017058	AGG	2	6	674	679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017058	A	7	7	688	694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017058	TA	3	6	695	700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017058	T	6	6	785	790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017058	CAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017058	TTGC	2	8	814	821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017058	GAA	2	6	841	846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017058	GCA	2	6	899	904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017058	ACG	2	6	940	945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017058	TAG	2	6	2125	2130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017058	TCC	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017058	AT	3	6	2612	2617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017058	A	7	7	2626	2632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017058	TAA	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017058	TAAT	2	8	2661	2668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017058	TAA	2	6	4902	4907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017058	ATA	2	6	4930	4935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017058	TA	3	6	4934	4939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017058	TTAA	2	8	4942	4949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017058	A	6	6	4963	4968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017058	T	7	7	5014	5020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017058	T	6	6	5032	5037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017058	AAATT	2	10	5039	5048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017058	T	6	6	5263	5268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017058	TAC	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017058	TGA	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017058	ATT	3	9	5326	5334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017058	ATT	3	9	5352	5360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017058	TTA	2	6	5377	5382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017058	TCAT	2	8	5420	5427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017058	TTA	3	9	5477	5485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017058	AAC	2	6	5491	5496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017058	AT	4	8	5505	5512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017058	TTA	2	6	9067	9072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017058	GCT	2	6	9101	9106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017058	AAT	2	6	9143	9148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017058	TAA	2	6	11793	11798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017058	CAT	2	6	11845	11850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017058	T	6	6	11864	11869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017058	AAC	2	6	11879	11884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017058	TTG	2	6	11893	11898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017058	CGA	2	6	11944	11949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017058	A	6	6	11961	11966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017058	T	7	7	11982	11988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017058	ATT	2	6	11990	11995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017058	TGC	2	6	11997	12002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017058	TCGCT	2	10	12012	12021	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017058	CAA	2	6	12050	12055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017058	CAA	2	6	12058	12063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017058	GTT	2	6	12072	12077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017058	CAA	2	6	12148	12153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017058	A	6	6	20636	20641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017058	T	7	7	20657	20663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017058	GAC	2	6	20708	20713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017058	ATTT	2	8	23173	23180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017058	GCT	2	6	23249	23254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017058	TTG	2	6	23264	23269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017058	T	6	6	23375	23380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017058	CTAC	2	8	23389	23396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017058	A	6	6	23737	23742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017058	TTA	2	6	23825	23830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017058	CT	3	6	23850	23855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017058	TAAT	2	8	23856	23863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017058	TCT	2	6	23864	23869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017058	ATT	2	6	23878	23883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017058	ATC	2	6	23887	23892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017058	TAT	2	6	23931	23936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017058	TTG	2	6	24009	24014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017058	GTTAA	2	10	24020	24029	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017058	TAA	2	6	24034	24039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017058	T	6	6	24045	24050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017058	ATT	2	6	24091	24096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017058	TAA	2	6	24109	24114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017058	ATA	2	6	24131	24136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017058	A	8	8	24145	24152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017058	T	6	6	24204	24209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017058	AAC	2	6	24253	24258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017058	TAC	2	6	24262	24267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017058	ATA	3	9	24315	24323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017058	ATT	2	6	24326	24331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017058	T	6	6	24361	24366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017058	TA	4	8	24431	24438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017058	TAA	2	6	24475	24480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017058	AAT	2	6	24489	24494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017058	AAT	3	9	24503	24511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017058	AGC	2	6	24512	24517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017058	TGC	2	6	24543	24548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017058	ACT	2	6	24554	24559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017058	TAT	2	6	24566	24571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017058	GAA	2	6	24600	24605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017058	T	6	6	25265	25270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017058	TTA	2	6	25323	25328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017058	GTC	2	6	25343	25348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017058	AAG	2	6	25354	25359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017058	CA	3	6	25417	25422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017058	AAACC	2	10	25446	25455	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017058	CAA	2	6	25459	25464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017058	GCT	2	6	25586	25591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017058	AAT	2	6	25601	25606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017058	AAT	2	6	25693	25698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017058	A	7	7	25719	25725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017058	TAA	2	6	25726	25731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017058	GAC	2	6	25796	25801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017058	CAAA	2	8	25812	25819	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017058	A	7	7	27448	27454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017058	AATTT	2	10	27465	27474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017058	ATC	2	6	27514	27519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017058	GTT	2	6	27571	27576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017058	CAA	2	6	27633	27638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017058	TAT	2	6	28581	28586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017058	CA	3	6	28640	28645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017058	TAT	2	6	29762	29767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017058	TAT	2	6	29825	29830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017058	CAG	2	6	29857	29862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017058	TGC	2	6	29922	29927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017058	GTT	2	6	29935	29940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017058	CTAT	2	8	29947	29954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017058	TTA	2	6	29999	30004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017058	ATC	2	6	30007	30012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017058	ATT	3	9	30018	30026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017058	T	7	7	30034	30040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017058	TA	3	6	30044	30049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017058	TAA	2	6	30065	30070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017058	TAA	2	6	30073	30078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017058	T	6	6	30079	30084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017058	TGAT	2	8	30090	30097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017058	TA	3	6	30154	30159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017058	A	6	6	30260	30265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017058	CTTGC	2	10	30312	30321	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017058	ATT	2	6	30347	30352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017058	T	10	10	30367	30376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017058	CTA	2	6	30384	30389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017058	TAT	2	6	30439	30444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017058	GAG	2	6	30623	30628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017058	A	6	6	30634	30639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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