MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 8509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017048	TTA	2	6	847489	847494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_017048	TAA	2	6	847501	847506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_017048	AT	3	6	847527	847532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_017048	TTG	2	6	847540	847545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_017048	TAAG	2	8	847618	847625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_017048	A	6	6	847631	847636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_017048	TAA	2	6	847645	847650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_017048	GTATA	2	10	847677	847686	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_017048	TTAT	2	8	847701	847708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_017048	TAGT	2	8	847722	847729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_017048	AATA	2	8	847760	847767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_017048	TTG	2	6	847813	847818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_017048	ATT	2	6	847840	847845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_017048	CTTTT	2	10	847929	847938	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6515	NC_017048	GTATC	2	10	847940	847949	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6516	NC_017048	A	8	8	847950	847957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_017048	GTA	2	6	848065	848070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_017048	ATA	2	6	848116	848121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_017048	ATT	2	6	848155	848160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_017048	T	6	6	848198	848203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_017048	ATG	2	6	848225	848230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_017048	AAT	2	6	848272	848277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_017048	AGT	3	9	848292	848300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_017048	TCCTA	2	10	848344	848353	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6525	NC_017048	ATA	2	6	848376	848381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_017048	TGC	2	6	848433	848438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_017048	ATT	3	9	848454	848462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_017048	ATA	2	6	848466	848471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_017048	AAT	2	6	848512	848517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_017048	TGT	2	6	848525	848530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_017048	TAT	2	6	848545	848550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_017048	TAT	2	6	848553	848558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_017048	ATT	2	6	848602	848607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_017048	ATA	2	6	848719	848724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6537	NC_017048	TAT	2	6	848772	848777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_017048	GAG	2	6	848786	848791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_017048	GTA	2	6	848808	848813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_017048	TACT	2	8	848845	848852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6541	NC_017048	TTA	2	6	848870	848875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_017048	TGTAA	2	10	848896	848905	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_017048	TGTAA	2	10	848909	848918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_017048	AGCT	2	8	848931	848938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6545	NC_017048	A	6	6	848961	848966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_017048	TAT	2	6	848967	848972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_017048	CTATT	2	10	848991	849000	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6549	NC_017048	ATA	2	6	849058	849063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_017048	AATAT	2	10	849080	849089	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_017048	TGA	2	6	849171	849176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_017048	TAA	2	6	849208	849213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_017048	AAG	2	6	849218	849223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_017048	ATT	2	6	849239	849244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6558	NC_017048	ATT	2	6	849334	849339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_017048	TAA	2	6	849363	849368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6562	NC_017048	AAT	2	6	849400	849405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6564	NC_017048	TAT	2	6	849501	849506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_017048	AAT	2	6	849553	849558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6574	NC_017048	AT	3	6	849833	849838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_017048	CATA	2	8	849906	849913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6586	NC_017048	TA	3	6	850136	850141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6589	NC_017048	A	6	6	850194	850199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6606	NC_017048	ATA	2	6	851740	851745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_017048	TAT	3	9	851751	851759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6609	NC_017048	ATGC	2	8	851820	851827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6614	NC_017048	TTAT	2	8	851961	851968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_017048	AT	3	6	851967	851972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_017048	ATT	2	6	851997	852002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6619	NC_017048	TA	3	6	854216	854221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6621	NC_017048	TATTG	2	10	854241	854250	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_017048	TGT	2	6	854277	854282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_017048	A	6	6	854310	854315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6626	NC_017048	A	6	6	859115	859120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_017048	T	7	7	859121	859127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6631	NC_017048	AAT	2	6	859267	859272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6632	NC_017048	TTAA	2	8	859318	859325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6633	NC_017048	T	6	6	859837	859842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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