MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 14320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017047	A	6	6	2	7	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017047	CTTTT	2	10	18	27	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017047	T	6	6	24	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017047	ACTG	2	8	2642	2649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017047	CGA	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017047	TAG	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017047	T	9	9	6250	6258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017047	GGCT	2	8	6281	6288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017047	A	6	6	8935	8940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017047	AAGC	2	8	8947	8954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017047	TCA	2	6	9064	9069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017047	ACA	2	6	9075	9080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017047	T	6	6	9087	9092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017047	T	6	6	9094	9099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017047	ACG	2	6	9139	9144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017047	AGG	2	6	9146	9151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017047	TTC	2	6	9168	9173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017047	TCA	2	6	9176	9181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017047	A	6	6	9217	9222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017047	CAT	2	6	9669	9674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017047	GTT	2	6	9676	9681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017047	GAC	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017047	ATC	2	6	9759	9764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017047	AAG	2	6	9773	9778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017047	TGA	2	6	10273	10278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017047	AT	3	6	10282	10287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017047	AGTA	2	8	10298	10305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017047	TATT	2	8	10316	10323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017047	TGA	2	6	10368	10373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017047	CGATG	2	10	10889	10898	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017047	TGA	2	6	10908	10913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017047	ACT	2	6	10924	10929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017047	AG	3	6	10960	10965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017047	CCA	2	6	11039	11044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017047	GTT	2	6	11056	11061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017047	TGTA	2	8	11081	11088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017047	A	7	7	11101	11107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017047	TGTA	2	8	11109	11116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017047	GTTT	2	8	11119	11126	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017047	AT	3	6	11132	11137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017047	T	6	6	11169	11174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017047	A	6	6	11180	11185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017047	ATA	2	6	11213	11218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017047	ATAA	2	8	11281	11288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017047	T	8	8	11294	11301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017047	A	6	6	11312	11317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017047	TA	4	8	11336	11343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017047	T	7	7	11355	11361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017047	GAAT	2	8	11362	11369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017047	GT	3	6	11370	11375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017047	ATAA	2	8	11396	11403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017047	ATG	2	6	11408	11413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017047	TCC	2	6	11489	11494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017047	CCA	2	6	12799	12804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017047	GCA	2	6	12813	12818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017047	A	6	6	12863	12868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017047	TAA	2	6	12942	12947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017047	A	6	6	12946	12951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017047	T	6	6	12964	12969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017047	AT	5	10	12996	13005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017047	AAT	2	6	14239	14244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017047	GTT	2	6	17447	17452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017047	GAA	2	6	17536	17541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017047	GAA	2	6	17558	17563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017047	CTT	2	6	18616	18621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017047	T	6	6	20007	20012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017047	GCT	2	6	22150	22155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017047	CAAA	2	8	22157	22164	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017047	TAT	2	6	24049	24054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017047	GGA	2	6	24139	24144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017047	GCG	2	6	24155	24160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017047	GT	3	6	25302	25307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017047	AC	3	6	25341	25346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017047	ATT	2	6	25432	25437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017047	ATT	2	6	27466	27471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017047	ATG	2	6	27485	27490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017047	A	6	6	27522	27527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017047	CT	3	6	28146	28151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017047	CTCC	2	8	31189	31196	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_017047	GAG	2	6	31236	31241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017047	T	6	6	31274	31279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017047	C	6	6	31292	31297	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_017047	GAA	3	9	31354	31362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017047	CTGA	2	8	32112	32119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017047	T	6	6	32155	32160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017047	A	6	6	32190	32195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017047	T	6	6	32202	32207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017047	T	6	6	32255	32260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017047	TCT	2	6	33119	33124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017047	CTT	2	6	33217	33222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017047	TTC	2	6	33223	33228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017047	CAG	2	6	33273	33278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017047	T	6	6	33290	33295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017047	AGA	2	6	35071	35076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017047	TTTC	2	8	35111	35118	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017047	TC	3	6	35123	35128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017047	TTTCC	2	10	35142	35151	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017047	AAT	2	6	35289	35294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017047	TGA	3	9	35327	35335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017047	GACG	2	8	35450	35457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017047	AAC	2	6	35487	35492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017047	TTG	2	6	37523	37528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017047	GGC	2	6	37540	37545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017047	AAAG	2	8	38789	38796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017047	CGGG	2	8	38803	38810	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017047	GC	3	6	38828	38833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017047	GCC	2	6	39531	39536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017047	TAT	2	6	41835	41840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017047	CTC	2	6	42280	42285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017047	C	6	6	42285	42290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_017047	GCT	2	6	42995	43000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017047	GTT	2	6	45111	45116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017047	TAA	2	6	45117	45122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017047	TAA	2	6	45169	45174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017047	TGG	2	6	45175	45180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017047	GAA	2	6	45187	45192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017047	A	6	6	45237	45242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017047	CAT	3	9	45273	45281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017047	GGC	2	6	45292	45297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017047	GGC	2	6	45950	45955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017047	TTAA	2	8	45998	46005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017047	AG	4	8	46130	46137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017047	T	6	6	46933	46938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017047	GAT	2	6	47105	47110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017047	GCT	2	6	52690	52695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017047	CGA	2	6	52713	52718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017047	GAG	2	6	52723	52728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017047	ACCCC	2	10	55035	55044	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
129	NC_017047	GGGA	2	8	55062	55069	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017047	CTC	2	6	55087	55092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017047	CGGG	2	8	56446	56453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017047	ATT	2	6	56491	56496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017047	CAA	2	6	56587	56592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017047	AAG	2	6	56601	56606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017047	ATT	2	6	57627	57632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017047	CAT	2	6	57639	57644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017047	ATTT	2	8	57669	57676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017047	TTATT	2	10	57681	57690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017047	ATT	2	6	57746	57751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017047	GCC	2	6	57790	57795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017047	AAAT	2	8	57801	57808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017047	ATC	2	6	57828	57833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017047	TTG	2	6	57849	57854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017047	GCCA	2	8	57862	57869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017047	TCAT	2	8	58009	58016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017047	ATTC	2	8	58017	58024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017047	TAAA	2	8	58041	58048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017047	TTA	2	6	58067	58072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017047	GCATCA	2	12	58084	58095	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017047	TAT	2	6	58106	58111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017047	ATT	2	6	58137	58142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017047	ATGG	2	8	58248	58255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_017047	AGCG	2	8	69522	69529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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