MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 7748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017045	ATT	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017045	CACAGC	2	12	31	42	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017045	AACC	2	8	1882	1889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017045	TA	3	6	1985	1990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017045	A	6	6	1997	2002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017045	AAC	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017045	A	6	6	2154	2159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017045	A	6	6	2187	2192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017045	TGTGG	2	10	2223	2232	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017045	A	6	6	2259	2264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017045	GAAC	2	8	2863	2870	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017045	CAA	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017045	GAC	2	6	3014	3019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017045	AGA	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017045	ACT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017045	TAG	2	6	4026	4031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017045	AAC	2	6	4122	4127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017045	TTG	2	6	4142	4147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017045	A	6	6	4152	4157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017045	A	6	6	4179	4184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017045	AATT	2	8	4199	4206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017045	T	7	7	5149	5155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017045	AAAC	2	8	5284	5291	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017045	TTG	2	6	5331	5336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017045	AAC	2	6	5350	5355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017045	CAA	2	6	6048	6053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017045	T	6	6	6081	6086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017045	TAA	2	6	6138	6143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017045	CAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017045	TAA	2	6	6232	6237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017045	AAT	2	6	6248	6253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017045	GCCC	2	8	6993	7000	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017045	A	6	6	7035	7040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017045	TTC	2	6	7704	7709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017045	A	6	6	7773	7778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017045	A	6	6	7786	7791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017045	TAATTA	2	12	7798	7809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017045	A	6	6	7809	7814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017045	CGT	2	6	8375	8380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017045	ACA	2	6	8381	8386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017045	TTCAA	2	10	8456	8465	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017045	GTT	2	6	8670	8675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017045	ATT	3	9	8787	8795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017045	CCT	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017045	ATA	2	6	8851	8856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017045	GAA	2	6	8874	8879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017045	AGG	2	6	8943	8948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017045	ATA	2	6	8951	8956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017045	ATAA	2	8	8999	9006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017045	ACA	2	6	9024	9029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017045	ATT	2	6	9047	9052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017045	TAAAGA	2	12	9123	9134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017045	ACA	2	6	9149	9154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017045	T	7	7	9182	9188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017045	AAG	2	6	9241	9246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017045	T	6	6	9312	9317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017045	A	6	6	9348	9353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017045	AAC	2	6	9388	9393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017045	T	6	6	9962	9967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017045	A	6	6	10110	10115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017045	AAT	2	6	10130	10135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017045	GAC	2	6	10202	10207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017045	A	6	6	10240	10245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017045	A	6	6	10306	10311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017045	AAAGG	2	10	10325	10334	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017045	A	6	6	10401	10406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017045	A	7	7	10517	10523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017045	A	6	6	10699	10704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017045	GTT	2	6	10760	10765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017045	ATT	3	9	10877	10885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017045	CCT	2	6	10917	10922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017045	ATA	2	6	10941	10946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017045	GAA	2	6	10964	10969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017045	ATA	2	6	11041	11046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017045	ACA	2	6	11114	11119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017045	ATT	2	6	11137	11142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017045	TAAAGA	2	12	11213	11224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017045	ACA	2	6	11246	11251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017045	T	7	7	11279	11285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017045	TAA	2	6	11337	11342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017045	CAAA	2	8	11439	11446	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017045	AGT	2	6	14184	14189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017045	A	8	8	14277	14284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017045	A	6	6	14288	14293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017045	ATA	2	6	14365	14370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017045	GAG	2	6	15162	15167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017045	T	7	7	15219	15225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017045	GCCC	2	8	15294	15301	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_017045	A	6	6	15363	15368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017045	CAG	2	6	16212	16217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017045	AAGT	2	8	16288	16295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017045	ACT	2	6	16343	16348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017045	AG	3	6	16426	16431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017045	T	6	6	16450	16455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017045	ACA	2	6	16511	16516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017045	A	6	6	16565	16570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017045	GAATT	2	10	16590	16599	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017045	A	6	6	16602	16607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017045	GAAATG	2	12	16701	16712	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017045	A	6	6	16741	16746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017045	TTTG	2	8	16758	16765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017045	TTA	2	6	16781	16786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017045	TGT	2	6	16793	16798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017045	T	7	7	16815	16821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017045	CTT	2	6	16828	16833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017045	CCA	2	6	16843	16848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017045	A	8	8	16865	16872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017045	CTG	2	6	17021	17026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017045	TGGAGT	2	12	17076	17087	