MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 14320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017047	TA	3	6	1946002	1946007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017047	GTAT	2	8	1947219	1947226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017047	AGGGG	2	10	1947317	1947326	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017047	GCT	2	6	1947333	1947338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_017047	T	6	6	1947384	1947389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017047	ATT	2	6	1948529	1948534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017047	TATTG	2	10	1948557	1948566	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017047	GAT	2	6	1948585	1948590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017047	TGA	2	6	1948679	1948684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017047	CCA	2	6	1948700	1948705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_017047	A	6	6	1948779	1948784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_017047	TTTA	2	8	1948826	1948833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017047	GTT	2	6	1948889	1948894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017047	CTG	2	6	1948911	1948916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_017047	CGG	2	6	1948962	1948967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_017047	G	6	6	1949007	1949012	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017047	GCG	2	6	1949069	1949074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_017047	CTG	2	6	1949083	1949088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017047	C	6	6	1949093	1949098	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5520	NC_017047	AAT	2	6	1951773	1951778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017047	A	6	6	1952817	1952822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017047	AAC	2	6	1952895	1952900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_017047	ACC	2	6	1956421	1956426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_017047	AAAT	2	8	1959536	1959543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017047	CTG	2	6	1959548	1959553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5531	NC_017047	CGT	2	6	1959745	1959750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_017047	CCG	2	6	1959782	1959787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_017047	CTCC	2	8	1963589	1963596	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5534	NC_017047	TGGGG	2	10	1963614	1963623	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017047	TTGC	2	8	1963785	1963792	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5536	NC_017047	T	6	6	1963916	1963921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017047	ATA	2	6	1966469	1966474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017047	AAT	2	6	1966496	1966501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017047	T	7	7	1966580	1966586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017047	ATTT	2	8	1966612	1966619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017047	A	6	6	1966627	1966632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_017047	ATA	2	6	1966647	1966652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017047	ATG	2	6	1966679	1966684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017047	TCC	2	6	1966694	1966699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5545	NC_017047	GGGCA	2	10	1966750	1966759	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5549	NC_017047	AGA	2	6	1966818	1966823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017047	CAG	2	6	1966846	1966851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5552	NC_017047	TTA	2	6	1967376	1967381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017047	GAC	2	6	1967791	1967796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_017047	GT	3	6	1967805	1967810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017047	AAC	2	6	1967860	1967865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_017047	CTA	2	6	1968636	1968641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5558	NC_017047	AC	3	6	1970369	1970374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_017047	GCA	2	6	1971663	1971668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5561	NC_017047	T	6	6	1973312	1973317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017047	T	8	8	1976145	1976152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017047	GGT	2	6	1976234	1976239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017047	ACTT	2	8	1979129	1979136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5569	NC_017047	GGGA	2	8	1980555	1980562	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017047	TCCC	2	8	1980573	1980580	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5571	NC_017047	TTA	2	6	1981527	1981532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5598	NC_017047	A	6	6	1991242	1991247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017047	CGA	2	6	1991353	1991358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5602	NC_017047	GGC	2	6	1992851	1992856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5610	NC_017047	ATGGG	2	10	1995526	1995535	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_017047	AT	3	6	1995550	1995555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5614	NC_017047	ATT	3	9	1996654	1996662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_017047	CAA	2	6	1996700	1996705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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