MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 8080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017056	TTA	2	6	443023	443028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017056	CATA	2	8	443029	443036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_017056	ATG	2	6	443895	443900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017056	TAT	2	6	443901	443906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017056	AAT	2	6	443917	443922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017056	AAT	2	6	445445	445450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017056	TTAA	2	8	445489	445496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017056	AAT	2	6	445505	445510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017056	TAT	2	6	445518	445523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017056	AAT	2	6	445530	445535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017056	TAA	2	6	445537	445542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017056	TAT	2	6	445592	445597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017056	A	6	6	445643	445648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017056	GAA	2	6	445654	445659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017056	TAA	2	6	445665	445670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017056	ATT	2	6	445725	445730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017056	TAA	2	6	445732	445737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017056	ATA	2	6	445781	445786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017056	GAA	2	6	445792	445797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017056	TA	3	6	445833	445838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017056	TTAATT	2	12	445879	445890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017056	TTA	2	6	445905	445910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017056	TA	3	6	445939	445944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017056	TAA	2	6	445973	445978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017056	T	6	6	445983	445988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3027	NC_017056	ATT	2	6	446062	446067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3029	NC_017056	TAA	2	6	446124	446129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017056	TAA	2	6	446148	446153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017056	A	6	6	446157	446162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017056	GAA	2	6	446173	446178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017056	AC	3	6	446227	446232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_017056	TGA	2	6	446263	446268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017056	GACAA	2	10	446283	446292	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3036	NC_017056	TA	3	6	446302	446307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017056	A	6	6	446363	446368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017056	ATT	2	6	446381	446386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017056	ATA	2	6	446391	446396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3041	NC_017056	ATTTTA	2	12	446487	446498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017056	TATT	2	8	446506	446513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017056	AGC	2	6	446526	446531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017056	ATG	2	6	446558	446563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017056	GTA	2	6	446663	446668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3047	NC_017056	ATT	2	6	446687	446692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3050	NC_017056	ATA	2	6	446823	446828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017056	TAT	2	6	446845	446850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017056	AT	3	6	446849	446854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017056	A	6	6	446874	446879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017056	TAT	3	9	446901	446909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017056	TGCTT	2	10	446933	446942	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3057	NC_017056	AAT	2	6	446962	446967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017056	T	6	6	446998	447003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3060	NC_017056	TTTC	2	8	447058	447065	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3062	NC_017056	TTTG	2	8	447201	447208	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017056	ATT	2	6	447236	447241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017056	ATT	2	6	447244	447249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017056	AGT	2	6	448180	448185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3067	NC_017056	GTA	2	6	449830	449835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017056	AATG	2	8	449840	449847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017056	AAT	2	6	449869	449874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017056	GTACT	2	10	449917	449926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3072	NC_017056	TAA	2	6	450008	450013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_017056	TAT	2	6	450295	450300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017056	AT	4	8	450342	450349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017056	TATT	2	8	450359	450366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017056	GTT	2	6	450377	450382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_017056	TA	3	6	450469	450474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3085	NC_017056	TAC	2	6	450575	450580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_017056	ATT	2	6	450604	450609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_017056	TATT	2	8	450650	450657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_017056	GTTAT	2	10	450695	450704	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3096	NC_017056	TATAA	2	10	450839	450848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017056	TTTTTA	2	12	451403	451414	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3102	NC_017056	AAAT	3	12	451595	451606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017056	ATT	2	6	451624	451629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017056	A	7	7	453253	453259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017056	TGAA	2	8	453266	453273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017056	AACA	2	8	453299	453306	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_017056	TTA	2	6	454247	454252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017056	AT	3	6	454304	454309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017056	ATA	2	6	454313	454318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017056	A	6	6	454318	454323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017056	T	7	7	456700	456706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017056	AAT	2	6	456715	456720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3114	NC_017056	TAA	2	6	456754	456759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017056	ATT	2	6	456772	456777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017056	T	7	7	456776	456782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017056	AAAAT	2	10	456783	456792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017056	TTG	2	6	456842	456847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017056	TAAT	2	8	456885	456892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017056	TAA	2	6	458304	458309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017056	TTA	2	6	458310	458315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017056	TAT	2	6	458317	458322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017056	AAG	2	6	458355	458360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017056	T	7	7	458370	458376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017056	A	7	7	458377	458383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017056	TTAA	2	8	458430	458437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017056	T	6	6	458498	458503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017056	ATTA	2	8	458506	458513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017056	AGA	2	6	458544	458549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017056	ACG	2	6	458566	458571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_017056	TATT	2	8	458583	458590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017056	AT	3	6	458594	458599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017056	TAAC	2	8	458601	458608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3134	NC_017056	AT	3	6	458623	458628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_017056	AT	3	6	458658	458663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_017056	AATT	2	8	458666	458673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_017056	ATG	2	6	458706	458711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3442	NC_017056	TTG	2	6	505385	505390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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