MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 9023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017058	TCG	2	6	185027	185032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_017058	TA	3	6	185047	185052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017058	CTT	2	6	185102	185107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_017058	ATA	3	9	186324	186332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017058	TA	3	6	186366	186371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017058	ATTT	2	8	186386	186393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017058	T	7	7	186391	186397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017058	GTT	2	6	186411	186416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017058	TA	3	6	186435	186440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017058	AAG	2	6	186449	186454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017058	ATT	2	6	186460	186465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017058	AAAATA	2	12	186472	186483	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017058	TTG	2	6	189314	189319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017058	TG	3	6	189318	189323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017058	AGC	2	6	189344	189349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017058	GCA	2	6	189360	189365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_017058	ATA	2	6	189376	189381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017058	CAA	2	6	189454	189459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_017058	TGA	2	6	189494	189499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017058	ATT	2	6	189588	189593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017058	ATTA	2	8	189608	189615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017058	CTT	2	6	189644	189649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_017058	T	6	6	189664	189669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017058	TAA	2	6	189674	189679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017058	ATA	3	9	190269	190277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017058	ATT	2	6	190296	190301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017058	TA	3	6	190387	190392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017058	AATT	2	8	190412	190419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017058	ATA	2	6	192031	192036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017058	A	6	6	192036	192041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017058	GATAAA	2	12	194238	194249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017058	ATTA	2	8	194281	194288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017058	A	6	6	194574	194579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017058	TAA	2	6	194592	194597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017058	AAG	2	6	194612	194617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017058	AG	3	6	194623	194628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017058	TA	3	6	194679	194684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017058	ATA	2	6	194844	194849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017058	AGCTT	2	10	194867	194876	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1540	NC_017058	T	7	7	194878	194884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017058	TAA	2	6	195220	195225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017058	CAG	2	6	195240	195245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_017058	ACA	2	6	195319	195324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017058	GAA	2	6	195382	195387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017058	TGC	2	6	195416	195421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_017058	AAT	2	6	195516	195521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017058	CTT	2	6	196675	196680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017058	AAG	2	6	196685	196690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017058	GTT	2	6	196710	196715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017058	AG	3	6	196762	196767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017058	CAA	2	6	196823	196828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_017058	CGT	2	6	196852	196857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_017058	CT	3	6	198779	198784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_017058	AAT	2	6	198979	198984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017058	GCT	2	6	199015	199020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_017058	ACT	2	6	199059	199064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017058	GAA	2	6	200941	200946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017058	GTA	2	6	200951	200956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017058	CGA	2	6	200960	200965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_017058	T	7	7	200998	201004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017058	ATT	2	6	201006	201011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017058	CAATGA	2	12	201049	201060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1563	NC_017058	A	6	6	201060	201065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017058	GAG	2	6	201530	201535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017058	AAT	2	6	201560	201565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017058	ACAA	2	8	201638	201645	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_017058	AAT	2	6	202183	202188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017058	GAAGA	2	10	202283	202292	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017058	GAG	2	6	202334	202339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017058	A	6	6	202345	202350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017058	GTT	2	6	202736	202741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017058	A	7	7	202824	202830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017058	T	6	6	202835	202840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017058	TTAT	2	8	202883	202890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017058	CAA	2	6	202943	202948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_017058	TAT	2	6	202977	202982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017058	CAA	2	6	202999	203004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_017058	CTT	2	6	205434	205439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_017058	A	6	6	205447	205452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017058	TTG	2	6	207402	207407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017058	GAG	2	6	207432	207437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017058	ATA	2	6	207458	207463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017058	A	7	7	207463	207469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017058	T	6	6	207484	207489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017058	TGC	2	6	207497	207502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_017058	TTC	2	6	207520	207525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_017058	CTT	2	6	207572	207577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_017058	TA	3	6	208321	208326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017058	TA	3	6	208350	208355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017058	AAC	2	6	208385	208390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_017058	A	6	6	208438	208443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017058	TA	3	6	208454	208459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017058	ATT	2	6	208472	208477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017058	TAA	2	6	208793	208798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017058	A	6	6	208809	208814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017058	A	7	7	208822	208828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017058	A	7	7	208878	208884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017058	TTA	2	6	208885	208890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017058	A	6	6	208958	208963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017058	AAT	2	6	208984	208989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017058	TAA	2	6	208990	208995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017058	CTG	2	6	209011	209016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017058	CTC	2	6	209050	209055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_017058	GA	3	6	209101	209106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017058	AC	3	6	209144	209149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_017058	CAA	2	6	209153	209158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_017058	A	6	6	209200	209205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017058	TAA	2	6	209220	209225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017058	A	7	7	209313	209319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017058	GCT	2	6	209329	209334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1612	NC_017058	TTA	2	6	209458	209463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017058	TAA	2	6	209514	209519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017058	TAC	2	6	209528	209533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017058	TGA	2	6	209603	209608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_017058	ATA	2	6	209647	209652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017058	ATT	2	6	209654	209659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017058	CT	3	6	209671	209676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_017058	AAC	2	6	209683	209688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_017058	A	6	6	209699	209704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017058	A	6	6	209713	209718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017058	GAA	2	6	209727	209732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017058	AAAT	2	8	209741	209748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017058	ATT	3	9	209805	209813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017058	ATC	2	6	209821	209826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_017058	GAA	2	6	209886	209891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017058	A	7	7	209934	209940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017058	GAA	2	6	209942	209947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017058	ATA	3	9	209983	209991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017058	GAA	2	6	210027	210032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017058	CAG	2	6	210073	210078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_017058	ATG	2	6	210106	210111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017058	ATAC	2	8	210120	210127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_017058	TTA	2	6	210128	210133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1916	NC_017058	GTA	2	6	273306	273311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1946	NC_017058	TAT	2	6	276182	276187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1952	NC_017058	TAA	2	6	276357	276362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_017058	A	6	6	276377	276382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_017058	GT	3	6	276383	276388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1955	NC_017058	GCT	2	6	276391	276396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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