MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 8095

< Previous12...567891011121314151617Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017050	ATT	2	6	1099912	1099917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017050	AT	3	6	1099938	1099943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017050	CAT	2	6	1099965	1099970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_017050	T	6	6	1099977	1099982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017050	TACT	2	8	1100005	1100012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8006	NC_017050	T	6	6	1100012	1100017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017050	CTTT	2	8	1100029	1100036	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8008	NC_017050	ATGA	2	8	1100059	1100066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017050	TA	3	6	1100110	1100115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017050	TTATTT	2	12	1100132	1100143	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017050	TCA	2	6	1100156	1100161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_017050	ATT	2	6	1100172	1100177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017050	ATT	2	6	1100184	1100189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017050	GCA	2	6	1100213	1100218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_017050	GAA	2	6	1100295	1100300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017050	A	7	7	1100310	1100316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017050	GAT	2	6	1100335	1100340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017050	ATT	2	6	1100353	1100358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017050	AAAT	2	8	1100431	1100438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017050	TTTC	2	8	1101708	1101715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_017050	TAC	2	6	1101874	1101879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_017050	TTA	2	6	1101889	1101894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017050	ATT	2	6	1101922	1101927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017050	A	6	6	1101955	1101960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017050	AAC	2	6	1101999	1102004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_017050	T	6	6	1102020	1102025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017050	TGA	2	6	1102102	1102107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017050	GCTAA	2	10	1102151	1102160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8029	NC_017050	TAT	2	6	1102161	1102166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017050	ATG	2	6	1102279	1102284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017050	ATT	2	6	1102841	1102846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017050	AAGG	2	8	1102853	1102860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017050	TTAA	2	8	1102922	1102929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017050	TTA	2	6	1102937	1102942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017050	A	6	6	1102946	1102951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_017050	ATT	2	6	1104900	1104905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017050	TAAA	2	8	1104936	1104943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_017050	TGACT	2	10	1104961	1104970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8039	NC_017050	T	6	6	1104982	1104987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_017050	T	6	6	1104990	1104995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017050	TAA	2	6	1105017	1105022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017050	TTA	2	6	1105075	1105080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_017050	AGT	2	6	1105101	1105106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017050	ATTC	2	8	1105132	1105139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8045	NC_017050	TAGA	2	8	1105170	1105177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017050	AT	3	6	1105185	1105190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017050	CAT	2	6	1105253	1105258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_017050	ATT	2	6	1105311	1105316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017050	T	7	7	1105337	1105343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017050	AACGTT	2	12	1105478	1105489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8051	NC_017050	GATG	2	8	1105490	1105497	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017050	TAA	2	6	1105505	1105510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017050	TAA	2	6	1105523	1105528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017050	ATT	3	9	1105530	1105538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_017050	A	6	6	1105539	1105544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017050	AGA	2	6	1105563	1105568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017050	TA	3	6	1105597	1105602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017050	A	6	6	1105602	1105607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017050	GTA	2	6	1105608	1105613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017050	AT	3	6	1105654	1105659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017050	ACT	2	6	1105665	1105670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_017050	TAA	2	6	1105766	1105771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_017050	TTCTTA	2	12	1105776	1105787	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8064	NC_017050	ATG	2	6	1105814	1105819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017050	TAA	3	9	1105831	1105839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017050	TAAT	2	8	1105844	1105851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_017050	TAC	2	6	1107966	1107971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_017050	TAG	2	6	1108013	1108018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017050	ATTCC	2	10	1108045	1108054	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8070	NC_017050	ATT	3	9	1108061	1108069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017050	T	8	8	1108160	1108167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017050	T	7	7	1108180	1108186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017050	T	6	6	1108192	1108197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_017050	ATT	2	6	1108250	1108255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017050	AT	3	6	1108258	1108263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_017050	T	6	6	1108280	1108285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017050	T	8	8	1108301	1108308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_017050	TA	3	6	1108344	1108349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_017050	TAT	2	6	1108376	1108381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_017050	TATAAA	2	12	1108405	1108416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_017050	A	6	6	1108418	1108423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_017050	ATT	2	6	1108487	1108492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_017050	TTAT	2	8	1108533	1108540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_017050	TAATA	2	10	1108562	1108571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_017050	ATT	2	6	1109023	1109028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_017050	CTA	2	6	1111074	1111079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_017050	AT	4	8	1111090	1111097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017050	TA	3	6	1111102	1111107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017050	TAAAT	2	10	1111128	1111137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_017050	CAA	2	6	1111155	1111160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_017050	A	7	7	1111182	1111188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_017050	ATT	3	9	1111200	1111208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_017050	TAAT	2	8	1111221	1111228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_017050	TTTAG	2	10	1111263	1111272	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_017050	GA	3	6	1111378	1111383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...567891011121314151617Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.