MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 7971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017049	GATT	2	8	583539	583546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017049	ATA	2	6	583555	583560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017049	GAAT	2	8	583561	583568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017049	ATA	3	9	586085	586093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017049	TAT	2	6	586101	586106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017049	TATAA	2	10	586203	586212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017049	ATT	2	6	586287	586292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017049	TGTTT	2	10	586303	586312	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017049	TA	3	6	587711	587716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017049	TTA	2	6	587738	587743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017049	AAT	2	6	587746	587751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017049	AT	3	6	587750	587755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017049	TTGC	2	8	587894	587901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_017049	TAA	2	6	587910	587915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017049	ATT	2	6	587992	587997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017049	TAA	2	6	588001	588006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017049	GTT	2	6	588012	588017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017049	A	6	6	588021	588026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017049	ATTT	2	8	588092	588099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017049	ATT	2	6	588174	588179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017049	T	6	6	588181	588186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017049	T	8	8	588215	588222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017049	A	6	6	593117	593122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017049	TAT	2	6	594231	594236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017049	GGA	2	6	594266	594271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017049	AATA	2	8	594359	594366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017049	TA	3	6	596164	596169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017049	CAA	2	6	596170	596175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_017049	TAT	2	6	596227	596232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017049	ATA	2	6	597581	597586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017049	ACT	2	6	597605	597610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_017049	ATTA	2	8	597611	597618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017049	ATT	2	6	597671	597676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017049	TTATA	2	10	598448	598457	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017049	T	7	7	599751	599757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4037	NC_017049	ATT	2	6	601260	601265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017049	TAAAT	2	10	601283	601292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017049	A	6	6	601308	601313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017049	AT	3	6	602218	602223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017049	CTT	2	6	602226	602231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017049	TCTATT	2	12	602303	602314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4043	NC_017049	TAA	2	6	602352	602357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017049	TA	3	6	602371	602376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017049	TA	3	6	602394	602399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017049	AT	3	6	602410	602415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017049	T	6	6	602425	602430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017049	ATT	2	6	602431	602436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017049	ATA	2	6	602440	602445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017049	ATT	2	6	602463	602468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017049	TTA	2	6	602581	602586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017049	AAT	2	6	602602	602607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017049	T	7	7	602638	602644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017049	A	6	6	602682	602687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017049	AGTA	2	8	603432	603439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017049	ATC	2	6	603445	603450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_017049	TAT	2	6	603472	603477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017049	ATT	2	6	603519	603524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017049	T	6	6	603542	603547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017049	TTAT	2	8	603642	603649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017049	TAAA	2	8	603723	603730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017049	TGG	2	6	603767	603772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017049	TTG	2	6	603790	603795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017049	CGG	2	6	603847	603852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017049	TAA	2	6	603881	603886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017049	ATC	2	6	603947	603952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_017049	AAT	2	6	604002	604007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017049	ATT	2	6	604062	604067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017049	AC	3	6	604070	604075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4070	NC_017049	TAA	2	6	604092	604097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4072	NC_017049	CTA	2	6	604149	604154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_017049	T	7	7	604155	604161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017049	GTA	2	6	604179	604184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_017049	ATT	2	6	607033	607038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017049	CTG	2	6	607080	607085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4081	NC_017049	TCA	2	6	607134	607139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4083	NC_017049	T	7	7	607178	607184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017049	TGG	2	6	607202	607207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017049	ATTTTG	2	12	607231	607242	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_017049	ATT	2	6	607342	607347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4095	NC_017049	A	7	7	607443	607449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4097	NC_017049	A	6	6	607557	607562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_017049	ATT	2	6	607593	607598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017049	CTAG	2	8	607624	607631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_017049	TA	3	6	607663	607668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017049	ATA	2	6	607687	607692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017049	AT	3	6	608427	608432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017049	TAA	2	6	608437	608442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017049	AGT	2	6	608453	608458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017049	TAA	2	6	608533	608538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_017049	TA	4	8	608665	608672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017049	TTA	2	6	608692	608697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017049	A	7	7	608732	608738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017049	ATT	2	6	608760	608765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017049	TA	3	6	608820	608825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017049	TATTT	2	10	608840	608849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017049	TTA	2	6	608898	608903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4117	NC_017049	T	6	6	608964	608969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017049	A	6	6	608974	608979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017049	AATT	2	8	609022	609029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017049	AT	4	8	609052	609059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017049	GTA	2	6	609065	609070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4123	NC_017049	TAT	2	6	609143	609148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017049	ACT	2	6	609163	609168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4126	NC_017049	T	6	6	609249	609254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017049	TGT	2	6	609258	609263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017049	ATT	2	6	609275	609280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017049	TCA	2	6	609329	609334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_017049	T	7	7	610993	610999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017049	AAT	2	6	611007	611012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017049	GTT	2	6	611889	611894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017049	ATT	2	6	611895	611900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017049	TAAT	2	8	611937	611944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_017049	TTTGA	2	10	611974	611983	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_017049	GAAAT	2	10	611996	612005	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4139	NC_017049	CATAAT	2	12	612091	612102	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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