MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 8411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017051	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017051	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017051	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017051	ACA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017051	ACA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017051	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017051	ATT	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017051	TCT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017051	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017051	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017051	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017051	T	9	9	5994	6002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017051	CAT	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017051	TAA	2	6	6038	6043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017051	ATA	2	6	6121	6126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017051	GGCT	2	8	6127	6134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017051	TA	4	8	6157	6164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017051	ATT	2	6	6175	6180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017051	TTTA	2	8	6200	6207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017051	TAAA	2	8	6219	6226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017051	TTA	2	6	7504	7509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017051	ATT	2	6	7555	7560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017051	AT	3	6	7581	7586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017051	ACA	2	6	7638	7643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017051	TA	3	6	8734	8739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017051	TAT	2	6	8751	8756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017051	TGACT	2	10	8808	8817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017051	TTA	2	6	8864	8869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017051	TAA	2	6	8905	8910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017051	ATTT	2	8	8916	8923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017051	TTTA	2	8	8964	8971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017051	GATAC	2	10	8992	9001	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017051	TTA	2	6	9009	9014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017051	A	6	6	9068	9073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017051	ACC	2	6	9082	9087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017051	GTA	2	6	9113	9118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017051	CAT	2	6	9143	9148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017051	ATT	2	6	9156	9161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017051	CAT	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017051	ACA	2	6	9191	9196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017051	TAA	2	6	9200	9205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017051	TATT	2	8	9212	9219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017051	TAAT	2	8	9258	9265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017051	TTA	2	6	9341	9346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017051	ATTTA	2	10	9351	9360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017051	TAT	2	6	9403	9408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017051	AAT	2	6	9453	9458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017051	TAT	2	6	9477	9482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017051	AGA	2	6	11825	11830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017051	ATA	2	6	14382	14387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017051	TTA	2	6	14392	14397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017051	TA	3	6	14404	14409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017051	GTT	2	6	14447	14452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017051	TTA	2	6	14461	14466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017051	GTA	2	6	14478	14483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017051	A	7	7	14483	14489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017051	TTG	2	6	14514	14519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017051	ATT	2	6	14528	14533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017051	T	6	6	14565	14570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017051	AT	3	6	14572	14577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017051	TA	3	6	14600	14605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017051	TAAAC	2	10	14655	14664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017051	ATT	2	6	14679	14684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017051	ATC	2	6	14719	14724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017051	TAAG	2	8	14775	14782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017051	ATTA	2	8	14796	14803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017051	AAG	2	6	14830	14835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017051	AAAG	2	8	14865	14872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017051	A	6	6	14912	14917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017051	ATT	2	6	14940	14945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017051	TTG	2	6	14953	14958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017051	ATT	2	6	14999	15004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017051	AT	3	6	15016	15021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017051	TTAT	2	8	15036	15043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017051	TAA	2	6	17878	17883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017051	A	7	7	17889	17895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017051	GAA	3	9	17918	17926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017051	ATA	2	6	19097	19102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017051	ACC	2	6	19147	19152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017051	ATA	2	6	19244	19249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017051	TAA	2	6	19257	19262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017051	AAG	2	6	19279	19284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017051	TTA	2	6	19321	19326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017051	ATTTA	2	10	19331	19340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017051	CTT	2	6	19395	19400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017051	TATT	2	8	19401	19408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017051	ATCTAA	2	12	19410	19421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017051	ATT	2	6	19422	19427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017051	TAG	2	6	19458	19463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017051	AGTTT	2	10	19529	19538	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017051	A	6	6	19561	19566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017051	GTAA	2	8	19575	19582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017051	AAT	2	6	19587	19592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017051	TTAT	2	8	19653	19660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017051	TCAA	2	8	19685	19692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017051	AT	3	6	19694	19699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017051	CAT	2	6	19745	19750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017051	TATAA	2	10	19762	19771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017051	GTAA	2	8	19854	19861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017051	TA	3	6	19881	19886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017051	AT	3	6	19894	19899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017051	TAG	2	6	19914	19919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017051	GTA	2	6	20038	20043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017051	TAA	2	6	20044	20049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017051	ATAG	2	8	20089	20096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017051	AAT	2	6	20121	20126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017051	A	8	8	20134	20141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017051	A	8	8	20157	20164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017051	ATTA	2	8	20193	20200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017051	GAA	2	6	20221	20226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017051	TAA	2	6	20239	20244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017051	A	9	9	20250	20258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017051	TAG	2	6	20259	20264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017051	AGT	2	6	20352	20357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017051	TAT	2	6	20413	20418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017051	A	6	6	20429	20434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017051	AAT	2	6	20440	20445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017051	TA	3	6	20450	20455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017051	AT	3	6	20546	20551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017051	AATCT	2	10	20572	20581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017051	ATT	2	6	20599	20604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017051	AAG	2	6	20658	20663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017051	GTT	2	6	20688	20693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017051	AAT	2	6	20725	20730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017051	ATCA	2	8	20755	20762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017051	ATA	2	6	20785	20790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017051	A	6	6	21095	21100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017051	TGA	2	6	21107	21112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017051	AACA	2	8	21116	21123	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017051	GTAT	2	8	21155	21162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017051	TAAT	2	8	22428	22435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017051	TTA	3	9	23474	23482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017051	ATTT	2	8	23486	23493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017051	T	6	6	23496	23501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017051	TCA	2	6	23505	23510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017051	CTATA	2	10	23545	23554	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017051	GAA	2	6	23579	23584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017051	CTA	2	6	23617	23622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017051	TTC	2	6	23681	23686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017051	GCC	2	6	23696	23701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017051	TAA	2	6	23720	23725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017051	TATT	2	8	23733	23740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017051	TTG	3	9	23759	23767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017051	TAATA	2	10	23768	23777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017051	GCA	2	6	23829	23834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017051	TTA	2	6	23883	23888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017051	TAT	2	6	23896	23901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017051	T	9	9	23901	23909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017051	TGA	2	6	23929	23934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017051	TAT	2	6	58629	58634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_017051	ATT	2	6	70005	70010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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