MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 8095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017050	T	6	6	227003	227008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017050	T	6	6	227024	227029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017050	ATA	2	6	227032	227037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017050	ATT	2	6	227066	227071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017050	T	6	6	227095	227100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017050	ATTA	2	8	227180	227187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017050	TTTC	2	8	227192	227199	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_017050	TTA	2	6	227219	227224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017050	A	6	6	227229	227234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017050	AG	3	6	228710	228715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017050	AGTA	2	8	228739	228746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017050	ATT	2	6	229436	229441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017050	T	7	7	229464	229470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017050	GATT	2	8	229473	229480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017050	ATT	2	6	229482	229487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017050	GCT	2	6	229526	229531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_017050	ACA	2	6	229537	229542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_017050	TAA	2	6	229576	229581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017050	CAA	2	6	229625	229630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017050	ATT	2	6	229645	229650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017050	ATA	2	6	229673	229678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017050	TAA	3	9	229708	229716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017050	TGC	2	6	229748	229753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017050	TCA	2	6	229767	229772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017050	ATA	2	6	229773	229778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017050	ATTA	2	8	229913	229920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017050	ATAAA	2	10	229928	229937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017050	ATTT	2	8	229975	229982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017050	CTT	2	6	230031	230036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017050	ATTA	2	8	230839	230846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017050	TA	3	6	230874	230879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017050	ATT	2	6	230892	230897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017050	T	6	6	230896	230901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017050	TATCA	2	10	231305	231314	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1535	NC_017050	GCTA	2	8	231384	231391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_017050	TAT	2	6	231447	231452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017050	AT	3	6	231477	231482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017050	ATTA	2	8	232177	232184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017050	ATT	2	6	232187	232192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017050	A	6	6	232196	232201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017050	ATA	2	6	232216	232221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017050	ATT	2	6	232231	232236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017050	CTG	2	6	233095	233100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017050	ATA	2	6	233133	233138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017050	TA	4	8	233137	233144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017050	A	6	6	233192	233197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017050	CTTT	2	8	233203	233210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_017050	TTG	2	6	233225	233230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017050	TTA	2	6	233238	233243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017050	AAAG	2	8	233256	233263	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017050	TAG	2	6	233271	233276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017050	TTTCTT	2	12	233329	233340	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1553	NC_017050	T	6	6	233372	233377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017050	CTTT	2	8	233429	233436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_017050	ATTA	2	8	233441	233448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017050	ATT	2	6	233451	233456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017050	AT	3	6	233513	233518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017050	CTT	2	6	233549	233554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017050	T	6	6	233580	233585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017050	TGT	2	6	233605	233610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017050	TAG	2	6	233628	233633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017050	ATAG	2	8	233634	233641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017050	TGTA	2	8	233648	233655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017050	TAG	2	6	233709	233714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017050	AAT	2	6	233724	233729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017050	ATATG	2	10	233782	233791	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017050	AAT	2	6	233918	233923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017050	T	6	6	234000	234005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017050	T	6	6	234042	234047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017050	TAC	2	6	234061	234066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_017050	AT	3	6	234111	234116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017050	TA	3	6	234119	234124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017050	GAA	2	6	234195	234200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017050	T	6	6	234249	234254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017050	T	7	7	234257	234263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017050	ACT	2	6	234264	234269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1578	NC_017050	AAAT	2	8	234299	234306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017050	TA	4	8	234334	234341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017050	AT	3	6	234400	234405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017050	TAAAA	2	10	234442	234451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017050	AAT	2	6	234485	234490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017050	T	6	6	234523	234528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017050	T	6	6	234557	234562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017050	AAT	2	6	234578	234583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017050	TGCT	2	8	234602	234609	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1587	NC_017050	AAT	2	6	234614	234619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017050	CTG	2	6	234632	234637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_017050	TTA	2	6	234648	234653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1591	NC_017050	GCAATT	2	12	234663	234674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1592	NC_017050	AT	3	6	234677	234682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017050	TAG	2	6	236668	236673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_017050	AAT	2	6	237073	237078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017050	AAT	2	6	237088	237093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017050	ATT	2	6	237110	237115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017050	ATA	2	6	237116	237121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017050	CAC	2	6	237122	237127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_017050	ATA	2	6	237131	237136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017050	TTA	2	6	237155	237160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017050	TAG	2	6	237246	237251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017050	ATA	2	6	237257	237262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017050	TAAA	2	8	237269	237276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017050	TCA	2	6	237279	237284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1613	NC_017050	TTA	2	6	237357	237362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_017050	ATATA	2	10	237506	237515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017050	ATTAT	2	10	237528	237537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017050	A	7	7	237541	237547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017050	TAGC	2	8	237555	237562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_017050	ACTAA	2	10	237587	237596	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1620	NC_017050	TAAAAA	2	12	237609	237620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017050	TTG	2	6	237626	237631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017050	TAA	2	6	237651	237656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017050	GAA	2	6	237693	237698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017050	TTG	2	6	237728	237733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017050	TTA	2	6	237740	237745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017050	AGC	2	6	237775	237780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_017050	ATA	2	6	237783	237788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017050	GAT	2	6	237848	237853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1630	NC_017050	GAA	2	6	237879	237884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017050	AAG	2	6	237894	237899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017050	ATAA	2	8	237924	237931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017050	AGT	2	6	237999	238004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017050	AAT	2	6	238018	238023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017050	ATTGC	2	10	238028	238037	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1636	NC_017050	TGT	2	6	238050	238055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_017050	TTAA	2	8	238103	238110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1914	NC_017050	ACCAT	2	10	265308	265317	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1915	NC_017050	AGTAA	2	10	265354	265363	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_017050	TTA	2	6	267194	267199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1947	NC_017050	A	6	6	273635	273640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1952	NC_017050	TAA	2	6	273872	273877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_017050	TAAA	2	8	273881	273888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1958	NC_017050	TGA	2	6	274017	274022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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