MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 8509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017048	TTA	2	6	2	7	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017048	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017048	TAA	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017048	TTA	2	6	155	160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017048	TA	3	6	327	332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017048	A	7	7	332	338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017048	TAA	2	6	445	450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017048	TA	3	6	466	471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017048	T	7	7	490	496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017048	ATT	2	6	535	540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017048	TAT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017048	ATG	2	6	595	600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017048	AAC	2	6	615	620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017048	AT	3	6	627	632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017048	TTA	2	6	674	679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017048	TAAG	2	8	736	743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017048	TAA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017048	A	7	7	804	810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017048	CTTA	2	8	907	914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017048	ATA	2	6	980	985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017048	ATT	2	6	991	996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017048	TAA	2	6	1023	1028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017048	TAA	2	6	1065	1070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017048	A	6	6	1069	1074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017048	AATC	2	8	1155	1162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017048	AT	3	6	1182	1187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017048	CTTC	2	8	1189	1196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017048	TAA	2	6	1237	1242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017048	ATT	2	6	1293	1298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017048	T	6	6	1301	1306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017048	TA	4	8	1356	1363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017048	TAG	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017048	T	6	6	1595	1600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017048	ATTT	2	8	1617	1624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017048	T	7	7	1627	1633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017048	TAAT	2	8	1656	1663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017048	TA	3	6	1665	1670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017048	ATA	2	6	1698	1703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017048	A	6	6	1728	1733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017048	AGA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017048	TAA	2	6	1771	1776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017048	AT	3	6	1781	1786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017048	T	6	6	1820	1825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017048	AT	3	6	1835	1840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017048	AT	3	6	1856	1861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017048	ATT	2	6	1883	1888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017048	TAT	2	6	1889	1894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017048	AATA	2	8	1913	1920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017048	ATA	2	6	1948	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017048	AAT	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017048	CATA	2	8	1961	1968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017048	TAG	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017048	TA	3	6	2052	2057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017048	T	6	6	2060	2065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017048	TTA	2	6	2079	2084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017048	AATG	2	8	2085	2092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017048	ATT	2	6	2100	2105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017048	TAT	2	6	2129	2134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017048	TAA	2	6	2166	2171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017048	AAG	2	6	2214	2219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017048	TAA	2	6	2225	2230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017048	GAAAT	2	10	2274	2283	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017048	AAG	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017048	A	6	6	2297	2302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017048	TA	3	6	2374	2379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017048	AGG	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017048	CAC	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017048	GT	3	6	2550	2555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017048	ATG	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017048	CGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017048	TCC	2	6	2769	2774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017048	AATAAG	2	12	2824	2835	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017048	CACGA	2	10	2870	2879	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017048	GAC	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017048	TG	4	8	2903	2910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017048	ACC	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017048	TCC	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017048	TCC	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017048	CAT	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017048	CTA	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017048	TAG	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017048	AAC	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017048	GCT	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017048	TCA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017048	CTG	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017048	ATC	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017048	TCG	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017048	CATC	2	8	3696	3703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017048	TCC	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017048	CGTT	2	8	3873	3880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017048	CTAT	2	8	3980	3987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017048	ATT	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017048	ATT	2	6	4083	4088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017048	T	7	7	4092	4098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017048	TAA	2	6	4144	4149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017048	A	8	8	4166	4173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017048	A	6	6	4181	4186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017048	CTTA	2	8	4209	4216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017048	AAAC	2	8	4236	4243	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017048	TA	3	6	4276	4281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017048	TAC	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017048	AGT	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017048	ATC	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017048	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017048	AAAT	2	8	4354	4361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017048	ATT	2	6	4366	4371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017048	GCT	2	6	4372	4377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017048	T	6	6	4384	4389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017048	ATT	2	6	4489	4494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017048	TGT	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017048	AT	3	6	4572	4577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017048	ACAT	2	8	4582	4589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017048	ATT	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017048	T	6	6	4677	4682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017048	TTA	2	6	4691	4696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017048	CAT	2	6	4697	4702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017048	AAG	2	6	4715	4720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017048	GAA	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017048	ATC	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017048	ACT	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017048	ATA	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017048	CTC	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017048	T	7	7	4904	4910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017048	AGATA	2	10	4925	4934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017048	AGTT	2	8	4959	4966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017048	TAAA	2	8	4968	4975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017048	A	6	6	4973	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017048	AT	3	6	5023	5028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017048	ATG	2	6	5033	5038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017048	TAT	2	6	5052	5057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017048	A	6	6	5071	5076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017048	AAT	2	6	5087	5092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017048	ATA	2	6	5107	5112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017048	TAT	2	6	5115	5120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017048	TAT	2	6	5196	5201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017048	GT	3	6	5229	5234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017048	ATTA	2	8	5253	5260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017048	CAT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017048	ATT	2	6	5333	5338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017048	TTA	2	6	5352	5357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017048	A	6	6	7198	7203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017048	AAT	2	6	7212	7217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017048	TCAT	2	8	7228	7235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017048	A	6	6	7252	7257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017048	ATAA	2	8	7262	7269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017048	TA	3	6	7338	7343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017048	ATTA	2	8	8317	8324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017048	ATA	2	6	8326	8331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017048	CTT	2	6	8343	8348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017048	ATT	2	6	8366	8371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017048	TAT	2	6	8382	8387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017048	TAT	2	6	8448	8453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017048	A	6	6	8517	8522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017048	TAAA	2	8	8526	8533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_017048	AGC	2	6	52232	52237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_017048	ATTT	2	8	52244	52251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_017048	TAA	2	6	52272	52277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_017048	TAT	2	6	53064	53069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017048	AAC	2	6	53128	53133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_017048	AT	3	6	53158	53163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017048	ATTA	2	8	53174	53181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017048	TA	4	8	53189	53196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017048	ATC	2	6	53199	53204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_017048	TAATCT	2	12	53235	53246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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466	NC_017048	TAC	2	6	54932	54937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_017048	TAA	2	6	54982	54987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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