MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 9023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017058	ACT	2	6	559134	559139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017058	GTA	2	6	559150	559155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017058	GAT	2	6	559159	559164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017058	AGG	2	6	559201	559206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017058	TTTC	2	8	559334	559341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_017058	GAA	2	6	559463	559468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017058	TGG	2	6	559487	559492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017058	CA	4	8	559533	559540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_017058	GTC	2	6	559555	559560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_017058	TCGTG	2	10	559564	559573	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4011	NC_017058	GGA	2	6	559669	559674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017058	GAC	2	6	559682	559687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_017058	TCA	2	6	559694	559699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017058	AC	3	6	559888	559893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_017058	GGT	2	6	559929	559934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017058	CCT	2	6	560027	560032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_017058	T	6	6	560151	560156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017058	AATTA	2	10	560205	560214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017058	ATT	2	6	560253	560258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017058	TA	3	6	560260	560265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017058	T	6	6	560313	560318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017058	TAA	2	6	560323	560328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017058	ATT	2	6	560594	560599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017058	AT	3	6	560603	560608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017058	CTG	2	6	560625	560630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_017058	TTA	2	6	560635	560640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017058	ATTTT	2	10	560664	560673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017058	ATT	2	6	560730	560735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017058	AATTT	2	10	560859	560868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017058	TAT	2	6	560975	560980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017058	GGA	2	6	560983	560988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017058	A	6	6	561025	561030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017058	TAT	2	6	561068	561073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017058	T	6	6	561253	561258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017058	TTA	2	6	561261	561266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017058	TA	3	6	561270	561275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4038	NC_017058	T	6	6	561320	561325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017058	AAGCA	2	10	561358	561367	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4040	NC_017058	A	6	6	561391	561396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017058	TAAT	2	8	561397	561404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017058	AT	3	6	561403	561408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017058	TA	3	6	561433	561438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017058	A	8	8	561453	561460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017058	AGC	2	6	561463	561468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017058	TAA	2	6	561502	561507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017058	TTC	2	6	561517	561522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4049	NC_017058	AAT	2	6	561580	561585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017058	AT	3	6	561584	561589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017058	ATTA	2	8	561592	561599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017058	TAA	2	6	561621	561626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017058	ATA	2	6	561630	561635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017058	A	6	6	561655	561660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017058	AT	3	6	561674	561679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017058	ATT	2	6	561682	561687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017058	TGG	2	6	561695	561700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017058	GCAATA	2	12	561723	561734	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4059	NC_017058	TCAT	2	8	561769	561776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4060	NC_017058	T	6	6	561780	561785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017058	TAT	2	6	561804	561809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017058	CTT	2	6	561829	561834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_017058	ATT	2	6	561960	561965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017058	T	6	6	561970	561975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017058	CAA	2	6	562039	562044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_017058	TA	3	6	562069	562074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017058	T	7	7	562099	562105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017058	AT	3	6	562122	562127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017058	AAG	2	6	562135	562140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017058	TAA	4	12	562143	562154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017058	ATC	2	6	562160	562165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_017058	ATA	2	6	563210	563215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017058	GA	3	6	563220	563225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017058	CAT	2	6	563282	563287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4079	NC_017058	A	6	6	563756	563761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017058	TAG	2	6	564131	564136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_017058	T	7	7	564179	564185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017058	AGA	2	6	564209	564214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017058	A	6	6	564222	564227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017058	GAT	2	6	564234	564239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_017058	CAT	2	6	564972	564977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4091	NC_017058	T	6	6	565039	565044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017058	ATT	2	6	565045	565050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017058	T	7	7	565049	565055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017058	TAC	2	6	565071	565076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4097	NC_017058	ATT	2	6	566339	566344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017058	ATA	2	6	566420	566425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017058	T	8	8	566427	566434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017058	T	7	7	566451	566457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017058	ATTA	2	8	566505	566512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017058	T	6	6	566517	566522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017058	A	6	6	566526	566531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017058	TA	3	6	566541	566546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017058	ATCT	2	8	566822	566829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_017058	GCA	2	6	566833	566838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4109	NC_017058	TAT	2	6	567773	567778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017058	T	7	7	567783	567789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017058	GAT	2	6	568470	568475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4113	NC_017058	CTT	2	6	568602	568607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017058	TTC	2	6	568620	568625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017058	TATT	2	8	568642	568649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017058	ATT	2	6	568656	568661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017058	GAG	2	6	569233	569238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017058	TCGCT	2	10	569289	569298	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4119	NC_017058	ACG	2	6	569306	569311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4122	NC_017058	A	7	7	569349	569355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017058	CAA	2	6	569366	569371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017058	TTAA	2	8	569376	569383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017058	GAA	2	6	569425	569430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017058	AGAAA	2	10	569485	569494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017058	TTTC	2	8	569520	569527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4128	NC_017058	TTA	2	6	569553	569558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017058	GAA	2	6	569666	569671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017058	A	6	6	569741	569746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4132	NC_017058	GAC	2	6	571012	571017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_017058	ACG	2	6	571029	571034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_017058	AGA	2	6	571049	571054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017058	GCA	2	6	571145	571150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_017058	ATT	2	6	571185	571190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4415	NC_017058	A	6	6	620758	620763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4416	NC_017058	A	6	6	620803	620808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4452	NC_017058	AGC	2	6	622724	622729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4472	NC_017058	A	6	6	623558	623563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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