MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 7971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017049	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017049	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017049	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017049	ACA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017049	ACA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017049	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017049	ATT	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017049	TCT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017049	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017049	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017049	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017049	T	8	8	5994	6001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017049	CAT	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017049	TAA	2	6	6037	6042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017049	ATA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017049	GGCT	2	8	6126	6133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017049	TA	4	8	6156	6163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017049	ATT	2	6	6174	6179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017049	TTTA	2	8	6199	6206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017049	TAAA	2	8	6218	6225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017049	TTA	2	6	7503	7508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017049	ATT	2	6	7554	7559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017049	AT	3	6	7580	7585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017049	ACA	2	6	7637	7642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017049	TA	3	6	8733	8738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017049	TAT	2	6	8750	8755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017049	TGACT	2	10	8807	8816	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017049	TTA	2	6	8863	8868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017049	TAA	2	6	8904	8909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017049	ATTT	2	8	8915	8922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017049	TTTA	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017049	GATAC	2	10	8991	9000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017049	TTA	2	6	9008	9013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017049	A	6	6	9067	9072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017049	ACC	2	6	9081	9086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017049	GTA	2	6	9112	9117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017049	CAT	2	6	9142	9147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017049	ATT	2	6	9155	9160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017049	CAT	2	6	9178	9183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017049	ACA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017049	TAA	2	6	9199	9204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017049	TATT	2	8	9211	9218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017049	TAAT	2	8	9257	9264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017049	TTA	2	6	9340	9345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017049	ATTTA	2	10	9350	9359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017049	TAT	2	6	9402	9407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017049	AAT	2	6	9452	9457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017049	TAT	2	6	9476	9481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017049	AGA	2	6	11824	11829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017049	ATA	2	6	14381	14386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017049	TTA	2	6	14391	14396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017049	TA	3	6	14403	14408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017049	GTT	2	6	14446	14451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017049	TTA	2	6	14460	14465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017049	GTA	2	6	14477	14482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017049	A	7	7	14482	14488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017049	TTG	2	6	14513	14518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017049	ATT	2	6	14527	14532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017049	T	6	6	14564	14569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017049	AT	3	6	14571	14576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017049	TA	3	6	14599	14604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017049	TAAAC	2	10	14654	14663	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017049	ATT	2	6	14678	14683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017049	ATC	2	6	14718	14723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017049	TAAG	2	8	14774	14781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017049	ATTA	2	8	14795	14802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017049	AAG	2	6	14829	14834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017049	AAAG	2	8	14864	14871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017049	A	6	6	14911	14916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017049	ATT	2	6	14939	14944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017049	TTG	2	6	14952	14957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017049	ATT	2	6	14998	15003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017049	AT	3	6	15015	15020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017049	TTAT	2	8	15035	15042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017049	TAA	2	6	17877	17882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017049	A	7	7	17888	17894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017049	GAA	3	9	17917	17925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017049	ATA	2	6	19096	19101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017049	ACC	2	6	19146	19151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017049	ATA	2	6	19243	19248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017049	TAA	2	6	19256	19261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017049	AAG	2	6	19278	19283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017049	TTA	2	6	19320	19325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017049	ATTTA	2	10	19330	19339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017049	CTT	2	6	19394	19399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017049	TATT	2	8	19400	19407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017049	ATCTAA	2	12	19409	19420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017049	ATT	2	6	19421	19426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017049	TAG	2	6	19457	19462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017049	AGTTT	2	10	19528	19537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017049	A	6	6	19560	19565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017049	GTAA	2	8	19574	19581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017049	AAT	2	6	19586	19591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017049	TTAT	2	8	19652	19659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017049	TCAA	2	8	19684	19691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017049	AT	3	6	19693	19698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017049	CAT	2	6	19744	19749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017049	TATAA	2	10	19761	19770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017049	GTAA	2	8	19853	19860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017049	TA	3	6	19880	19885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017049	AT	3	6	19893	19898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017049	TAG	2	6	19913	19918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017049	GTA	2	6	20037	20042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017049	TAA	2	6	20043	20048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017049	ATAG	2	8	20088	20095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017049	AAT	2	6	20120	20125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017049	A	8	8	20133	20140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017049	A	8	8	20156	20163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017049	ATTA	2	8	20192	20199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017049	GAA	2	6	20220	20225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017049	TAA	2	6	20238	20243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017049	A	9	9	20249	20257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017049	TAG	2	6	20258	20263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017049	AGT	2	6	20351	20356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017049	TAT	2	6	20412	20417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017049	A	6	6	20428	20433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017049	AAT	2	6	20439	20444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017049	TA	3	6	20449	20454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017049	AT	3	6	20545	20550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017049	AATCT	2	10	20571	20580	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017049	ATT	2	6	20598	20603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017049	AAG	2	6	20657	20662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017049	GTT	2	6	20687	20692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017049	AAT	2	6	20724	20729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017049	ATCA	2	8	20754	20761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017049	ATA	2	6	20784	20789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017049	A	6	6	21094	21099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017049	TGA	2	6	21106	21111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017049	AACA	2	8	21115	21122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017049	GTAT	2	8	21154	21161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017049	TAAT	2	8	22427	22434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017049	AT	3	6	24361	24366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017049	TAG	2	6	24405	24410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017049	CAC	2	6	24441	24446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017049	GGA	2	6	24447	24452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017049	TAC	2	6	24997	25002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017049	TCTT	2	8	25042	25049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017049	TTA	2	6	25172	25177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017049	TAAA	2	8	26862	26869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017049	A	7	7	26867	26873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017049	TA	3	6	26911	26916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017049	TTA	2	6	26920	26925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017049	TTC	2	6	26940	26945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017049	ATT	2	6	26953	26958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017049	ATT	2	6	27035	27040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017049	CAG	2	6	27064	27069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017049	AAT	2	6	28195	28200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017049	ATT	2	6	28207	28212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017049	AT	3	6	28214	28219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_017049	ATT	2	6	28303	28308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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