MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 14320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017047	CTGC	2	8	1238438	1238445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_017047	TCT	2	6	1238452	1238457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017047	T	6	6	1242187	1242192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017047	TGG	2	6	1242194	1242199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017047	A	6	6	1242254	1242259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017047	A	6	6	1242296	1242301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017047	GA	3	6	1242418	1242423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017047	ATCA	2	8	1242425	1242432	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_017047	AAAG	2	8	1243033	1243040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017047	CTG	2	6	1243050	1243055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_017047	ACAG	2	8	1243660	1243667	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3512	NC_017047	TTC	2	6	1243713	1243718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_017047	GCT	2	6	1243745	1243750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_017047	AAT	2	6	1243786	1243791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017047	AGC	2	6	1247652	1247657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_017047	A	8	8	1248620	1248627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017047	T	6	6	1248655	1248660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017047	CT	3	6	1250718	1250723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_017047	AGTC	2	8	1252112	1252119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_017047	T	6	6	1252145	1252150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017047	CATC	2	8	1252152	1252159	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_017047	TTCA	2	8	1252190	1252197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_017047	ACTT	2	8	1252206	1252213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_017047	ATTC	2	8	1252230	1252237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_017047	TC	3	6	1252236	1252241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_017047	GCC	2	6	1252242	1252247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_017047	CAA	2	6	1252282	1252287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_017047	CGC	2	6	1252302	1252307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_017047	TTG	2	6	1252322	1252327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017047	CTCA	2	8	1252338	1252345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_017047	CATC	2	8	1252350	1252357	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_017047	T	6	6	1252834	1252839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017047	CCTG	2	8	1252921	1252928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_017047	A	7	7	1252940	1252946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017047	TGC	2	6	1252974	1252979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3540	NC_017047	ACC	2	6	1253216	1253221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_017047	CTGG	2	8	1253350	1253357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_017047	TAC	2	6	1253376	1253381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_017047	CGC	2	6	1253413	1253418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_017047	GCG	2	6	1253445	1253450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_017047	GCC	2	6	1253469	1253474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3547	NC_017047	GCC	2	6	1253529	1253534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_017047	CTGG	2	8	1253564	1253571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_017047	TTC	2	6	1253579	1253584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_017047	TGC	2	6	1253634	1253639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_017047	GC	3	6	1253638	1253643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_017047	GCC	2	6	1253684	1253689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_017047	CGC	2	6	1253690	1253695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_017047	CAT	2	6	1253718	1253723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3556	NC_017047	GGC	2	6	1253837	1253842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_017047	GCG	2	6	1253859	1253864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_017047	CGC	2	6	1253928	1253933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_017047	TGA	2	6	1254118	1254123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017047	TGG	2	6	1254144	1254149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017047	GAA	2	6	1254154	1254159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017047	GTT	2	6	1254186	1254191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017047	CTG	2	6	1254195	1254200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_017047	GCG	2	6	1254332	1254337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_017047	TTC	2	6	1254341	1254346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_017047	AGA	2	6	1254373	1254378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017047	A	7	7	1254378	1254384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017047	GAT	2	6	1257048	1257053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3570	NC_017047	TTC	2	6	1258752	1258757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_017047	ATT	2	6	1259771	1259776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_017047	CGTCA	2	10	1259788	1259797	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3573	NC_017047	TA	4	8	1259819	1259826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3582	NC_017047	TGA	2	6	1261001	1261006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3594	NC_017047	GGAACC	2	12	1261473	1261484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_017047	CGGCA	2	10	1261521	1261530	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3596	NC_017047	CAC	2	6	1261569	1261574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_017047	TCAG	2	8	1261592	1261599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_017047	GC	3	6	1261676	1261681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_017047	CTG	2	6	1261696	1261701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3602	NC_017047	CGT	2	6	1261807	1261812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3604	NC_017047	GCG	2	6	1261846	1261851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_017047	CCG	2	6	1261853	1261858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_017047	GT	3	6	1261859	1261864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017047	A	6	6	1261867	1261872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_017047	T	6	6	1261918	1261923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3610	NC_017047	GTG	2	6	1261932	1261937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017047	ATC	3	9	1261966	1261974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_017047	T	6	6	1264598	1264603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017047	T	6	6	1264652	1264657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017047	AAC	2	6	1264716	1264721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_017047	GT	3	6	1264736	1264741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3620	NC_017047	CTG	2	6	1265894	1265899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3622	NC_017047	CCCCA	2	10	1268082	1268091	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3623	NC_017047	GGGA	2	8	1268108	1268115	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017047	A	6	6	1268129	1268134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_017047	TGC	2	6	1268205	1268210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3627	NC_017047	TAT	2	6	1268232	1268237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_017047	TTTTCT	2	12	1268275	1268286	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3630	NC_017047	ACA	2	6	1268868	1268873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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