MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 8190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017044	ATT	2	6	688245	688250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017044	AT	3	6	688256	688261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017044	ATTTAA	2	12	688280	688291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017044	ATT	2	6	688388	688393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017044	ATT	2	6	688419	688424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017044	CT	3	6	688442	688447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_017044	ATTA	2	8	688453	688460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017044	ATA	2	6	688461	688466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017044	A	6	6	688484	688489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017044	GCA	2	6	688499	688504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017044	GAT	2	6	688523	688528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017044	AT	3	6	688545	688550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017044	GTT	2	6	688577	688582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017044	TAT	2	6	688583	688588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017044	ATAG	2	8	688634	688641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017044	GAA	2	6	688655	688660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017044	AT	3	6	688664	688669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017044	CTAT	2	8	688680	688687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4019	NC_017044	A	6	6	688705	688710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017044	ATA	2	6	688782	688787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017044	TTA	2	6	688826	688831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017044	GA	3	6	688895	688900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017044	GA	3	6	688909	688914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017044	A	6	6	688925	688930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017044	AAT	2	6	688956	688961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017044	A	6	6	688964	688969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017044	TGA	2	6	688986	688991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017044	ACA	2	6	689022	689027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_017044	AT	3	6	689045	689050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017044	AAC	2	6	689065	689070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017044	AGC	2	6	689109	689114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_017044	A	7	7	689159	689165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017044	GAA	2	6	689166	689171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017044	TGC	2	6	689189	689194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4037	NC_017044	GAA	2	6	689298	689303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017044	TGC	2	6	689324	689329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_017044	TAA	2	6	689336	689341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017044	ATAA	2	8	689346	689353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017044	TAAG	2	8	689377	689384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017044	AAG	2	6	689392	689397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017044	ATT	2	6	689450	689455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017044	ATG	2	6	689464	689469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017044	A	7	7	689471	689477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017044	TCA	2	6	689479	689484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017044	TAT	2	6	689486	689491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017044	A	9	9	689498	689506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017044	AT	3	6	689517	689522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017044	TAT	2	6	689636	689641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017044	TGA	2	6	689642	689647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017044	A	6	6	689647	689652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017044	AAAG	2	8	689654	689661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017044	AAT	2	6	689708	689713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017044	CAT	2	6	689715	689720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_017044	TTA	2	6	689832	689837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017044	AAG	2	6	689866	689871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017044	TATT	2	8	689878	689885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017044	CTT	2	6	689959	689964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_017044	TGC	2	6	689990	689995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4062	NC_017044	ACC	2	6	690062	690067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_017044	T	7	7	690123	690129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017044	A	6	6	690239	690244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017044	A	7	7	690268	690274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017044	A	6	6	690278	690283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017044	AAGG	2	8	690324	690331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017044	CAT	2	6	690531	690536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4070	NC_017044	TTG	2	6	690594	690599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017044	CAT	2	6	690607	690612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_017044	TAC	2	6	690619	690624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_017044	T	7	7	690653	690659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017044	A	6	6	690660	690665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017044	ATT	2	6	690700	690705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017044	TAT	2	6	690716	690721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017044	TTATT	2	10	691409	691418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4080	NC_017044	A	7	7	691602	691608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017044	TTA	2	6	691611	691616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017044	TAC	2	6	691636	691641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_017044	GAA	2	6	691644	691649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017044	TAT	2	6	693363	693368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4086	NC_017044	TTA	2	6	693450	693455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017044	CCT	2	6	693462	693467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_017044	TAAT	2	8	693488	693495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017044	TAT	3	9	694148	694156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017044	AATT	2	8	694167	694174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017044	AGTCA	2	10	694181	694190	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4092	NC_017044	GAG	2	6	694213	694218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017044	CTAA	2	8	694225	694232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_017044	ACG	2	6	694240	694245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4097	NC_017044	TAC	2	6	694458	694463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_017044	TGC	2	6	694509	694514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_017044	TCT	2	6	694570	694575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017044	TTG	2	6	694582	694587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017044	CCT	2	6	694599	694604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_017044	TC	3	6	694616	694621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_017044	CTA	2	6	694662	694667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017044	AAC	2	6	694701	694706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017044	GAA	2	6	694743	694748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017044	TTA	2	6	694879	694884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017044	A	7	7	694927	694933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017044	A	6	6	694949	694954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017044	A	6	6	694993	694998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017044	AT	4	8	695013	695020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017044	ATA	3	9	695023	695031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017044	AT	3	6	695035	695040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017044	TAA	2	6	695042	695047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017044	ATCTAG	2	12	695048	695059	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4115	NC_017044	A	7	7	695083	695089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017044	CAC	2	6	695131	695136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_017044	TCTA	2	8	695159	695166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_017044	CAA	2	6	695167	695172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_017044	ATC	2	6	695188	695193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_017044	AG	3	6	695195	695200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017044	TGA	2	6	695276	695281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017044	ATC	2	6	695309	695314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017044	TAA	2	6	695318	695323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017044	CAG	2	6	695329	695334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_017044	A	7	7	695369	695375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017044	AAG	2	6	695401	695406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017044	TAC	2	6	695416	695421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_017044	AG	3	6	695434	695439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017044	TAA	2	6	695578	695583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017044	AAC	2	6	695615	695620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_017044	AGATA	2	10	695638	695647	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017044	TTG	2	6	695694	695699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017044	TTAT	2	8	695744	695751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017044	GTA	2	6	695756	695761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017044	TAC	2	6	695826	695831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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