MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 8509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017048	ACT	2	6	1045946	1045951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_017048	CAAAT	2	10	1045995	1046004	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8003	NC_017048	TAA	2	6	1046041	1046046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017048	TA	3	6	1046050	1046055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017048	A	6	6	1046084	1046089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017048	A	7	7	1046110	1046116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017048	CTTT	2	8	1046122	1046129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8008	NC_017048	TTG	2	6	1049378	1049383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017048	TAA	2	6	1049408	1049413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017048	TAC	2	6	1049433	1049438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_017048	TTA	2	6	1049441	1049446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017048	AC	3	6	1049464	1049469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8013	NC_017048	ATT	2	6	1050497	1050502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017048	ATA	2	6	1050572	1050577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017048	AAAGT	2	10	1050600	1050609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017048	TTTA	2	8	1050621	1050628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017048	AGC	2	6	1050648	1050653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_017048	ACATCA	2	12	1050658	1050669	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_017048	A	6	6	1050695	1050700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017048	T	6	6	1053022	1053027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017048	CTT	2	6	1053054	1053059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_017048	T	7	7	1053103	1053109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017048	AAT	2	6	1053130	1053135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017048	CATTA	2	10	1053148	1053157	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8025	NC_017048	TAA	2	6	1053170	1053175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017048	ATC	3	9	1053204	1053212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_017048	CTT	2	6	1053223	1053228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_017048	ATT	2	6	1053265	1053270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017048	TTTA	2	8	1053311	1053318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017048	TAAAT	2	10	1053430	1053439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017048	TTTA	2	8	1055133	1055140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017048	GTCAT	2	10	1055158	1055167	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8033	NC_017048	CAA	2	6	1055195	1055200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_017048	A	6	6	1055207	1055212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017048	GAC	2	6	1055220	1055225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_017048	ATT	2	6	1055234	1055239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017048	ATA	2	6	1055670	1055675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_017048	CTT	2	6	1055676	1055681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_017048	T	6	6	1055688	1055693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_017048	TCAA	2	8	1055711	1055718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8041	NC_017048	ACT	2	6	1055730	1055735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_017048	TAA	3	9	1055790	1055798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_017048	TTA	2	6	1055835	1055840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017048	ATT	2	6	1057337	1057342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017048	TAT	2	6	1057355	1057360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017048	ATT	2	6	1057375	1057380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017048	ATTACA	2	12	1057410	1057421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8048	NC_017048	TAC	2	6	1057448	1057453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_017048	TAA	2	6	1057481	1057486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017048	ATTAA	2	10	1057490	1057499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017048	TAA	2	6	1057540	1057545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017048	T	6	6	1057660	1057665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017048	GATAA	2	10	1057673	1057682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017048	AAT	2	6	1057747	1057752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_017048	AGA	2	6	1057791	1057796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017048	ATA	2	6	1057802	1057807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017048	AAT	2	6	1057863	1057868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017048	ATTT	2	8	1057900	1057907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017048	ATT	2	6	1057932	1057937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017048	ATTAAT	2	12	1057939	1057950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017048	AT	3	6	1057973	1057978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_017048	CA	3	6	1058019	1058024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8063	NC_017048	A	6	6	1058042	1058047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017048	CTA	2	6	1058048	1058053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_017048	A	6	6	1058053	1058058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017048	ACT	2	6	1058082	1058087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_017048	ATT	2	6	1058095	1058100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017048	ATA	2	6	1058105	1058110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017048	AT	3	6	1058121	1058126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017048	ATTT	2	8	1059566	1059573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017048	TTG	2	6	1059614	1059619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8073	NC_017048	ATT	2	6	1059672	1059677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_017048	ATT	2	6	1059709	1059714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017048	T	7	7	1059719	1059725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_017048	ATGT	2	8	1059744	1059751	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8082	NC_017048	CTTA	2	8	1062459	1062466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8083	NC_017048	AGT	2	6	1062471	1062476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8085	NC_017048	AAT	2	6	1062587	1062592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_017048	CTA	2	6	1062619	1062624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_017048	ATTC	2	8	1062626	1062633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8088	NC_017048	A	6	6	1062664	1062669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017048	TCA	2	6	1062676	1062681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8094	NC_017048	TTTTC	2	10	1062843	1062852	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8095	NC_017048	ATATA	2	10	1062871	1062880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_017048	AAG	2	6	1062913	1062918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8098	NC_017048	GTTA	2	8	1062941	1062948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_017048	AT	3	6	1062969	1062974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_017048	ATT	2	6	1063005	1063010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_017048	TTAA	2	8	1063023	1063030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017048	T	6	6	1063045	1063050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017048	ATTA	2	8	1063092	1063099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_017048	CTTT	2	8	1063133	1063140	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8105	NC_017048	AAG	2	6	1063165	1063170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8107	NC_017048	CT	3	6	1063216	1063221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8108	NC_017048	ATATT	2	10	1063228	1063237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8110	NC_017048	ATT	2	6	1063282	1063287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_017048	ATA	2	6	1063323	1063328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017048	AGA	2	6	1063336	1063341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017048	AAT	2	6	1063355	1063360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017048	TAC	2	6	1063385	1063390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_017048	TGT	2	6	1063393	1063398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8117	NC_017048	TAT	2	6	1063507	1063512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8119	NC_017048	TAA	2	6	1063579	1063584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017048	A	6	6	1063590	1063595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_017048	TCATT	2	10	1063613	1063622	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8122	NC_017048	ACA	2	6	1063661	1063666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_017048	A	6	6	1063681	1063686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017048	ATT	3	9	1063698	1063706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8127	NC_017048	AAT	2	6	1063764	1063769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017048	TATT	2	8	1063774	1063781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017048	AAAT	2	8	1063816	1063823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017048	ATT	2	6	1063838	1063843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_017048	A	6	6	1063871	1063876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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