MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 8509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017048	AGA	2	6	358704	358709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017048	ATC	2	6	358719	358724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_017048	CTT	3	9	358763	358771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017048	CAT	2	6	358798	358803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_017048	GTT	2	6	358830	358835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017048	TA	3	6	358913	358918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017048	TGA	2	6	358962	358967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017048	AATATA	2	12	359005	359016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017048	ACA	2	6	359040	359045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_017048	CAG	2	6	359077	359082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_017048	AAAG	2	8	359093	359100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017048	A	6	6	359121	359126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017048	AAG	2	6	359129	359134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017048	GTA	2	6	359137	359142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017048	TTACT	2	10	359148	359157	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3016	NC_017048	ATT	2	6	359179	359184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017048	ATTC	2	8	359186	359193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_017048	TAG	2	6	359235	359240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017048	AT	3	6	359246	359251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017048	ATA	2	6	359279	359284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017048	GAT	2	6	359341	359346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017048	GAA	2	6	359407	359412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017048	TA	3	6	359421	359426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017048	ATG	2	6	359465	359470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017048	GAA	2	6	359479	359484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017048	TTA	2	6	359531	359536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017048	AGG	2	6	359558	359563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017048	AAT	2	6	359614	359619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017048	GAA	3	9	359653	359661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017048	AAG	2	6	359669	359674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017048	AAG	2	6	359707	359712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017048	ATT	3	9	359748	359756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017048	A	8	8	359767	359774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017048	GAT	2	6	359791	359796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017048	TAA	2	6	359799	359804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017048	A	7	7	359810	359816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017048	GAA	3	9	359839	359847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017048	TTA	2	6	359991	359996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017048	AAT	2	6	360008	360013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017048	GTA	3	9	360050	360058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017048	GAA	2	6	360071	360076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017048	TAA	2	6	360124	360129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017048	TAA	2	6	360169	360174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017048	AAT	3	9	360206	360214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017048	TTCA	2	8	360240	360247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_017048	ATTTAA	2	12	360250	360261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017048	AAT	2	6	360272	360277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017048	GTA	2	6	360294	360299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017048	ACA	2	6	360331	360336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_017048	AGATA	2	10	360385	360394	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017048	ATT	2	6	360396	360401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017048	TCAAA	2	10	360415	360424	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3053	NC_017048	CAT	2	6	360437	360442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_017048	AATTAT	2	12	360473	360484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017048	TAT	3	9	360499	360507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017048	TA	3	6	360552	360557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017048	AAT	2	6	360605	360610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017048	AT	3	6	360609	360614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017048	TAA	2	6	360670	360675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017048	TTA	2	6	360744	360749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017048	ATA	2	6	360759	360764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017048	TAT	2	6	360826	360831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017048	AAT	2	6	360842	360847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017048	TAA	2	6	360850	360855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017048	ATT	2	6	360871	360876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017048	TAAA	2	8	360880	360887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017048	TCA	2	6	360899	360904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_017048	ATA	2	6	361020	361025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017048	ACC	2	6	361070	361075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_017048	ATA	2	6	361167	361172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017048	TAA	2	6	361180	361185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017048	AAG	2	6	361202	361207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017048	TTA	2	6	361244	361249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017048	ATTTA	2	10	361254	361263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017048	CTT	2	6	361318	361323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_017048	TATT	2	8	361324	361331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017048	ATCTAA	2	12	361333	361344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3078	NC_017048	ATT	2	6	361345	361350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017048	TAG	2	6	361381	361386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017048	AGTTT	2	10	361452	361461	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017048	A	6	6	361484	361489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017048	GTAA	2	8	361498	361505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017048	AAT	2	6	361510	361515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017048	TTAT	2	8	361576	361583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017048	TCAA	2	8	361608	361615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3086	NC_017048	AT	3	6	361617	361622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017048	CAT	2	6	361668	361673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_017048	TATAA	2	10	361685	361694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017048	GTAA	2	8	361777	361784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017048	TA	3	6	361804	361809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017048	AT	3	6	361817	361822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017048	TAG	2	6	361837	361842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017048	GTA	2	6	361961	361966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017048	TAA	2	6	361967	361972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017048	ATAG	2	8	362012	362019	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017048	AAT	2	6	362044	362049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017048	A	8	8	362057	362064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017048	A	8	8	362080	362087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017048	ATTA	2	8	362116	362123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017048	GAA	2	6	362144	362149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017048	TAA	2	6	362162	362167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017048	A	8	8	362173	362180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017048	TAG	2	6	362181	362186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017048	AGT	2	6	362274	362279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017048	TAT	2	6	362335	362340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017048	A	6	6	362351	362356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017048	AAT	2	6	362362	362367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017048	TA	3	6	362372	362377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017048	AT	3	6	362468	362473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017048	AATCT	2	10	362494	362503	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3111	NC_017048	ATT	2	6	362521	362526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017048	AAG	2	6	362580	362585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017048	GTT	2	6	362610	362615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017048	AAT	2	6	362647	362652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017048	ATCA	2	8	362677	362684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_017048	ATA	2	6	362707	362712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017048	A	6	6	363017	363022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017048	TGA	2	6	363029	363034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017048	AACA	2	8	363038	363045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_017048	GTAT	2	8	363077	363084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017048	TAAT	2	8	364350	364357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017048	AT	3	6	366284	366289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017048	TAG	2	6	366328	366333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017048	CAC	2	6	366364	366369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_017048	GGA	2	6	366370	366375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017048	TAC	2	6	366920	366925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_017048	TCTT	2	8	366965	366972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_017048	TTA	2	6	367095	367100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017048	TAAA	2	8	368785	368792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017048	A	7	7	368790	368796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017048	TA	3	6	368834	368839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017048	TTA	2	6	368843	368848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017048	TTC	2	6	368863	368868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_017048	ATT	2	6	368876	368881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3136	NC_017048	CAG	2	6	368987	368992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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