MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 8509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017048	GCT	3	9	476379	476387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017048	A	7	7	476395	476401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017048	AAT	2	6	476422	476427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017048	CTA	2	6	476462	476467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_017048	TA	3	6	477193	477198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017048	TGTAT	2	10	477648	477657	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017048	TTA	2	6	477669	477674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017048	GAT	2	6	477753	477758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017048	TAGA	2	8	477759	477766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017048	T	6	6	477773	477778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017048	TCT	2	6	477813	477818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_017048	TAA	3	9	477819	477827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017048	A	7	7	478069	478075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017048	TA	3	6	478098	478103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017048	TTA	2	6	479209	479214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017048	T	6	6	480537	480542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017048	AT	3	6	480558	480563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017048	ATT	2	6	480604	480609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017048	ATA	2	6	480654	480659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017048	AAT	2	6	480660	480665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017048	ATT	2	6	483061	483066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017048	TA	3	6	483068	483073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017048	AT	3	6	483102	483107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017048	CAA	2	6	483596	483601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_017048	AAT	2	6	483604	483609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017048	AGA	2	6	483712	483717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017048	TTTA	2	8	483730	483737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017048	TA	3	6	483749	483754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017048	CTA	2	6	483756	483761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017048	TAA	2	6	483835	483840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017048	AAT	2	6	483854	483859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017048	TAA	2	6	483889	483894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017048	TATGT	2	10	483934	483943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017048	GAA	2	6	483984	483989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017048	TA	3	6	484074	484079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017048	TA	4	8	484148	484155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017048	ATTAA	2	10	484185	484194	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017048	ATA	2	6	484275	484280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017048	ATA	2	6	484309	484314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017048	TAA	2	6	484324	484329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017048	AATA	2	8	484381	484388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017048	TTC	2	6	484431	484436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017048	TAT	2	6	484446	484451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017048	ATTA	2	8	484483	484490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017048	TAC	2	6	484511	484516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017048	TCT	2	6	484527	484532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017048	ACTT	2	8	484571	484578	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_017048	A	6	6	484582	484587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017048	T	6	6	484588	484593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017048	TA	3	6	484601	484606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017048	TCT	2	6	484612	484617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_017048	AGT	2	6	484652	484657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017048	AT	3	6	484668	484673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017048	TA	3	6	484690	484695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017048	CTT	2	6	484703	484708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4057	NC_017048	T	6	6	484839	484844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017048	TA	3	6	486915	486920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017048	TAT	2	6	486922	486927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017048	AT	4	8	486926	486933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017048	ATA	2	6	486951	486956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017048	A	6	6	486958	486963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017048	AT	3	6	488009	488014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017048	TAC	2	6	488025	488030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017048	CAT	2	6	488039	488044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_017048	TCT	2	6	488093	488098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_017048	T	6	6	488107	488112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017048	ATA	2	6	488129	488134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017048	GTC	2	6	489017	489022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017048	ACTT	2	8	490596	490603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4071	NC_017048	TAAGC	2	10	490645	490654	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4072	NC_017048	TAAAT	2	10	490666	490675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017048	ATC	2	6	491431	491436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4080	NC_017048	AAT	2	6	492050	492055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017048	CAG	2	6	492488	492493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_017048	ATT	2	6	492523	492528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017048	TAA	2	6	492544	492549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017048	TTAAG	2	10	492555	492564	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4096	NC_017048	TAAG	2	8	495309	495316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_017048	ATTT	2	8	495726	495733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017048	TAGAGA	2	12	495737	495748	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4102	NC_017048	AGA	2	6	498371	498376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017048	TAAT	2	8	498377	498384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017048	AATA	2	8	498400	498407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017048	TAA	3	9	498449	498457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017048	TAT	2	6	498478	498483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017048	AG	3	6	498588	498593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017048	TA	4	8	498610	498617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017048	TA	3	6	498632	498637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017048	ATT	2	6	498658	498663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017048	TAA	2	6	499519	499524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017048	TAAA	2	8	499530	499537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017048	CTT	2	6	499573	499578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017048	TTA	2	6	499607	499612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4116	NC_017048	AAG	2	6	500868	500873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4119	NC_017048	ATT	2	6	501478	501483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017048	T	7	7	501485	501491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017048	A	6	6	501492	501497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017048	GTA	2	6	501509	501514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017048	TAAT	2	8	501525	501532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017048	TC	3	6	501555	501560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_017048	A	9	9	501564	501572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4127	NC_017048	TAA	2	6	502031	502036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017048	TTG	2	6	502042	502047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017048	AGT	2	6	502049	502054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4131	NC_017048	ATTAA	2	10	502096	502105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017048	CTTT	2	8	502107	502114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4133	NC_017048	T	6	6	502129	502134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017048	CTT	2	6	502166	502171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_017048	T	6	6	502216	502221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_017048	ATT	2	6	502230	502235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_017048	ATT	2	6	502252	502257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4139	NC_017048	ATA	2	6	502300	502305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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