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017045	A	6	6	17099	17104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017045	CTT	2	6	17111	17116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017045	CTG	2	6	17129	17134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017045	TGAAAA	2	12	17708	17719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017045	TTCAA	2	10	17746	17755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017045	ATAAA	2	10	18617	18626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017045	TAA	2	6	18627	18632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017045	A	6	6	18631	18636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017045	AAT	2	6	18663	18668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017045	AGA	2	6	18675	18680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017045	A	7	7	18803	18809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017045	A	6	6	18820	18825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017045	GATGT	2	10	18842	18851	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017045	AGGAA	2	10	18900	18909	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017045	TAA	2	6	18911	18916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017045	A	7	7	18993	18999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017045	TTGAA	2	10	19098	19107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017045	A	6	6	19286	19291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017045	TTTA	2	8	19296	19303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017045	ATC	2	6	19310	19315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017045	GTT	2	6	19329	19334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017045	CAT	2	6	19335	19340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017045	ATC	2	6	19348	19353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017045	GA	3	6	19376	19381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017045	A	6	6	19469	19474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017045	AAT	2	6	19484	19489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017045	A	9	9	19569	19577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017045	A	6	6	19615	19620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017045	TTC	2	6	19632	19637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017045	TTCAA	2	10	19794	19803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017045	TTA	2	6	19810	19815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017045	GCCC	2	8	19879	19886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_017045	A	6	6	19954	19959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017045	AAT	2	6	19974	19979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017045	GAC	2	6	20046	20051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017045	A	6	6	20083	20088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017045	A	7	7	20149	20155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017045	A	6	6	20200	20205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017045	T	7	7	20405	20411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017045	TAA	2	6	20464	20469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017045	TTGAA	2	10	21459	21468	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017045	TTCAA	2	10	21497	21506	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017045	TAA	2	6	21514	21519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017045	TGGT	2	8	21548	21555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017045	A	6	6	21635	21640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017045	AAAT	2	8	21658	21665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017045	AAC	2	6	22197	22202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017045	CAA	2	6	22210	22215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017045	T	6	6	22242	22247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017045	AAG	2	6	22300	22305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017045	A	7	7	22348	22354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017045	ACTAA	2	10	22420	22429	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_017045	TAAA	2	8	22439	22446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017045	ATT	2	6	22514	22519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017045	A	6	6	22546	22551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017045	AAT	2	6	22587	22592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017045	CGT	2	6	23071	23076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_017045	TAA	2	6	23146	23151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017045	CCCG	2	8	23175	23182	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
169	NC_017045	A	6	6	23231	23236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017045	TCAAT	2	10	23752	23761	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_017045	T	7	7	23761	23767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017045	ATTTA	2	10	23768	23777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017045	GCCC	2	8	23836	23843	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
174	NC_017045	AGA	2	6	23891	23896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017045	TAC	2	6	24559	24564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_017045	CAA	2	6	24568	24573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_017045	GATT	2	8	24591	24598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017045	TAA	2	6	24658	24663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017045	A	6	6	24738	24743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017045	AAT	2	6	24758	24763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017045	GAC	2	6	24830	24835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_017045	A	6	6	24868	24873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017045	A	6	6	24934	24939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017045	AAAGG	2	10	24953	24962	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017045	A	6	6	25029	25034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017045	ATAA	2	8	25717	25724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017045	ACA	2	6	25742	25747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_017045	ATT	2	6	25765	25770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017045	TAAAGA	2	12	25841	25852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
190	NC_017045	ACA	2	6	25867	25872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_017045	T	7	7	25900	25906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_017045	AAG	2	6	25959	25964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
193	NC_017045	AAT	2	6	25999	26004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_017045	ATT	2	6	26011	26016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_017045	TTA	2	6	26032	26037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_017045	ACA	2	6	26598	26603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_017045	T	6	6	26682	26687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_017045	AAAT	2	8	26821	26828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_017045	A	6	6	26842	26847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_017045	ATA	2	6	34947	34952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_017045	TAA	2	6	35095	35100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_017045	CTG	2	6	41882	41887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_017045	CT	3	6	41929	41934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
280	NC_017045	TTTAT	2	10	41953	41962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017045	TGA	2	6	41976	41981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_017045	TAT	2	6	42186	42191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_017045	GAAA	2	8	42207	42214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017045	ATG	2	6	42236	42241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017045	GGA	2	6	42258	42263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017045	GGA	3	9	42271	42279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017045	ATCT	2	8	42283	42290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
293	NC_017045	TA	3	6	42334	42339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017045	ATT	2	6	42346	42351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_017045	GGTT	2	8	44355	44362	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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