MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 8080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017056	CTT	2	6	230039	230044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_017056	ATTA	2	8	230847	230854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017056	TA	3	6	230882	230887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017056	ATT	2	6	230900	230905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017056	T	6	6	230904	230909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017056	TATCA	2	10	231313	231322	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1507	NC_017056	GCTA	2	8	231392	231399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_017056	TAT	2	6	231455	231460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017056	AT	3	6	231485	231490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017056	ATTA	2	8	232185	232192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017056	ATT	2	6	232195	232200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017056	A	6	6	232204	232209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017056	ATA	2	6	232224	232229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017056	ATT	2	6	232239	232244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017056	CTG	2	6	233103	233108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017056	ATA	2	6	233141	233146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017056	TA	4	8	233145	233152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017056	A	6	6	233200	233205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017056	CTTT	2	8	233211	233218	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_017056	TTG	2	6	233233	233238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017056	TTA	2	6	233246	233251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017056	AAAG	2	8	233264	233271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017056	TAG	2	6	233279	233284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017056	TTTCTT	2	12	233337	233348	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1525	NC_017056	T	6	6	233380	233385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017056	CTTT	2	8	233437	233444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_017056	ATTA	2	8	233449	233456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017056	ATT	2	6	233459	233464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017056	AT	3	6	233521	233526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017056	CTT	2	6	233557	233562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017056	T	6	6	233588	233593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017056	TGT	2	6	233613	233618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017056	TAG	2	6	233636	233641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017056	ATAG	2	8	233642	233649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017056	TGTA	2	8	233656	233663	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017056	TAG	2	6	233717	233722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017056	AAT	2	6	233732	233737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017056	ATATG	2	10	233790	233799	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017056	AAT	2	6	233926	233931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017056	T	6	6	234008	234013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017056	T	6	6	234050	234055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017056	TAC	2	6	234069	234074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_017056	AT	3	6	234119	234124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017056	TA	3	6	234127	234132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017056	GAA	2	6	234203	234208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017056	T	6	6	234257	234262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017056	T	7	7	234265	234271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017056	ACT	2	6	234272	234277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_017056	AAT	2	6	234298	234303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017056	AAAT	2	8	234307	234314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017056	TA	4	8	234342	234349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017056	AT	3	6	234408	234413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017056	TAAAA	2	10	234450	234459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017056	AAT	2	6	234493	234498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017056	T	6	6	234531	234536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017056	T	6	6	234565	234570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017056	AAT	2	6	234586	234591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017056	TGCT	2	8	234610	234617	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_017056	AAT	2	6	234622	234627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017056	CTG	2	6	234640	234645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017056	TTA	2	6	234656	234661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017056	TGC	2	6	234664	234669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_017056	GCAATT	2	12	234671	234682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1564	NC_017056	AT	3	6	234685	234690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017056	TAG	2	6	236676	236681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017056	CCT	2	6	236684	236689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_017056	GA	3	6	236905	236910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017056	AT	4	8	236951	236958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017056	ATTG	2	8	236968	236975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017056	TAA	2	6	236976	236981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017056	TTG	2	6	237027	237032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017056	TAA	2	6	237064	237069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017056	AAT	2	6	237081	237086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017056	AAT	2	6	237096	237101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017056	ATT	2	6	237118	237123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017056	ATA	2	6	237124	237129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017056	CAC	2	6	237130	237135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_017056	ATA	2	6	237139	237144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017056	TTA	2	6	237163	237168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017056	TAG	2	6	237254	237259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017056	ATA	2	6	237265	237270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017056	TAAA	2	8	237277	237284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017056	TCA	2	6	237287	237292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1585	NC_017056	TTA	2	6	237365	237370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1587	NC_017056	ATATA	2	10	237514	237523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017056	ATTAT	2	10	237536	237545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017056	A	7	7	237549	237555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017056	TAGC	2	8	237563	237570	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_017056	ACTAA	2	10	237595	237604	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1592	NC_017056	TAAAAA	2	12	237617	237628	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1594	NC_017056	TAA	2	6	237659	237664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017056	GAA	2	6	237701	237706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017056	TTG	2	6	237736	237741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017056	TTA	2	6	237748	237753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_017056	ATA	2	6	237791	237796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_017056	GAAA	2	8	237873	237880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017056	GAA	2	6	237887	237892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017056	AAG	2	6	237902	237907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017056	ATAA	2	8	237932	237939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017056	AGT	2	6	238007	238012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017056	AAT	2	6	238026	238031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017056	ATTGC	2	10	238036	238045	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1608	NC_017056	TGT	2	6	238058	238063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017056	AGC	2	6	238093	238098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1611	NC_017056	ACC	2	6	238161	238166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_017056	GT	3	6	238197	238202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017056	TATAA	2	10	238211	238220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017056	GCA	2	6	238239	238244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017056	GCTA	2	8	238251	238258	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_017056	AGA	2	6	238281	238286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017056	TAGA	2	8	238317	238324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017056	GATA	2	8	238358	238365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017056	GTT	2	6	238387	238392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017056	TAT	2	6	238401	238406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017056	CTAT	2	8	238409	238416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_017056	TTA	2	6	238418	238423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017056	ATT	2	6	238429	238434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017056	CTT	2	6	238436	238441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_017056	A	7	7	238478	238484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017056	ATA	2	6	238494	238499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017056	AATGT	2	10	238582	238591	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017056	GGT	2	6	238641	238646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017056	GTA	2	6	238735	238740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017056	ATGT	2	8	238788	238795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017056	ATA	2	6	238808	238813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017056	GTAAAG	2	12	238816	238827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017056	ATT	2	6	238838	238843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017056	TTA	2	6	238848	238853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017056	TAA	2	6	238856	238861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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