MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 9023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017058	TA	3	6	125949	125954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017058	A	6	6	125979	125984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017058	TAA	2	6	125998	126003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017058	TTTAA	2	10	126004	126013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017058	TA	3	6	126016	126021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017058	TGT	2	6	126023	126028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017058	ATT	2	6	126029	126034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017058	ATT	2	6	126044	126049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017058	TTGTA	2	10	126085	126094	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017058	AAT	2	6	126095	126100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017058	ATTA	2	8	126123	126130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017058	T	6	6	126714	126719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017058	AGC	2	6	126770	126775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017058	A	7	7	126814	126820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017058	ATCA	2	8	126854	126861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_017058	A	6	6	126885	126890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017058	TAA	2	6	126905	126910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017058	ATT	2	6	127390	127395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017058	TAA	2	6	127396	127401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017058	TAAT	2	8	127491	127498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017058	A	6	6	127519	127524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017058	TAA	3	9	127537	127545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017058	AATTA	2	10	127554	127563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017058	A	7	7	129158	129164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017058	AAC	2	6	129206	129211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017058	AGT	2	6	129301	129306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017058	TTA	2	6	129333	129338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017058	G	6	6	129365	129370	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017058	AAT	2	6	129426	129431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017058	AAGC	2	8	129438	129445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_017058	T	6	6	130043	130048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017058	TTAAT	2	10	130052	130061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017058	ATT	2	6	131501	131506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017058	TGT	2	6	131529	131534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017058	GTT	2	6	131546	131551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017058	TCAT	2	8	131567	131574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_017058	CAT	2	6	131590	131595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017058	TTTTAA	2	12	131615	131626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017058	ATTA	2	8	132436	132443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017058	TA	3	6	132480	132485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017058	TAT	2	6	132499	132504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017058	TTG	2	6	132514	132519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017058	AAT	2	6	132575	132580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017058	A	6	6	134824	134829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017058	ATA	2	6	134858	134863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017058	A	6	6	134885	134890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017058	GATA	2	8	134916	134923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017058	TTA	2	6	134929	134934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017058	TAC	2	6	134952	134957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017058	AAG	2	6	134984	134989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017058	CTG	2	6	135015	135020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017058	ATA	2	6	135060	135065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017058	CCAAA	2	10	135082	135091	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1054	NC_017058	A	6	6	135094	135099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017058	AGAA	2	8	135125	135132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017058	TCT	2	6	135167	135172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017058	T	6	6	135219	135224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017058	TTC	2	6	135250	135255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017058	TAA	2	6	135262	135267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017058	TAAAA	2	10	135290	135299	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017058	CTA	2	6	135307	135312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017058	TAG	2	6	135370	135375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017058	CAC	2	6	135376	135381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_017058	AT	4	8	135387	135394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017058	ATA	2	6	135715	135720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017058	TC	3	6	135721	135726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_017058	GTT	2	6	135746	135751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017058	GAG	2	6	135787	135792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017058	TTG	2	6	135796	135801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017058	CAA	2	6	135863	135868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017058	GAG	2	6	135877	135882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017058	A	7	7	135902	135908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017058	TCG	2	6	135953	135958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_017058	TCT	2	6	135971	135976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017058	A	6	6	135987	135992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017058	CAA	2	6	136003	136008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_017058	A	6	6	136727	136732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017058	ATT	2	6	141820	141825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017058	AT	3	6	141830	141835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017058	TA	3	6	141849	141854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017058	TTA	2	6	141859	141864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017058	ATT	2	6	141883	141888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017058	TTTAA	2	10	141889	141898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017058	TTAAA	2	10	141907	141916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017058	TAAT	2	8	141985	141992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017058	TAA	2	6	142064	142069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017058	TGC	2	6	142071	142076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017058	TAA	2	6	142123	142128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017058	TTTAA	2	10	142173	142182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017058	TAA	2	6	142218	142223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017058	T	6	6	142248	142253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017058	TAC	2	6	142270	142275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017058	TATAT	2	10	142277	142286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017058	TAA	2	6	142309	142314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017058	TAT	2	6	142372	142377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017058	TAT	2	6	142423	142428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017058	TAC	2	6	142468	142473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_017058	GATT	2	8	142482	142489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017058	ATC	2	6	142503	142508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017058	AAT	2	6	142555	142560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017058	ATT	2	6	142643	142648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017058	ATTAT	2	10	142665	142674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017058	T	6	6	142805	142810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017058	CAT	2	6	142859	142864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017058	TTGT	2	8	142947	142954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017058	CTC	2	6	142983	142988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_017058	TTC	2	6	143002	143007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017058	GCA	2	6	143024	143029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017058	TCA	2	6	143120	143125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017058	TTG	2	6	143131	143136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017058	TGC	2	6	143143	143148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_017058	ATCTTC	2	12	143194	143205	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017058	T	7	7	143224	143230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017058	TTC	3	9	143233	143241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017058	TAT	2	6	143247	143252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017058	TCT	2	6	143258	143263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017058	TTC	2	6	143266	143271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017058	TCT	2	6	143291	143296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017058	TCA	2	6	143297	143302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017058	T	6	6	143326	143331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017058	TGA	2	6	143338	143343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017058	TTA	2	6	143420	143425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017058	TAT	2	6	143442	143447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017058	TTG	2	6	143451	143456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017058	TTG	2	6	143485	143490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017058	AAT	2	6	143492	143497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017058	CTTT	2	8	143526	143533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_017058	TTA	2	6	143540	143545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017058	CAG	2	6	143586	143591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017058	CAA	2	6	143610	143615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017058	T	6	6	143626	143631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017058	CTT	2	6	143676	143681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017058	TCT	2	6	143747	143752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017058	CTT	2	6	143790	143795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_017058	AATCAG	2	12	143823	143834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1136	NC_017058	T	6	6	143857	143862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017058	ATC	2	6	143875	143880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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