MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 8190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_017044	TCT	2	6	1090352	1090357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_017044	GT	3	6	1090381	1090386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_017044	AT	4	8	1090402	1090409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_017044	ATT	2	6	1090428	1090433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_017044	ATA	2	6	1090451	1090456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_017044	CA	3	6	1090472	1090477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7008	NC_017044	T	7	7	1092653	1092659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_017044	TGT	2	6	1092665	1092670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_017044	ATC	2	6	1092682	1092687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7012	NC_017044	GAG	2	6	1093491	1093496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_017044	AAT	2	6	1093896	1093901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_017044	TCT	2	6	1093905	1093910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_017044	ATT	2	6	1094596	1094601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017044	AAT	2	6	1094606	1094611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_017044	ATA	2	6	1095188	1095193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_017044	A	6	6	1095313	1095318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_017044	ATC	2	6	1095372	1095377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_017044	ATG	2	6	1095390	1095395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_017044	TCT	2	6	1095550	1095555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_017044	TACA	2	8	1095557	1095564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7023	NC_017044	TTC	2	6	1095588	1095593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_017044	ATT	2	6	1095606	1095611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_017044	T	8	8	1095610	1095617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_017044	T	7	7	1095633	1095639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7033	NC_017044	TTTC	2	8	1095989	1095996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7038	NC_017044	ATA	2	6	1096359	1096364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_017044	T	6	6	1096368	1096373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_017044	GTC	2	6	1096381	1096386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_017044	TTC	2	6	1096393	1096398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_017044	TA	3	6	1096411	1096416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7044	NC_017044	ATT	2	6	1097318	1097323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7049	NC_017044	TGT	2	6	1099421	1099426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_017044	T	6	6	1099480	1099485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7052	NC_017044	ACTA	2	8	1099601	1099608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7053	NC_017044	T	8	8	1099783	1099790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_017044	TA	3	6	1099813	1099818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7056	NC_017044	A	7	7	1100468	1100474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_017044	TAATA	2	10	1100492	1100501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7060	NC_017044	ATT	2	6	1101286	1101291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_017044	CA	3	6	1101348	1101353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7062	NC_017044	GAC	2	6	1101378	1101383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_017044	TA	3	6	1101398	1101403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_017044	ATA	2	6	1101406	1101411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_017044	CTTT	2	8	1101422	1101429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7066	NC_017044	ATTTA	2	10	1102654	1102663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7075	NC_017044	TA	3	6	1102837	1102842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7103	NC_017044	AAT	2	6	1104930	1104935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_017044	TA	3	6	1104994	1104999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7108	NC_017044	ACG	2	6	1106393	1106398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7110	NC_017044	AGC	2	6	1106663	1106668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_017044	TTAA	2	8	1112476	1112483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_017044	TAA	3	9	1112481	1112489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_017044	ATT	2	6	1112494	1112499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_017044	TGT	2	6	1112502	1112507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_017044	TAT	2	6	1112508	1112513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_017044	TA	3	6	1112516	1112521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_017044	TAT	2	6	1113926	1113931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_017044	ATC	2	6	1113946	1113951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_017044	GCGA	2	8	1113955	1113962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7120	NC_017044	CCT	2	6	1114010	1114015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7121	NC_017044	AAG	2	6	1114092	1114097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_017044	TC	3	6	1114132	1114137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7123	NC_017044	A	6	6	1114150	1114155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_017044	ATC	2	6	1114177	1114182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_017044	AT	3	6	1114199	1114204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_017044	ATTT	2	8	1114207	1114214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_017044	ATTA	2	8	1114263	1114270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_017044	GTT	2	6	1115583	1115588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_017044	ATT	2	6	1115605	1115610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_017044	TA	4	8	1115625	1115632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_017044	ATG	2	6	1115635	1115640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7133	NC_017044	TAT	2	6	1115790	1115795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7403	NC_017044	TTA	2	6	1170305	1170310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7442	NC_017044	TA	3	6	1183316	1183321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7443	NC_017044	TA	3	6	1183343	1183348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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