MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 8411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1003	NC_017051	TA	3	6	142953	142958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017051	TAT	2	6	142960	142965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017051	AT	4	8	142964	142971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017051	ATA	2	6	142989	142994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017051	A	6	6	142996	143001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017051	A	6	6	143015	143020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017051	A	7	7	143035	143041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1011	NC_017051	AAT	2	6	143156	143161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017051	AT	3	6	144048	144053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017051	TAC	2	6	144064	144069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017051	CAT	2	6	144078	144083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017051	TCT	2	6	144132	144137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017051	T	6	6	144146	144151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017051	ATA	2	6	144168	144173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017051	GTC	2	6	145056	145061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017051	ACTT	2	8	146635	146642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_017051	TAAGC	2	10	146684	146693	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_017051	TAAAT	2	10	146705	146714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017051	ATC	2	6	147470	147475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1024	NC_017051	T	6	6	147534	147539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017051	TAT	2	6	147580	147585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017051	T	6	6	148021	148026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1033	NC_017051	TTAAG	2	10	148594	148603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1044	NC_017051	ATAATT	2	12	151238	151249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1054	NC_017051	AATA	2	8	154439	154446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017051	TAA	3	9	154488	154496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017051	TAT	2	6	154517	154522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017051	AG	3	6	154627	154632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017051	TA	4	8	154649	154656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017051	TA	3	6	154671	154676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017051	ATT	2	6	154697	154702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017051	TAA	2	6	155558	155563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017051	TAAA	2	8	155569	155576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1067	NC_017051	TAA	2	6	157465	157470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1070	NC_017051	T	7	7	157524	157530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_017051	TTAT	2	8	158783	158790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017051	TA	3	6	162983	162988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1109	NC_017051	TAC	2	6	167412	167417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1121	NC_017051	TTA	2	6	167975	167980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017051	AT	3	6	167996	168001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017051	TAG	2	6	168034	168039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017051	AT	3	6	168105	168110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017051	ATT	2	6	168136	168141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017051	ATAA	2	8	168203	168210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017051	TAA	2	6	169778	169783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017051	TTCAT	2	10	170639	170648	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1131	NC_017051	TATGTA	2	12	171200	171211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1133	NC_017051	TGA	2	6	173056	173061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017051	TA	3	6	173062	173067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017051	ACAA	2	8	173124	173131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_017051	TA	3	6	173138	173143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017051	AAGAT	2	10	173213	173222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_017051	AATA	2	8	173250	173257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_017051	TTG	2	6	215015	215020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_017051	T	7	7	215034	215040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_017051	CAA	2	6	215094	215099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1424	NC_017051	AT	3	6	215284	215289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_017051	T	6	6	215313	215318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_017051	AAT	2	6	215342	215347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_017051	CTG	2	6	215623	215628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1434	NC_017051	TATT	2	8	215859	215866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_017051	TAAA	2	8	216235	216242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_017051	ATT	2	6	216251	216256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_017051	T	6	6	216255	216260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_017051	GTA	3	9	216288	216296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_017051	GCT	2	6	216320	216325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_017051	CATT	2	8	216385	216392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1450	NC_017051	T	6	6	216397	216402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_017051	TTC	2	6	216405	216410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_017051	ACG	2	6	216467	216472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1453	NC_017051	ATT	2	6	216481	216486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_017051	TCGT	2	8	216487	216494	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1455	NC_017051	ATT	2	6	216558	216563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_017051	CTA	2	6	216627	216632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1457	NC_017051	TAC	2	6	216654	216659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1458	NC_017051	TAA	2	6	219179	219184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_017051	TTC	2	6	219250	219255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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