MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 8411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017051	TAT	2	6	686127	686132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017051	TTA	2	6	686208	686213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017051	AAG	2	6	686214	686219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017051	GAA	2	6	686225	686230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017051	TGAT	2	8	686238	686245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017051	AAT	2	6	686248	686253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017051	TTTTAA	2	12	687104	687115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017051	TA	3	6	687140	687145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017051	ATT	2	6	688401	688406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017051	TAA	2	6	688498	688503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017051	TGC	2	6	688510	688515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017051	ATTTA	2	10	688583	688592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017051	AT	3	6	688626	688631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017051	ATTA	2	8	688652	688659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017051	TAATA	2	10	688684	688693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017051	TA	3	6	688692	688697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017051	GTC	2	6	688700	688705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017051	ATA	2	6	688717	688722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017051	AAT	2	6	688726	688731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017051	ATTGA	2	10	688734	688743	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017051	CA	3	6	688760	688765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_017051	GCAA	2	8	688799	688806	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5023	NC_017051	T	7	7	688828	688834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017051	CTG	2	6	688872	688877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_017051	ATA	2	6	688915	688920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017051	CA	3	6	688966	688971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_017051	ATA	2	6	688998	689003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017051	ACT	2	6	689096	689101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017051	TAC	2	6	689105	689110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_017051	AAC	2	6	689111	689116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017051	ACTT	2	8	689155	689162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_017051	ACT	2	6	689245	689250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017051	TCAGAT	2	12	689280	689291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5034	NC_017051	TAA	2	6	689324	689329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017051	AATTA	2	10	689347	689356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017051	ACT	2	6	689364	689369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017051	ATT	2	6	689455	689460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017051	TAT	2	6	689461	689466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017051	ATGCT	2	10	689514	689523	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5040	NC_017051	CTT	2	6	689534	689539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017051	TAT	2	6	689543	689548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017051	CTC	2	6	689639	689644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_017051	CCA	2	6	689654	689659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_017051	ATCT	2	8	689666	689673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_017051	TAAAAC	2	12	689690	689701	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5046	NC_017051	TAG	2	6	689750	689755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017051	TAC	2	6	689777	689782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_017051	TAAT	2	8	689788	689795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017051	ATA	2	6	689806	689811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017051	TCT	2	6	689822	689827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_017051	TA	3	6	689867	689872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017051	TAA	2	6	689887	689892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017051	CTA	2	6	689920	689925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_017051	TAA	2	6	689934	689939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017051	ATAA	2	8	689950	689957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017051	ATT	2	6	689980	689985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017051	TCAAA	2	10	690019	690028	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5058	NC_017051	TAA	2	6	690057	690062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017051	T	7	7	690067	690073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017051	ATA	2	6	690095	690100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017051	A	8	8	690106	690113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017051	ATAA	2	8	690196	690203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017051	ATA	2	6	690240	690245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017051	GATA	2	8	690257	690264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017051	CAC	2	6	690273	690278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_017051	ATT	2	6	690288	690293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017051	TAA	2	6	690297	690302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017051	AT	4	8	690399	690406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017051	AAT	2	6	690410	690415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017051	ATA	2	6	690416	690421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017051	TA	3	6	690420	690425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017051	AT	3	6	690434	690439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017051	TAT	2	6	690466	690471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5077	NC_017051	AT	4	8	690520	690527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017051	TCAT	2	8	690530	690537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_017051	T	7	7	690550	690556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017051	ATAA	2	8	690570	690577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017051	TAA	2	6	696293	696298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017051	TA	3	6	696326	696331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017051	ACT	2	6	696342	696347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017051	AAT	2	6	696381	696386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017051	TTTAA	2	10	696449	696458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017051	TAAA	2	8	696495	696502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017051	ATTCT	2	10	696607	696616	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5088	NC_017051	TCT	2	6	696636	696641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017051	ATT	2	6	696710	696715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017051	ATC	2	6	696724	696729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5093	NC_017051	ATA	2	6	696772	696777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5096	NC_017051	T	7	7	696808	696814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017051	A	6	6	696822	696827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_017051	CTAAT	2	10	699043	699052	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5101	NC_017051	TAAT	2	8	699107	699114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017051	ATT	2	6	699152	699157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017051	AT	3	6	699167	699172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017051	ACT	2	6	699214	699219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_017051	TAT	2	6	699233	699238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017051	ATA	2	6	699260	699265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017051	TAA	2	6	699269	699274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017051	T	7	7	699276	699282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017051	ATT	2	6	699290	699295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017051	TG	3	6	699300	699305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017051	TAC	2	6	699316	699321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5116	NC_017051	T	7	7	699663	699669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017051	TAC	2	6	699676	699681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_017051	ATTC	2	8	699764	699771	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_017051	T	6	6	699802	699807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017051	ACT	2	6	699814	699819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5122	NC_017051	T	6	6	699882	699887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017051	CAA	2	6	699906	699911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_017051	TAT	2	6	699918	699923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017051	CTCA	2	8	699951	699958	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_017051	TAAA	2	8	699968	699975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017051	A	6	6	699973	699978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017051	T	6	6	700022	700027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017051	GGAGTA	2	12	700029	700040	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017051	TCT	2	6	700049	700054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017051	TTACA	2	10	700071	700080	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5132	NC_017051	ATGT	2	8	700084	700091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017051	ATTT	2	8	700124	700131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_017051	TTG	2	6	700145	700150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_017051	GTA	2	6	700226	700231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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